ADAP-METTL3轴通过m6A修饰Spry1调控巨噬细胞炎症反应的新机制

【字体: 时间:2025年10月08日 来源:Cell Death & Disease 9.6

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  本研究针对巨噬细胞炎症反应中m6A修饰的调控机制不明确问题,揭示了免疫衔接蛋白ADAP通过结合METTL3抑制其介导的Spry1 mRNA m6A甲基化,从而负向调控TLR4诱导的炎症反应。研究发现ADAP缺失会增强METTL3依赖的Spry1 m6A修饰(特定位点A6988),并通过读者蛋白IGF2BP2稳定Spry1 mRNA,进而激活NF-κB通路加剧炎症。该发现为脓毒症等炎症性疾病提供了新的治疗靶点。

  
巨噬细胞作为免疫系统中的重要哨兵,在机体抵抗感染和维持组织稳态中发挥着核心作用。当受到病原体侵袭时,巨噬细胞会迅速启动炎症反应,释放肿瘤坏死因子-α(TNF-α)、白介素-1β(IL-1β)等促炎因子来清除威胁。然而,这道防火墙一旦失控,过度的炎症反应反而会攻击自身组织,导致脓毒症、动脉粥样硬化等严重疾病。因此,精确调控巨噬细胞的炎症反应强度,一直是免疫学领域的关键科学问题。
近年来,RNA表观遗传修饰,特别是m6A(N6-甲基腺苷)修饰,被发现在免疫调控中扮演着重要角色。这种动态可逆的修饰如同给mRNA戴上一顶“小帽子”,由甲基转移酶(如METTL3复合体)“书写”,去甲基酶(如FTO、ALKBH5)“擦除”,并通过阅读蛋白(如YTHDFs、IGF2BPs)识别,进而调控mRNA的稳定性、翻译效率等命运。已有研究表明METTL3能促进巨噬细胞活化,但其具体靶点和调控机制,尤其是在炎症反应中的功能存在争议。
另一方面,研究团队前期发现,免疫衔接蛋白ADAP(Adhesion and degranulation-promoting adapter protein)在巨噬细胞中扮演着“刹车”角色——ADAP缺失会导致TLR4信号通路过度激活,引发强烈的炎症反应和M1型极化。一个有趣的科学问题随之产生:ADAP的抗炎作用,是否与m6A甲基化修饰存在交叉对话?两者如何协同调控巨噬细胞的炎症反应?
为回答这一问题,苏州大学刘贺斌教授团队开展了系统研究,发现ADAP能直接结合m6A甲基转移酶METTL3,抑制其介导的Spry1 mRNA甲基化修饰。ADAP缺失后,METTL3更活跃地催化Spry1转录本特定位点(CDS区A6988)的m6A修饰,并通过读者蛋白IGF2BP2增强其稳定性,导致SPRY1蛋白表达上调,进而激活NF-κB信号通路,最终加剧炎症反应。该研究不仅揭示了ADAP-METTL3-Spry1轴在脓毒症等炎症性疾病中的关键作用,也为靶向m6A修饰治疗炎症性疾病提供了新思路。相关研究成果发表于《Cell Death & Disease》。
研究团队综合运用了多种关键技术方法:通过条件性基因敲除小鼠模型(髓系特异性Mettl3敲除鼠、Adap全身敲除鼠及双敲鼠)进行体内功能验证;采用RNA免疫共沉淀测序(MeRIP-seq)与转录组测序(RNA-seq)联合分析筛选靶基因;利用免疫共沉淀(Co-IP)、免疫荧光和荧光素酶报告基因实验验证蛋白质相互作用及m6A位点功能;通过RNA稳定性检测、RIP-qPCR等技术分析m6A修饰对mRNA稳定性的影响;采用LPS诱导的脓毒症模型和盲肠结扎穿刺(CLP)模型评估炎症反应。
ADAP与METTL3在巨噬细胞质中相互作用
研究人员首先发现ADAP缺失并不影响m6A调控元件的表达水平,但通过免疫共沉淀实验证实ADAP能与METTL3直接结合,且这一相互作用在LPS刺激后增强。机制研究表明,ADAP通过其341-450氨基酸区域与METTL3的N端(1-389aa)特异性结合。免疫荧光显示,ADAP缺失促进METTL3向核内转移,提示ADAP可能通过滞留METTL3于胞质来抑制其功能。
METTL3缺失缓解ADAP缺陷巨噬细胞的过度炎症反应
为验证METTL3在ADAP缺失所致过度炎症中的作用,研究使用METTL3特异性抑制剂STM2457处理巨噬细胞,发现其可显著降低Adap-/-巨噬细胞中LPS诱导的TNF-α、IL-1β和IL-6表达。在RAW264.7细胞中敲低METTL3也获得类似结果,证实ADAP缺失引发的炎症增强依赖METTL3的甲基转移酶活性。
METTL3缺失减轻ADAP缺陷小鼠的炎症损伤
通过构建髓系特异性Mettl3敲除(cKO)及Mettl3/Adap双敲(dKO)小鼠,研究团队在体内验证了上述发现。在LPS诱导的脓毒症模型中,Adap-/-小鼠表现出更严重的肺、肝、肾组织损伤、更高水平的血清炎症因子及死亡率,而METTL3缺失可显著缓解这些表型。流式细胞术分析显示,dKO小鼠骨髓来源巨噬细胞中M1型极化(CD86+CD206-)比例较Adap-/-小鼠明显下降。盲肠结扎穿刺(CLP)模型也得到一致结论。
Spry1是METTL3-ADAP调控炎症反应的关键靶标
为寻找METTL3-ADAP轴的关键靶基因,研究人员对LPS刺激的WT和Adap-/-小鼠腹腔巨噬细胞进行MeRIP-seq和RNA-seq联合分析。筛选出4个同时发生m6A修饰和表达差异的基因(Pou3f1、Cish、Cd300lb、Spry1),其中Spry1的m6A修饰水平在ADAP缺失后显著升高。鉴于Spry1(Sprouty1)在炎症反应中的已知作用,研究选择其进行深入机制探索。
LPS诱导METTL3依赖的Spry1 m6A甲基化并被ADAP负向调控
IGV分析显示,LPS刺激可在Spry1 mRNA的CDS区诱导m6A修饰,且ADAP缺失使该修饰进一步增强。MeRIP-qPCR证实这一修饰依赖METTL3。通过生物信息学预测和点突变实验,研究鉴定出Spry1 CDS区的一个关键m6A位点A6988( motif GGACU)。荧光素酶报告实验表明,野生型METTL3而非催化突变体(D394A/W397A)能特异性增强含野生型m6A位点的Spry1报告基因活性。功能上,METTL3缺失或抑制可逆转ADAP缺失导致的Spry1 mRNA和蛋白表达上调。RNA稳定性实验证实METTL3通过延长Spry1 mRNA半衰期促进其表达。
IGF2BP2以m6A依赖方式稳定Spry1 mRNA
机制上,RIP-qPCR发现IGF2BP2而非IGF2BP1/3能特异性结合Spry1 mRNA。敲低IGF2BP2(而非IGF2BP1/3)可显著降低Spry1 mRNA的稳定性和表达水平,且这一效应在ADAP缺失细胞中更为明显。过表达IGF2BP2则进一步增强Spry1表达。重要的是,IGF2BP2对Spry1的结合依赖METTL3介导的m6A修饰,突变m6A位点可显著降低其结合能力。
SPRY1通过NF-κB通路维持Adap-/-巨噬细胞的过度炎症反应
功能挽救实验表明,敲低Spry1可显著抑制ADAP缺失巨噬细胞中LPS诱导的炎症因子产生和p65磷酸化(NF-κB通路激活)。相反,过表达Spry1则进一步加剧炎症反应,且在ADAP缺失背景下效应更强。这表明SPRY1是ADAP缺失导致NF-κB过度激活和炎症加剧的关键下游因子。
研究结论与讨论部分指出,本研究首次揭示了ADAP-METTL3-Spry1轴在调控巨噬细胞炎症反应中的核心作用。ADAP通过直接结合METTL3抑制其甲基转移酶活性,从而负向调控Spry1 mRNA的m6A修饰和稳定性。ADAP缺失时,METTL3介导的Spry1 m6A修饰增强,通过读者蛋白IGF2BP2稳定Spry1 mRNA,导致SPRY1蛋白表达上调,进而激活NF-κB通路,最终加剧炎症反应。该发现不仅阐明了m6A修饰在巨噬细胞炎症反应中的精细调控机制,也为脓毒症等炎症性疾病的治疗提供了新的潜在靶点——靶向METTL3-Spry1轴或可缓解过度炎症反应。
该研究的创新点在于发现了ADAP作为METTL3的新型调控因子,揭示了蛋白质相互作用如何精细调控m6A修饰的特异性靶向,并阐明了Spry1 m6A修饰在炎症中的新功能。未来研究可进一步探索ADAP是否通过类似机制调控其他m6A靶基因,以及该轴在其他炎症性疾病中的作用,为开发靶向m6A修饰的炎症治疗策略提供理论基础。
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