利用4F肽高分辨率解析真核膜蛋白结构:一种去垢剂替代方案及其在结构生物学中的突破
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时间:2025年10月08日
来源:Journal of Molecular Biology 4.5
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本研究提出了一种创新的无去垢剂膜蛋白 solubilization 方法,通过4F肽将真核膜蛋白有效包裹于纳米盘(4F-discs)中,显著提升冷冻电镜(cryo-EM)结构解析的分辨率与准确性,为膜蛋白功能机制研究提供重要技术支撑。
• 4F肽可高效 solubilize 真核膜蛋白并形成结构均一的纳米盘(4F-discs)
• 该方法避免了传统去垢剂对天然脂质环境的破坏,保留蛋白功能性
• 成功解析人源TRPC3离子通道高分辨率结构(cryo-EM)
• 技术普适性验证:适用于氧化酶(DUOX1-DUOXA1、NOX2-p22phox)及转运蛋白(URAT1、NTCP)
本研究开发了一种基于4F肽的真核膜蛋白 solubilization 策略,有效规避了传统去垢剂法的局限性。实验证明4F肽能 solubilize 多种关键膜蛋白(包括离子通道hTRPC3、膜整合氧化酶DUOX1-DUOXA1与NOX2-p22phox、转运蛋白URAT1和NTCP),并维持其结构完整性与功能性。通过将4F-discs转化为MSP包裹的纳米盘,可进一步提升样品均一性,支持高分辨率结构解析。该技术为膜蛋白研究提供了更贴近天然状态的实验体系。
Sf9昆虫细胞(Thermo Fisher Scientific)于27°C在SIM SF无血清培养基(Sino Biological)中培养。FreeStyle 293F悬浮细胞(Thermo Fisher Scientific)在含1%胎牛血清(FBS, VisTech)、67 μg/mL青霉素(Macklin)及139 μg/mL链霉素(Macklin)的FreeStyle 293培养基中,于37°C、6% CO2和70%湿度条件下培养。细胞系经定期检测确认为支原体阴性。
网格初筛在Talos Arctica电镜(Thermo Fisher Scientific,200 kV)搭配K2相机(Thermo Fisher Scientific)完成。高清数据在300 kV Titan Krios(Thermo Fisher)上采集,使用K2 Summit直接电子相机(Thermo Fisher Scientific)和20 eV狭缝宽度能量过滤器,放大倍数60,000×,像素尺寸0.834 ?,散焦范围-1.5至-1.8 μm。超分辨率影片(32帧/曝光)以10 e?/?2/s的电子剂量率采集,总曝光时间6秒。
hTRPC3模型基于已发表结构7DXB在Coot[52]中手动搭建,并通过PHENIX[53]进行优化。
数据处理与统计分析使用GraphPad Prism完成。统计细节详见方法说明与图注。冷冻电镜密度图全局分辨率基于0.143傅里叶壳相关准则[54]估算,局部分辨率通过cryoSPARC计算。独立实验次数(N)及相关统计参数(如均值、标准差)均于对应图表中注明。
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