基于乙酰氨基连接基的嘌呤/嘧啶衍生物靶向DNA受体位点的计算机与实验研究及其抗癌潜力探索

来自某研究团队的研究人员针对现有抗癌药物如多柔比星的结构局限性和副作用问题，开展了一项基于乙酰氨基连接基的嘌呤/嘧啶衍生物靶向DNA受体位点的研究。通过计算机辅助设计、ADMET筛选、分子对接和MD模拟等技术，发现化合物1和5与DNA具有稳定相互作用，其中化合物1表现出更强的结合亲和力和抗癌潜力（IC50=42.17?μM），为新一代抗癌药物设计提供了重要参考。

　　

科学家们通过计算机模拟（in silico）与体外实验（in vitro）相结合的方式，探究了全新设计的25种基于乙酰氨基连接基（acetamide linker）的嘌呤（purines）/嘧啶（pyrimidine）衍生物与DNA受体位点的相互作用机制。在完成ADMET性质筛选后，合成了编号4–9的化合物（其中1–3号取自文献），并进行了系统表征。

研究团队进一步对这些化合物与多种DNA受体位点展开分子对接分析（docking analysis），并与经典抗癌药多柔比星（doxorubicin）进行对比。结果显示，化合物1和5表现最为突出，其连接区经策略性修饰，显著提升了在DNA双链内的稳定性。

计算研究包括分子对接（molecular docking）和分子动力学模拟（MD simulations），深入解析了这些小分子与DNA的结构互作模式。特别值得注意的是，化合物1中的乙酰氨基（acetamide）在结合亲和力和沟槽适配中起到关键作用。与化合物5及多柔比星相比，化合物1能与两条DNA链维持更强且更稳定的相互作用，显示出其作为高效配体的潜力。

傅里叶变换红外光谱（FT-IR）进一步证实化合物1通过羰基频率降低实现了DNA嵌入（intercalation）。其IC₅₀值低至42.17?μM，凸显出卓越的抗癌潜力。

这项研究不仅提出了一种结构精细化的DNA受体靶向策略，也为设计具有优化治疗潜力的新一代抗癌药物提供了宝贵见解。