蜡样芽孢杆菌SBI_SS06_AR_BD全基因组测序及其α-淀粉酶与脂肪酶工业应用潜力解析
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时间:2025年10月09日
来源:Microbiology Resource Announcements 0.6
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来自孟加拉国的研究团队针对工业酶生产需求,完成了蜡样芽孢杆菌(Bacillus cereus)SBI_SS06_AR_BD菌株的全基因组测序。该研究解析了5.13 Mb基因组结构(GC含量35.15%),鉴定出1个α-淀粉酶基因和多个脂肪酶基因,为工业酶制剂开发提供了重要遗传资源。
蜡样芽孢杆菌(Bacillus cereus)是一种革兰氏阳性、杆状、产孢的土壤细菌,具有生产工业用酶的天然能力。本研究报道了分离自孟加拉国工业废水区的菌株Bacillus cereus SBI_SS06_AR_BD的全基因组序列。该基因组大小为5,132,550 bp,GC含量为35.15%,包含5,220个编码序列、27个tRNA基因和3个rRNA基因。
值得注意的是,该菌株能分泌稳定的胞外α-淀粉酶(alpha-amylase)和脂肪酶(lipase),这些酶在生物技术领域广泛应用于淀粉和脂质降解。其对环境条件(温度、pH、碱性环境)的强耐受性使其特别适合大规模发酵生产。
菌株分离自孟加拉国Hemayetpur的工业区土壤样本,通过营养琼脂培养基纯化、80°C热处理筛选耐热菌株,并经革兰染色、孢子染色、MYP选择性培养基培养及淀粉酶活性初步验证。基因组DNA采用Qiagen试剂盒提取,使用Illumina NextSeq 550平台进行双端测序(2×150 bp)。
数据质控和组装通过BV-BRC平台完成:采用Trim Galore进行读段修剪,Unicycler v0.4.8进行从头组装。基因组覆盖度达287×,组装获得39个contig(N50=241,419 bp,L50=7),质量评估显示一致性(99.7%)、完整性(100%)及零污染。注释通过NCBI PGAP流程完成,确认存在1个α-淀粉酶基因(1,356 bp)和多个脂肪酶基因(723/834/936/1,602 bp)。
该研究为工业酶生产的菌株选育和代谢工程改造提供了关键基因组学基础。
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