甲状腺激素驱动美洲牛蛙变态过程中组织特异性组蛋白丰度与修饰动态图谱揭示表观遗传调控新机制

本综述系统阐述了甲状腺激素（TH）依赖性两栖动物变态过程中，组蛋白变异体丰度与翻译后修饰（PTM）的全局性变化。通过质谱分析（MS/MS）技术，首次在自然 metamorphosis 模型中揭示组蛋白H1、H2A变异体及甲基化/磷酸化修饰的动态调控，为TH介导的发育重编程提供了表观遗传学新视角。

　　

Highlight

本研究首次采用非靶向质谱分析技术，揭示美洲牛蛙（Rana catesbeiana）在甲状腺激素（TH）驱动变态过程中多个组织的组蛋白变异体动态变化与修饰谱系，为TH介导的表观遗传调控机制提供全新见解。

Materials and methods

所有化学试剂均购自Sigma-Aldrich（加拿大安大略省），除非另有说明。

Results and Discussion

本研究首次实现自然TH依赖性两栖动物变态过程中组织特异性的组蛋白变异全局表征。观测到的组蛋白层面变化提示了与TH调控关键发育期相交汇的潜在表观遗传机制靶点。

Conclusion

本研究首次全面阐释了自然TH依赖性两栖动物变态过程中多组织内组蛋白组成的全局性变化。我们鉴定了在此胚胎后发育期显著改变的组蛋白变异体与推定修饰位点，绘制了可能与TH活性相关的组蛋白丰度与修饰协同变化路线图。

CRediT authorship contribution statement

Yassene Mohammed：评审编辑-方法学-形式分析

Haley Kuecks-Winger：评审编辑-原稿撰写-方法学-研究实施-形式分析-数据策管-概念化

Anita A. Thambirajah：评审编辑-督导-方法学-形式分析-概念化

Caren Helbing：评审编辑-督导-资源整合-项目管理-方法学-资金获取-形式分析

Data availability

血液、肝脏和尾鳍的PSM结果文件详见补充文件S1-S3。质谱蛋白质组学数据已通过PRIDE合作存储库（Perez-Riverol et al., 2025）提交至ProteomeXchange联盟，数据集标识符为PXD065774。

Acknowledgements

作者感谢维多利亚大学基因组BC蛋白质组学中心 staff 完成MS/MS分析。本研究由加拿大自然科学与工程研究理事会发现基金（RGPIN-2018-03816）资助CCH。数据分析部分由加拿大数字研究联盟支持CCH。图文摘要通过BioRender创建（Kuecks-Winger, H. (2025) https://BioRender.com/0ysbbbt）。