北大西洋冷水域海参Parastichopus tremulus线粒体与核基因组首次破译及其进化意义

来自北欧的研究人员针对冷水域海参基因组数据缺失的问题，完成了北大西洋重要物种Parastichopus tremulus的线粒体与核基因组（775 Mb）测序与组装，其核基因组BUSCO完整度达87.2%，为深海生物适应性进化研究提供关键数据支撑。

　　

北海参(sea cucumber)Parastichopus tremulus是分布于东北大西洋海底带（水深20至3000米）的重要棘皮动物，其地理范围北起巴伦支海南至加那利群岛。随着人们对新兴海参物种商业价值的兴趣日益增长，海参生物学研究也取得显著进展。近年来，热带海参的基因组数据陆续发布，但冷水域海参的基因组资源仍属空白。为填补这一知识缺口，本研究成功对P. tremulus的线粒体基因组和核基因组进行了测序与组装。线粒体基因组的大小和基因排列方式与刺参科（Stichopodidae）其他物种高度一致。核基因组组装总长度为775 Mb，测序覆盖深度为24倍，并通过BUSCO（Benchmarking Universal Single-Copy Orthologs）评估获得87.2%的完整度。