非洲猪瘟病毒MGF 505-9R/10R与I73R/I329L基因间区变异及其在基因分型中的标记作用研究

针对非洲猪瘟病毒（ASFV）基因分型与流行病学追踪的难题，来自俄罗斯的研究人员通过Sanger测序技术分析了129株俄罗斯ASFV分离株的I73R/I329L和MGF 505-9R/10R基因间区，成功鉴定出IGR-I/II和MGF-I/II/V等变异类型，并开发出区分基因I、II型与中越俄重组毒株的分子检测方法，为跨境疫病监控提供了关键分子标记，尽管其应用受限于跨区域同源重复序列自发突变现象。

　　

新一轮非洲猪瘟（African swine fever, ASFV）大流行的暴发，推动了针对国家级和国际级监测、控制及疾病管理替代性策略的开发。其中一种策略涉及分子流行病学方法的应用。由于ASFV基因II型分离株在I73R/I329L和MGF 505-9R/10R基因间区域中的串联重复序列（tandem repeats, TRs）具有高度遗传多样性，这些基因组标记被广泛应用于流行病学研究中。

在本研究中，研究人员采用Sanger测序技术，对2018–2022年间来自俄罗斯的129株ASFV分离株的I73R/I329L和MGF 505-9R/10R基因间区进行了分析。结果显示，在I73R/I329L区域中检出IGR-I（占3.1%）和IGR-II（占96.9%）两种变异类型；而在非翻译片段MGF 505-9R/10R中，则鉴定出MGF-I（95.3%）、MGF-II（3.9%）和MGF-V（0.8%）三种类型。

此外，基于对这些基因间区及B646L基因片段进行的PCR与Sanger测序，本研究提出了一种可区分ASFV基因I型、II型与正在中国、越南及俄罗斯东部流行的重组变异株的分子分型方法。

该研究证实，I73R/I329L与MGF 505-9R/10R基因间区可作为俄罗斯联邦边境地区ASFV流行病学监测的有效分子标记。然而，这些标记在病毒传播追踪中的应用价值可能受到一定限制，因为相同的TR插入事件可能在不同来源、地理上相隔遥远的欧亚地区分离株中自发出现，例如：IGR-III型同时出现于波兰和中国；IGR-IV型分布于波兰和越南；MGF-V型则同时存在于立陶宛和俄罗斯伏尔加格勒地区。