铁死亡主控开关GPX4作为泛癌精准免疫治疗通用生物标志物的发现与验证研究

【字体: 时间:2025年10月10日 来源:Frontiers in Oncology 3.3

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  本综述通过整合多组学数据与体外实验验证,系统揭示了谷胱甘肽过氧化物酶4(GPX4)作为铁死亡(ferroptosis)关键调控因子在33种癌症类型中的表达模式、预后价值及免疫微环境调控作用。研究表明GPX4具有显著的诊断价值(AUC>0.8),其表达与肿瘤突变负荷(TMB)、微卫星不稳定性(MSI)及免疫检查点分子显著相关,为开发靶向GPX4的泛癌种免疫治疗策略提供了重要理论依据。

  
引言
铁死亡是一种铁依赖性的程序性细胞死亡形式,由脂质过氧化、活性氧(ROS)累积和膜损伤触发。其调控异常与多种病理状态相关,包括组织缺血/再灌注损伤、神经退行性变和肿瘤发生。近年研究表明铁死亡可抑制多种癌症进展,化疗药物与铁死亡诱导剂联用能增强头颈癌、胰腺癌和胶质母细胞瘤的治疗效果。谷胱甘肽过氧化物酶(GPXs)家族通过还原脂质氢过氧化物和过氧化氢来保护机体免受氧化损伤,其中GPX4是唯一能还原磷脂氢过氧化物的同工酶,在抑制铁死亡中起核心作用。尽管GPX4在癌症中呈现双重作用(抑癌和促癌),但其在癌症生物学中的具体角色尚未完全阐明。
材料与方法
研究整合了TCGA、GTEx、cBioPortal、HPA、UALCAN和仙桃平台等多组学数据,采用系统生物信息学方法评估GPX4在33种癌症类型中的表达、预后意义、突变谱、DNA甲基化和肿瘤免疫微环境(TIME)浸润特征。通过Western blot、MTS法和EdU实验在AGS胃癌细胞系和SW480结直肠癌细胞系中进行功能验证。单细胞水平分析使用CancerSEA数据库,免疫浸润评估采用TIMER2.0和ESTIMATE算法,功能富集分析通过BioGRID和GEPIA2完成。
结果
GPX4在泛癌中的差异表达与诊断能力
TCGA数据分析显示GPX4在COAD、ESCA、HNSC等13种癌症中上调,在BRCA中下调。联合TCGA和GTEx数据证实GPX4在27种癌症中存在显著差异表达,其中ACC、COAD、GBM等24种癌症中表达上调,在BRCA、LAML和TGCT中下调。CPTAC蛋白质组数据验证了GPX4在肺癌中高表达、乳腺癌中低表达的转录水平趋势。免疫组化结果支持GPX4在结肠癌和肝癌组织中显著高表达。ROC曲线分析显示GPX4区分癌与正常组织的AUC值在THCA、KIRP等多癌种中超过0.8,结合GTEx数据后PAAD、LAML等癌种的AUC突破0.9。GPX4表达与ESCA、HNSC等癌种的疾病分期及HNSC、KIRC等癌种的肿瘤分级显著相关。
GPX4促进癌细胞增殖
功能实验证实GPX4过表达显著促进AGS和SW480细胞增殖(MTS法)及S期细胞比例增加(EdU实验),表明其在胃肠癌中发挥促癌作用。
GPX4的预后价值
Cox回归和KM生存曲线显示GPX4表达与BRCA、COAD等6种癌症的总生存期(OS)显著相关:高表达预示COAD、LAML和UVM预后不良,但预示BRCA、THCA和UCEC预后良好。在疾病特异性生存(DSS)分析中,GPX4高表达与STAD不良预后相关,与UCEC良好预后相关。无进展间隔期(PFI)分析显示GPX4高表达与ACC、STAD和UVM的不良预后相关。
GPX4遗传变异分析
cBioPortal数据显示SARC中GPX4突变率最高(约8%),以扩增为主;ACC、胶质瘤等以扩增为主导变异;OV和CESC则以深度缺失为主。共发现27种突变类型,错义突变最常见(18例),截短突变G174A/D可能是驱动突变。GPX4遗传改变与GBM患者总生存期改善相关,与HNSC患者DSS较差相关。
GPX4甲基化水平
UALCAN数据库分析显示LIHC、TGCT等11种癌症中GPX4启动子甲基化水平降低,PRAD、BRCA和PCPG中升高。TIDE数据库分析表明GPX4高甲基化与胶质瘤、PAAD和SKCM的OS改善相关,与HNSC和KIRC的OS较差相关。
单细胞水平表达特征
CancerSEA分析显示在NSCLC中GPX4表达与DNA损伤、细胞周期负相关,与转移、血管生成、炎症、上皮间质转化(EMT)和静息状态正相关;在UM中与静息、DNA损伤、凋亡等过程负相关。
GPX4与免疫浸润的关联
TIMER2.0算法显示GPX4表达与COAD、DLBCL等癌种的巨噬细胞浸润显著相关,在ESCA、HNSC-HPV-和SARC中与M2型巨噬细胞浸润正相关。GPX4表达还与ESCA、HNSC等癌种的癌症相关成纤维细胞(CAFs)、CESC和HNSC的中性粒细胞、HNSC-HPV+和TGCT的B细胞、HNSC-HPV+的CD8+ T细胞及HNSC的调节性T细胞(Treg)浸润相关。ESTIMATE算法显示GPX4表达与GBMLGG、SARC的免疫评分和基质评分显著正相关,与KIPAN的ESTIMATE评分负相关。
GPX4与免疫调节通路及检查点基因的相关性
GPX4表达与多数癌种的趋化因子(CXCL16、CCL28等)、MHC分子、免疫激活基因(HLA-A、HLA-B等)和免疫抑制基因(CD276等)显著相关,与VEGFB、TGFB1等关键免疫检查点分子密切关联。
GPX4与TMB和MSI的关联
GPX4表达与UCEC、LUAD的TMB正相关,与LAML、HNSC的TMB负相关;与UCEC、PRAD的MSI正相关,与GBMLGG的MSI负相关。
GPX4在免疫治疗队列中的价值
21个免疫治疗队列分析显示GPX4在10个队列中对免疫检查点抑制剂反应具有预测能力(AUC>0.5),在Gide 2019黑色素瘤队列中AUC达0.83,优于MSI评分、TIDE等指标。高GPX4表达与黑色素瘤免疫检查点抑制剂治疗患者的良好临床结局相关。
GPX4的蛋白互作网络与富集分析
BioGRID分析揭示了GPX4的相互作用网络。GO富集分析显示GPX4相关基因主要参与线粒体呼吸链复合物组装、电子传递链等生物过程,位于线粒体蛋白复合物、呼吸链等细胞组分,具有电子转移活性等分子功能。KEGG通路分析显著富集于亨廷顿病、肌萎缩侧索硬化、热生成、朊病毒病和氧化磷酸化通路,这些通路均与脂质过氧化过程相关,凸显GPX4在铁死亡中的核心地位。
讨论
癌症的高发病率和高死亡率使其成为全球健康重大威胁。铁死亡在清除肿瘤细胞和抑制肿瘤生长中起关键作用,GPX4作为铁死亡调控核心分子,其抑制或 destabilization 可触发铁死亡。本研究通过泛癌分析揭示了GPX4表达与预后、DNA甲基化、TMB、MSI、免疫调节基因和免疫细胞浸润的多维度关联。GPX4在多数癌组织中高表达,功能实验证实其促进胃肠癌细胞增殖,且表达与肿瘤分级和分期相关,表明其作为诊断生物标志物的潜力。GPX4在不同癌种中呈现相反预后价值(保护因素或风险因素),提示其癌症风险评估价值。GPX4表达异常部分源于启动子甲基化失调和基因突变,表观遗传调控机制(如HMGA2增强启动子区H3K4甲基化和H3K27乙酰化)可能参与其过表达过程。单细胞分析表明GPX4与DNA损伤、转移、血管生成等多种肿瘤功能状态相关。免疫微环境分析显示GPX4与M2巨噬细胞、CAFs等免疫细胞浸润显著相关,提示其可能通过调控免疫抑制性微环境促进肿瘤发生。GPX4与免疫检查点分子和TMB/MSI的关联进一步支持其作为免疫治疗生物标志物的潜力。研究局限性主要依赖于生物信息学分析,需更多癌种和大样本队列验证。综上所述,GPX4作为铁死亡主控开关,在泛癌层面展现重要临床意义和免疫调控价值,为其作为泛癌种治疗靶点和免疫治疗预测标志物提供了理论基础。
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