肾移植排斥中衰老巨噬细胞的鉴定与表征:跨物种多组学揭示其致病机制与治疗潜力

【字体: 时间:2025年10月10日 来源:Frontiers in Immunology 5.9

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  本研究通过整合临床队列、大鼠模型及跨物种单细胞转录组数据,首次鉴定肾移植排斥中应激诱导的衰老浸润巨噬细胞(SnIMs),揭示其通过NF-κB/Cebpb通路驱动衰老相关分泌表型(SASP)并介导T细胞炎症应答,证实SnIMs浸润水平与Banff病变分级及移植物存活显著相关,为靶向衰老免疫细胞改善移植预后提供新策略。

  
背景:同种异体移植排斥仍是影响移植物长期存活的主要障碍。细胞衰老(CS)参与移植物损伤,但免疫细胞衰老在排斥中的作用尚不明确。
方法:研究整合肾移植活检队列和年龄匹配大鼠移植模型的微阵列数据,通过免疫细胞浸润算法和组织病理学鉴定主要衰老免疫亚群,利用跨物种单细胞转录组学识别新型衰老浸润巨噬细胞(SnIMs)并在大鼠模型中验证,最后在肾移植数据集中评估SnIMs的临床价值。
结果:排斥移植物中CS基因集显著富集,且与移植物丢失和病理损伤相关。同种免疫反应放大应激诱导的衰老,其中p21+巨噬细胞成为重要的衰老免疫亚型。单细胞分析显示SnIMs表现出细胞周期阻滞、衰老相关分泌表型(SASP)上调,以及由NF-κB/Cebpb驱动的跨物种保守转录特征。这些细胞在排斥过程中沿伪时间轨迹积累,并通过CXCL趋化因子与效应T细胞相互作用。临床分析表明SnIMs浸润可预测T细胞介导的排斥(TCMR),并与Banff病变分级和不良移植物存活相关。
材料与方法:研究整合GEO数据库中肾移植转录组数据集,包括预后队列(GSE21374)和Banff队列(GSE98320)。单细胞数据涵盖小鼠和人类移植样本,采用Seurat进行质控、标准化和聚类分析。通过SenMayo和Martina衰老特征评分(SnCIT工具)鉴定衰老细胞,并结合细胞周期分析、差异基因表达和转录因子富集(Metascape)验证。动物模型采用SD-to-Wistar大鼠同种移植(Allo)和SD-to-SD同系移植(Syn),术后7天采集组织进行组织学(H&E、SA-β-gal染色)和分子分析(免疫荧光、IHC、RNA-seq)。统计采用R和GraphPad Prism,显著性阈值α=0.05。
结果1:肾移植排斥中的细胞衰老表型
临床队列分析显示排斥样本中CS基因集(如REACTOME: CELLULAR SENESCENCE、GOBP: CELL CYCLE ARREST)显著富集,且与常规排斥基因 panel(B-HOT)重叠度低,提示衰老机制独立于经典排斥通路。经典衰老标志物CDKN1A(p21)及SASP组分(IL1B、IL6、CCL2、CXCL1)在排斥组中上调,CS评分升高与移植物丢失风险相关。在Banff队列中,CS评分在TCMR和混合排斥样本中显著升高,且与间质炎症(i)、血管炎(v)、肾小管炎(t)等病变分级呈正相关。
结果2:应激诱导衰老在排斥中的加剧
年龄匹配大鼠模型排除供受体年龄和保存时间等混杂因素。同种移植组(Allo)表现出更严重的急性排斥损伤和衰老特征:SA-β-gal染色增强,Cdkn1a(p21)及SASP基因表达上调(而Cdkn2a/p16无显著变化),p21蛋白在肾小管周围区域富集。双标免疫荧光显示Allo组中p21+Cd45+免疫细胞显著增多,而p21+Lrp2+肾小管细胞无差异,表明衰老主要由浸润免疫细胞驱动。
结果3:巨噬细胞衰老是免疫衰老的核心组分
免疫浸润分析(ssGSEA)显示CS评分与效应免疫细胞(如CD4+ T细胞、CD8+ T细胞、NK细胞、巨噬细胞)浸润水平正相关,其中与M1巨噬细胞相关性最高(R=0.73)。实验验证显示Allo组中CD68+p21+巨噬细胞共定位显著增加,提示促炎M1巨噬细胞是重要的衰老免疫群体。
结果4:衰老巨噬细胞的跨物种鉴定
单细胞分析(小鼠和人类数据集)揭示浸润巨噬细胞(IMs)中存在Cdkn1a+ SnIMs亚群,表现为G1/S期细胞周期阻滞、衰老通路(如GOBP: SIPS、REACTOME: SASP)激活,以及特征基因上调:细胞周期抑制剂(Cdkn1a、Cdkn1b、Gadd45b)、SASP组分(Cxcl10、Il1b、Cxcl2)、抗凋亡因子(Bcl2a1b)和衰老表面标记(Icam1、Cd274/PD-L1、Plaur/uPAR)。转录因子预测提示NF-κB家族(Nfkb1、Rela、Ikbkb)和Cebpb为关键调控因子。跨物种保守签名(14个基因)在人类样本中验证,且与体外M1极化巨噬细胞的瞬时激活模式不同,支持SnIMs的特异性衰老状态。大鼠模型的多重免疫荧光证实Cd68+p21+uPAR+Nfkb+衰老样巨噬细胞位于血管周围和肾小管间质区域,形态增大且不规则,SnIMs签名基因在Allo组中表达上调。
结果5:衰老巨噬细胞的动态积累与细胞互作
Cytotrace2和Monocle2轨迹分析显示SnIMs分化潜能降低且聚集于轨迹末端,表明其在排斥进程中逐渐积累。CellChat分析发现SnIMs与管状上皮细胞通过Mif-(Cd74+Cd44)和Spp1-(Itga4+Itgb1)轴招募至肾小管周围,并通过CXCL9/CXCL10-CXCR3和CXCL16-CXCR6途径与CD4+/CD8+ T细胞相互作用,维持炎症微环境。该互作模式在小鼠和人类数据集中均保守。
结果6:SnIMs浸润的临床意义
临床队列中SnIMs高浸润与移植物存活率降低显著相关(p<0.0001),且在TCMR和混合排斥中富集程度更高(AUC=0.78)。SnIMs水平与Banff病变评分(i、v、t、ci、ct)呈阶梯式正相关,提示其可作为急性/慢性移植物损伤的生物标志物和治疗靶点。
讨论:肾移植中细胞衰老受多种因素影响(如年龄、缺血再灌注损伤、alloimmunity),本研究聚焦排斥与衰老的交互作用。同种免疫反应作为应激源加剧IRI initiated衰老进程,其中巨噬细胞易受“DAMP-衰老”循环影响(DAMP-TLR通路激活SASP,SASP组分刺激DAMP释放,DAMP放大炎症和排斥),形成自放大环路。SnIMs通过抗凋亡(BCL-2家族)和免疫检查点(PD-L1)实现持久存活,并通过SASP(尤其CXCL趋化因子)招募T细胞,介导急慢性损伤。靶向清除衰老细胞(如ABT-263)可能改善移植预后。研究局限性包括衰老诱导通路在TCMR/AMR中的差异未阐明、SnIMs与T细胞互作机制需实验验证,以及衰老签名与炎症激活部分重叠的问题。
结论:研究证实应激诱导的SnIMs在肾移植排斥中具有关键致病作用,其跨物种保守特征和临床关联性为开发衰老靶向治疗提供了新视角。
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