JinhuaNSICU:首个面向神经外科重症的单中心双语开放数据库及其临床研究价值

《Scientific Data》:JinhuaNSICU, an open accessible Neurosurgical Intensive Care Database

【字体: 时间:2025年10月10日 来源:Scientific Data 6.9

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  本研究团队为解决神经外科重症数据资源受限、亚洲人群代表性不足及关键手术麻醉信息缺失等问题,开发了JinhuaNSICU数据库。该数据库收录了2014–2023年间8,773例患者、20,530次住院的完整临床数据,涵盖多模态信息如手术麻醉、药物治疗、微生物培养和生命体征等。数据库支持回顾性分析与机器学习建模,显著促进神经外科疾病研究、临床决策支持工具开发与国际数据共享。

  
神经外科重症监护(Neurosurgical Intensive Care Unit, NSICU)是救治颅脑损伤、脑肿瘤、脑血管病等危重患者的关键单元,其临床数据的高质量积累与共享对提升诊疗水平、推动医学研究具有重要意义。然而,长期以来,神经外科领域缺乏高质量、开放式的临床数据库,尤其是来自亚洲人群的数据更为稀缺。现有的国际数据库如MIMIC-IV(美国)、N2QOD(美国)等虽具规模,但大多限于特定国家或医院使用,且数据覆盖病种有限,缺乏针对神经外科手术麻醉、中药治疗等特色信息的系统记录。这种数据资源的不足严重限制了相关疾病机制研究、临床预测模型构建以及医疗人工智能应用的发展。
在这一背景下,来自浙江大学医学院附属金华医院、浙江大学医学院附属第二医院、中国人民解放军总医院等机构的研究团队联合构建了JinhuaNSICU数据库——一个单中心、中英双语、开放获取的神经外科重症监护数据库,相关成果已于2025年发表在《Scientific Data》。该数据库收录了2014年至2023年间共8,773名患者的20,530次住院记录,涵盖 demographics(人口统计学)、实验室检查、生命体征、手术麻醉、药物治疗、微生物培养、影像检查与报告等丰富维度。超过26%的患者拥有三次以上住院记录,支持长期纵向研究,为神经外科疾病的临床科研提供了前所未有的数据基础。
研究团队通过多个关键步骤实现数据的提取、清理与整合。首先,从医院Research Collaboration Platform (RHP) 中提取多系统集成数据,包括HIS(医院信息系统)、LIS(实验室管理系统)、EMR(电子病历)、ORIS(手术室信息系统)与PACS(影像存档与通信系统)。随后进行严格的数据清洗,处理错误值、重复记录和不一致内容,并实施去标识化操作,删除所有个人隐私信息,时间信息也统一为相对于入院时间的偏移分钟数。最终数据以CSV格式存储,并借鉴MIMIC-IV的命名规范,确保了数据结构的通用性与可复用性。
JinhuaNSICU共包含18张关系表,每张表均以subject_id(患者ID)和hadm_id(住院ID)作为主键。核心数据表包括:
  • basic_info_operation_anesthesia:记录10,653次手术麻醉的基本信息;
  • diagnosis:涵盖213,627条诊断记录,含ICD-10编码与诊断状态;
  • drug_operation_anesthesia:术中用药记录,共7,998次手术;
  • drug_sensitivity:药物敏感性试验,包括MIC(最小抑菌浓度)与药敏结果;
  • examination:检查项目与报告,覆盖208,173条记录;
  • herbal_medicine:特色中药用药记录,共1,325次诊疗事件;
  • laboratory_test:超过767万条实验室检验结果;
  • medical_record_front_page:病历首页信息,包括入院科室、出院状态等;
  • medication:药物治疗订单,涵盖药品名称、类型与用药时间;
  • microbiology_culture:微生物培养结果;
  • operation:手术记录;
  • orders:医嘱信息;
  • vital_signs:生命体征监测数据,包括体温、血压、SpO2(血氧饱和度)等。
通过与国际主流数据库MIMIC-IV(美国)和INSPIRE(韩国)的对比,JinhuaNSICU显示出其独特优势与研究价值。该数据库中患者中位年龄为60岁,男性占比较高,中位住院时长达15.7天,医院死亡率为5.4%。多项疾病分布与欧美人群存在显著差异:颅脑创伤患者比例最高,而高血压、缺血性脑血管病、动脉瘤等则在MIMIC-IV中更常见。此外,JinhuaNSICU中多次入院患者比例高达48%,远超其他数据库,为研究疾病复发、长期疗效提供了宝贵资源。
综上所述
综上所述,JinhuaNSICU作为目前全球规模最大的神经外科重症开放数据库之一,不仅填补了亚洲人群相关临床数据空白,还首次系统整合了手术麻醉、中药治疗等特色信息。其高质量、多模态、跨疗程的数据资源为后续研究提供了丰富素材,有望促进神经外科疾病预测模型、临床决策支持系统(Clinical Decision Support System, CDSS)以及国际合作观察分析的发展。该数据库已公开发布于China National Center for Bioinformation(国家生物信息中心,OMIX编号OMIX011033),相关数据处理代码亦开放于GitHub,支持全球学者下载使用。
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