珙桐高光胁迫响应机制新见解:转录组解析ROS与热应激通路在水分调控下的差异化激活

【字体: 时间:2025年10月10日 来源:Scientific Reports 3.9

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  本研究针对珍稀濒危植物珙桐(Davidia involucrata Baill.)对高光胁迫的分子响应机制不明确的问题,通过转录组测序与生物信息学分析,揭示了其在不同土壤湿度与空气湿度条件下响应高光胁迫的关键通路。研究发现:湿润土壤中珙桐主要通过激活活性氧(ROS)相关通路响应高光胁迫,而干旱土壤中则依赖热应激响应通路;空气加湿可抑制MAPK信号通路激活,缓解氧化损伤。该研究为珙桐保育及抗逆栽培策略提供了理论依据。

  
珙桐(Davidia involucrata Baill.)作为中国特有的珍稀濒危植物,被誉为“植物界的大熊猫”,其对环境胁迫高度敏感,尤其是高光胁迫严重制约其生长发育。然而,其响应高光胁迫的分子机制尚不明确。同时,珙桐自然分布区多雾潮湿的环境提示空气湿度可能在其胁迫响应中扮演重要角色。为解析这些科学问题,研究人员在《Scientific Reports》发表了题为“Transcriptome analysis reveals novel insights into the mechanisms of Davidia involucrata Baill. response to high-light stress”的研究论文,系统揭示了珙桐响应高光胁迫的分子通路及湿度调控机制。
研究主要采用了转录组测序与生物信息学分析技术。实验样本为来自陕西平利县千家坪林场珙桐国家良种基地的2年生幼苗,经陕西理工大学移栽培育后,于2023年8月进行多因子处理实验。通过设置不同光照(充足光照SL与遮荫LL)、土壤湿度(充足ASM与限制RSW)及空气加湿(F与NF)组合,构建了4个对比组(Group_A至Group_D)。利用DESeq2软件进行差异表达基因(DEGs)筛选(|logFC|>2, P<0.05),并通过主成分分析(PCA)评估样本区分度。基于珙桐自定义注释数据库(通过eggNOG-MAPPER平台构建),进行GO与KEGG富集分析、基因集富集分析(GSEA)、基因相关性网络构建(Cytoscape)及分子对接(AutoDock与SWISS-MODEL)。
差异表达基因鉴定与功能富集分析
通过转录组分析,Group_A(SL_ASM vs LL_ASM)与Group_B(SL_RSW vs LL_RSW)分别鉴定出788与735个DEGs。PCA显示基于DEGs的表达谱,实验组与对照组明显区分。两组共享183个重叠基因,富集分析表明这些基因显著参与“响应活性氧(ROS)”、“响应热胁迫”、“响应光强度”等生物过程,以及类黄酮生物合成等KEGG通路。
GSEA揭示湿度调控的应激通路差异化激活
GSEA分析发现,在湿润土壤条件下(Group_A),珙桐主要通过“响应过氧化氢”(response to hydrogen peroxide)与“响应活性氧”(response to reactive oxygen species)通路应对高光胁迫;而在干旱土壤条件下(Group_B),则优先激活“响应热”(response to heat)与“热驯化”(heat acclimation)通路。这表明土壤湿度显著影响珙桐的应激策略选择。
关键基因网络与分子对接验证
从上述通路中提取21个持续上调基因构建相关性网络,发现Dinv14422、Dinv44528、Dinv35255、Dinv17401与Dinv22790为核心基因。分子对接表明,脱落酸(ABA)与水杨酸(SA)均可与这些基因编码的蛋白稳定结合,其中ABA与Dinv14422(注:10 kDa chaperonin, mitochondrial-like)结合能最低(-6.78 kcal/mol),提示ABA可能通过调控Dinv14422增强珙桐高光适应性。
空气加湿缓解高光与复合胁迫的分子机制
通过分析Group_A、Group_B与Group_C(SL_ASM_F vs SL_ASM_NF)的共享DEGs,发现9个基因在高光胁迫下上调但在加湿条件下下调,其中Dinv42070与Dinv38748参与MAPK信号通路,表明加湿可能通过抑制MAPK通路激活减轻氧化损伤。在复合胁迫(高光+干旱)条件下(Group_D),非加湿组显著上调“吲哚化合物生物合成过程”(indole-containing compound biosynthetic process)等次级代谢通路,而加湿处理抑制这些通路激活,证实空气加湿可降低胁迫强度。
该研究系统阐明了珙桐响应高光胁迫的核心分子机制:土壤湿度调控ROS与热应激通路的差异化激活,空气加湿通过抑制MAPK通路与次级代谢缓解胁迫损伤。发现的关键基因(如Dinv14422)与植物激素(ABA、SA)的互作机制为未来抗逆育种提供了靶点。研究结果不仅对珙桐保育具有指导意义,也为其他珍稀植物应对环境胁迫提供了理论借鉴。局限性包括未实时监测微环境变量(如风速、CO2浓度),未来需结合多组学验证基因功能。
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