整合多组学揭示FOSL2-COL8A1-EMT调控轴驱动结直肠癌进展的新机制

本研究通过整合多组学分析发现，转录因子FOSL2直接激活COL8A1表达，进而诱导上皮间质转化（EMT）程序，促进结直肠癌（CRC）的侵袭转移。该研究不仅揭示了FOSL2-COL8A1-EMT这一新型调控轴在CRC进展中的关键作用，还为晚期CRC提供了潜在预后标志物（COL8A1）和治疗靶点。

　　

¹Bioinformatics analysis and machine learning modeling

公开转录组数据集来自癌症基因组图谱（TCGA-COAD，含480个肿瘤和41个正常组织）和基因表达汇编（GEO）数据集GSE32323与GSE23878。TCGA原始计数数据采用DESeq2方差稳定变换进行标准化，GEO芯片数据则通过"limma"和"affy"R包进行RMA与分位数标准化。当存在批次效应时，使用"sva"包进行评估和消除。

²Cross-cohort integrative transcriptomic analysis identifies a robust and consistent set of differentially expressed genes in colorectal cancer

为系统解析CRC相关转录组改变，我们整合分析了两个独立GEO数据集：GSE32323（肿瘤n=25；正常n=24）和GSE23878（肿瘤n=24；正常n=35）。采用严格标准（校正p值<0.05且|log₂折叠变化|>1.5），我们分别鉴定各数据集的差异表达基因（DEGs），并通过系列可视化和统计验证确保结果可靠性。

³Discussion

本研究系统阐明了COL8A1在结直肠癌（CRC）中的致癌作用，并发现了一条新颖调控轴：FOSL2驱动的COL8A1转录激活通过调控EMT促进肿瘤侵袭能力和体内肿瘤生长（图7）。通过跨队列转录组筛选、整合机器学习优先排序、多组学关联分析和功能验证，我们确认COL8A1是一个先前未被充分认识的EMT效应分子和致癌驱动因子。