淡水贝类橄榄蛏蚌盐度与氨氮胁迫应答中谷胱甘肽S-转移酶家族的全基因组解析
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时间:2025年10月10日
来源:Comparative Biochemistry and Physiology Part D: Genomics and Proteomics 2.2
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本研究通过基因组学技术系统鉴定了橄榄蛏蚌(Solenaia oleivora)中29个GST基因家族成员,揭示其进化保守性与多样性特征。研究发现盐度(2.2‰)和氨氮(10 mg/L)胁迫下不同亚型SoGSTs在鳃和肝胰腺中呈现特异性表达模式,为阐明软体动物环境适应机制提供了重要理论依据。
Identification of GST genes in S. oleivora
通过隐马尔可夫模型(HMM)和Blastp双重筛选策略,从橄榄蛏蚌基因组中成功鉴定出29个GST基因家族成员。这些基因分布在12条染色体上,并存在6次串联重复事件,表明基因复制在家族扩张中起关键作用。
Identification, physicochemical properties, and subcellular location of GST genes in S. oleivora
29个SoGSTs的编码序列长度跨度达360 bp至1296 bp,其编码蛋白的分子量范围为13.57 kDa至49.52 kDa,等电点(pI)呈现显著差异。系统进化分析将其划分为13个功能亚类,包括Alpha(1)、Delta(1)、Mu(2)、Omega(2)、Pi(2)、Rho(2)、Sigma(7)、Theta(2)、MAPEG(4)、EF1Bγ(1)、Metaxin(3)、mPGES(1)和GDAP(1)。基因结构与共线性分析揭示了该家族的进化保守特性与多样性并存。
GST家族作为广泛存在于动植物中的多功能酶系,其基因组成具有物种特异性。本研究在橄榄蛏蚌中发现的29个GST成员与其他无脊椎动物(如太平洋牡蛎和福寿螺)的数量特征相符。不同亚类GSTs在结构域组成、基因结构及保守基序方面既呈现类内保守性,又展现类间差异性,暗示其功能分化可能与环境适应密切相关。表达谱分析表明,盐度胁迫特异性下调鳃组织中SoGSTS4/5/6、SoGSTA和SoMGST1B的表达;而氨氮胁迫则引起鳃部SoGSTS6、SoGSTO1、SoGSTT2和SoMGST1A的下调,同时激活肝胰腺中SoGSTO2和SoGSTS7的表达。这种组织特异性调控模式提示不同GST亚型在应对多元环境胁迫中可能承担特异性的生物学功能。
本研究首次完成橄榄蛏蚌GST基因家族的系统性鉴定与分类,明确串联复制是驱动该家族扩张的主要机制。表达模式分析揭示SoGSTA、SoGSTS4/5/6等关键成员在盐度和氨氮应激响应中可能发挥核心作用,为深入解析软体动物环境适应机制提供了分子理论基础。
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