苦苣苔科Leptoboeinae亚族网状进化历史与新属Crassicaulis的系统发育基因组学研究

为解决苦苣苔科Leptoboeinae亚族属间界限模糊的分类难题，研究人员通过转录组数据构建低拷贝核基因数据集，结合质体基因组对66个样本进行系统发育分析。研究发现Boeica属为多系类群，并揭示其内部存在两次杂交事件，同时确立新属Crassicaulis。该研究为东亚季风驱动植物多样化提供了关键证据。

　　

针对苦苣苔科（Gesneriaceae）Leptoboeinae亚族长期存在的属级分类界限模糊问题，研究团队利用代表性类群的转录组数据构建了低拷贝核基因（LCN）数据集。通过对66个样本的质体基因组和LCN基因进行联合分析，揭示了该亚族的系统发育结构、网状进化历程及分化时间。系统发育分析首次证实Boeica属为多系类群，并发现新属Crassicaulis，该属与亚族内其他类群构成姐妹群关系。研究检测到显著的细胞核-质体冲突现象和属级节点的基因树不一致性，通过多证据链证实该支系存在两次网状进化事件：Boeica porosa与B. stolonifera的杂交事件，以及Boeica enpingensis形成过程中的杂交事件。分化时间估算表明主要属级分化发生于17-12^?Ma（百万年前）的中新世中期。本研究不仅构建了高分辨率系统发育框架，还提出东亚季风强化是该类群多样化的关键驱动因素。