源于香茶菜属的松香烷激活PKC-δ:计算机辅助设计、人血清白蛋白相互作用及稳定性评估揭示其抗结肠癌潜力

【字体: 时间:2025年10月11日 来源:Chemistry & Biodiversity 2.5

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  本刊推荐:本研究通过计算机辅助设计(in silico)构建了新型松香烷衍生物库,靶向蛋白激酶C-δ(PKC-δ)以开发抗结肠癌疗法。研究揭示了先导化合物7α-乙酰氧基-6β-羟基罗伊兰酮(Roy 1)与人血清白蛋白(HSA)的相互作用机制,证实其具有中等结合亲和力(Ka = 6.5 × 104 M?1)并能显著提升HSA热稳定性(Tm升高4.5°C)。通过分子对接和分子动力学(MD)模拟筛选出最优候选物16(含甘氨酸修饰),其在水相介质(pH 7.4, 37°C)中展现卓越稳定性,为基于罗伊兰酮的靶向治疗提供了创新策略。

  

1 引言

癌症仍是全球主要健康挑战。蛋白激酶C(PKC)家族在肿瘤发生和转移扩散中起关键作用,其中PKC-δ被广泛表征为促凋亡和抗增殖激酶,但在肺癌、胰腺癌和肝癌等模型中会促进治疗抵抗。人血清白蛋白(HSA)作为一种高效药物载体,具有疏水结合口袋、游离巯基和表面暴露末端等结构特征,适用于多种治疗剂的靶向递送,并能通过受体介导的转运机制促进药物在肿瘤或炎症组织中的积累。
植物是新型生物活性化合物的宝贵来源。香茶菜属(Plectranthus)植物富含松香烷型萜类化合物,具有抗菌、抗肿瘤、抗炎、抗糖尿病和抗氧化等多种生物活性。其中,从大齿香茶菜(P. grandidentatus)中分离得到的松香烷二萜7α-乙酰氧基-6β-羟基罗伊兰酮(Roy 1)对多种癌细胞系表现出显著抗增殖活性,其C6和C12位的羟基可修饰性使其成为药物开发的理想支架。

2 结果与讨论

2.1 PKCδ-C1结构域的分子对接研究

本研究采用分子对接技术筛选靶向PKC-δ的新型罗伊兰酮衍生物。使用与佛波醇-13-乙酸酯(PA)共结晶的PKC-δ-C1结构域(PDB ID:1PTR)作为受体模型,通过FRED、GOLD和AutoDock三种程序比较,FRED在重现PA晶体构象方面表现最佳。基于Roy 1的C6和C12羟基修饰,设计了19种取代基(S1-S19),涵盖简单酰基、脂肪链、芳香苯甲酰基、电子给体/受体、间隔基团、大体积脂肪/芳香族和杂环等类型,以探索与PKC-δ调节域的相互作用。
筛选发现,同时衍生化两个羟基仅有一个化合物(7α,6β-二乙酰氧基-12-O-乙酰罗伊兰酮)效果良好,表明保留至少一个游离羟基可能对结合亲和力重要。独立修饰结果显示,C6位酯化比C12位获得更好对接评分,C6可耐受直链、杂环和苯环等多样取代基(化合物2-8),而C12衍生物则偏好脂肪链或含杂原子芳香环(化合物9-15)。为改善水溶性,在最佳化合物2的C12位引入氨基酸(脯氨酸、甘氨酸、丙氨酸、色氨酸和天冬氨酸),其中甘氨酸衍生物(化合物16)形成四个氢键(与Gly253、Gln257和Met238),预测结合亲和力最强。

2.2 化合物16的分子动力学模拟

通过500 ns显式溶剂无约束MD模拟验证化合物16的结合模式。聚类分析显示94.9%的帧属于最集中簇,其代表结构与PA晶体构象高度相似,直接与Gly253和Gln257形成氢键,并通过水桥与Met239骨架结合。RMSD计算表明PKC-δ/16复合物构象稳定,结合模式可靠。

2.3 HSA与Roy相互作用的荧光分析

在模拟生理条件下研究Roy 1与HSA的相互作用。配体结合导致蛋白质固有荧光浓度依赖性猝灭,发射最大波长从342 nm蓝移至333 nm。通过猝灭数据确定结合常数为6.5 × 104 M?1(37°C),属于中等强度,与多数结合于HSA亚域II的抗癌药物相当。同步荧光显示Roy 1更接近Trp-214残基,对Tyr残基荧光影响较小。热变性实验表明复合物熔点比单独HSA平均升高4.5°C(8.2%),说明Roy 1结合稳定了HSA结构。结果表明Roy 1与HSA在亚域IIA(Sudlow位点I)结合,提示HSA可作为其系统循环的合适载体蛋白。

2.4 体外抗氧化能力

通过DPPH、ABTS、NO、TAOC、ORAC和HORAC六种方法评估Roy 1的抗氧化能力,并与维生素C和Trolox对比。Roy 1抗氧化能力较低(比标准抗氧化剂弱7-10倍),仅在NO清除实验中与维生素C活性相近。具体数据为:DPPH IC50 >1.5 mM,ABTS IC50 ~1.3 mM,NO IC50 0.800 mM,TAOC EC50 >2.0 mM,ORAC TE值0.178,HORAC TE值0.142。

2.5 Roy 1在水相介质中的稳定性评价

在PBS(pH 7.4, 37°C)中评估Roy 1的稳定性。由于水溶性差,使用乙腈(ACN, 17%)或DMSO(10%)作为共溶剂。HPLC-DAD检测(270 nm)显示,0.1 mM浓度下40天内无降解;0.4 mM浓度下第2天即出现峰减少,尤其在PBS/DMSO中更明显,但无新峰出现,表明损失由沉淀而非分解引起。沉淀重溶解后确认仅为Roy 1。两种酯衍生物RoyBz(7α-乙酰氧基-6β-苯甲酰氧基-12-O-苯甲酰罗伊兰酮)和Roy12Bz(7α-乙酰氧基-6β-羟基-12-O-苯甲酰罗伊兰酮)在相同条件下也保持稳定,未检测到酯水解。结果表明Roy 1在测试范围内(0.1–0.4 mM)化学稳定,沉淀倾向由低溶解度造成。

3 结论

本研究通过计算机辅助设计针对PKC-δ的新型罗伊兰酮衍生物,发现C12位脂肪族取代和C6位多样官能团修饰有助激活PKC-δ,化合物16为最有前景候选物。Roy 1与HSA结合显示中等亲和力,主要位点近Trp-214,且增强HSA热稳定性。稳定性实验证实Roy 1在pH 7.4和37°C下40天内完全稳定,酯衍生物亦无水解,支持其作为稳定先导化合物开发靶向疗法的潜力。

4 实验部分

4.1 通用方法

HSA(Sigma-Aldrich A1887)浓度用ε280 = 35 700 M?1 cm?1测定。Roy 1溶于DMSO,HSA测量在50 mM磷酸缓冲液(pH 7.4)中进行,DMSO终浓度不超过1%。

4.2 植物材料

大齿香茶菜栽培于里斯本Tapada da Ajuda植物园,凭证标本保存于ISA标本馆。

4.3 提取与分离

参考Isca等人方法:茎叶干燥粉碎后丙酮超声提取,硅胶干柱色谱分离(Hex:AcOEt和AcOEt:MeOH梯度洗脱),Roy 1通过Hex重结晶获得。

4.4 PKC-δ理论衍生物的分子对接

使用1PTR.pdb晶体结构,FRED软件进行对接,结合口袋依据Bessa等定义,VIDA绘制结构,PyMol可视化。

4.5 分子动力学模拟

AMBER18软件,ff14SB力场(蛋白)和GAFF(小分子),TIP3P水模型,Cl-中和电荷。先能量最小化溶剂和溶质,加热至300 K(2 ns),密度平衡(2 ns),最后500 ns生产轨迹。CPPTRAJ分析轨迹。

4.6 荧光光谱测量

FluoroMax-4光谱仪,1 cm光径池,37°C。HSA固定1 μM,Roy 1浓度0–14 μM。内在荧光激发280 nm,发射290–450 nm。同步荧光Δλ = 15 nm(Tyr)和60 nm(Trp)。结合常数通过修正荧光强度计算,热稳定性通过F330/F350比值随温度变化测定,熔点(Tm)为曲线拐点。

4.7 抗氧化能力

六种方法测定:DPPH、ABTS、NO、TAOC、ORAC和HORAC,与Trolox和维生素C对比。IC50或EC50表示活性,ORAC和HORAC结果以Trolox当量(TE)表示。

4.8 Roy水相稳定性评价

Roy 1、RoyBz和Roy12Bz在PBS(pH 7.4)含ACN(17%)或DMSO(10%)中孵育(37°C),HPLC-DAD监测(270 nm)。色谱柱Eclipse XDB-C18,流动相甲醇-乙腈-0.3% TFA水溶液梯度洗脱,流速1 mL/min,柱温29°C。通过校准曲线定量。
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