性激素结合球蛋白单体与雌二醇、二氢睾酮和睾酮复合物的量子生物化学表征及其分子机制研究

【字体: 时间:2025年10月11日 来源:The Journal of Steroid Biochemistry and Molecular Biology 2.7

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  本文通过分子对接、分子动力学和量子力学计算,揭示了性激素结合球蛋白(SHBG)与三种性激素(EST/DHT/TES)的结合机制,发现SHBG::DHT结合亲和力最高,并关键残基SER42、PHE67等为药物靶点设计提供了新方向。

  
亮点
SHBG、雌二醇、二氢睾酮和睾酮的获取与制备
SHBG与EST和DHT结合的三维构象从蛋白质数据库(PDB)中获取,编号分别为1LHU(分辨率1.80??)和1D2S(分辨率1.55??)。未解析残基通过SWISS-MODEL服务器建模,锌和糖基化未包含在模型中。
分子对接分析
类固醇激素与SHBG的对接分数相似(图2)。EST识别出三种结合模式,DHT四种,TES五种,均占据高亲和力结合位点,结合能范围分别为?11.6至?9.0?kcal·mol?1、?11.2至?9.2?kcal·mol?1和?11.4至?9.1?kcal·mol?1。与晶体结构相比,EST和DHT的顶级对接位置高度一致,而TES因缺乏结构数据而呈现多样结合模式。
讨论
SHBG是男性生殖系统疾病和代谢紊乱的潜在药物靶点及生物标志物。通过晶体学、分子动力学和MMGBSA等多种技术,SHBG与类固醇激素的结合已得到广泛研究。本研究首次应用量子力学深入揭示了SHBG与DHT、EST和TES的结合机制,发现SHBG::TES在结构和能量上与SHBG::EST和SHBG::DHT高度相似。量子计算显示结合亲和力顺序为:SHBG::DHT > SHBG::EST > SHBG::TES。关键残基SER42、PHE67、MET107和MET139表现出最低相互作用能,突显了它们在SHBG耦合和激素运输中的核心作用。
结论
本研究通过整合分子对接、经典分子动力学和量子力学方法,理论探讨了SHBG单体与DHT、EST和TES三大类固醇激素的结合相互作用。结果证实分子 docking 能可靠复现实验验证的结合姿态,尤其对DHT和EST。量子力学分析进一步揭示了结合亲和力差异及关键残基贡献,为靶向SHBG的药物发现提供了新见解。
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