生发中心介导的B细胞应答拓宽:SARS-CoV-2加强免疫后的交叉中和抗体演化
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时间:2025年10月11日
来源:Science Immunology 16.3
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本研究针对SARS-CoV-2变异株逃逸疫苗保护力的难题,通过分析接种二价mRNA-1273.214(WA1/BA.1)加强疫苗的个体淋巴结生发中心(GC)B细胞应答,发现记忆B细胞(MBC)被优先招募至GC并经历亲和力成熟,产生广谱中和抗体mAb-52。该抗体利用公共克隆型IGHV3-66,靶向RBD的I/II类表位,对包括XEC在内的多种奥密克戎亚型均具强中和活性,揭示了GC反应在塑造交叉免疫中的关键作用,为优化疫苗策略提供理论依据。
随着SARS-CoV-2病毒的持续变异,奥密克戎(Omicron)等变异株的出现显著降低了基于原始毒株(WA1/2020)的mRNA疫苗的保护效果。尽管加强针接种可暂时提升抗体水平,但其对变异株的中和能力仍会随时间衰减。关键问题在于:加强免疫所提供的保护究竟依赖于召回已有的记忆B细胞(Memory B Cell, MBC),还是能激活新的 na?ve B细胞以产生针对变异株的特异性应答?此外,生发中心(Germinal Center, GC)作为B细胞抗体多样化和亲和力成熟的关键场所,其在加强免疫后如何影响B细胞应答的广度,尚不明确。为了解答这些问题,Malladi等人对接种了二价mRNA加强疫苗(同时编码原始株和Omicron BA.1株刺突蛋白的mRNA-1273.214)的个体进行了深入研究,相关成果发表在《Science Immunology》上。
研究人员招募了9名健康成年人,他们此前均已接种三剂针对WA1/2020的mRNA疫苗。在接种第四剂二价加强疫苗(mRNA-1273.214)后,研究团队在多个时间点采集了参与者的外周血样本,并在第8周通过超声引导下的细针穿刺(Fine Needle Aspiration, FNA)获取了引流淋巴结(axillary lymph nodes)样本。研究综合运用了流式细胞术、单细胞RNA测序(scRNA-seq)、B细胞受体(BCR)测序、单克隆抗体(mAb)制备与功能验证(包括ELISA、假病毒/真病毒中和实验)、深度突变扫描(Deep Mutational Scanning, DMS)以及冷冻电镜(cryo-EM)结构分析等关键技术。
Bivalent mRNA-1273.214 booster vaccination induces robust B cell responses
(二价mRNA-1273.214加强疫苗接种诱导强烈的B细胞应答)
疫苗接种后,所有参与者外周血中均检测到针对WA1和BA.1刺突蛋白(S+)的IgG浆母细胞(Plasmablasts, PB)反应,并且血浆抗S蛋白IgG滴度显著升高。在第8周,大部分参与者的淋巴结FNA样本中检测到了S+的生发中心B细胞(GC B cells)和淋巴结浆细胞(LNPCs),表明疫苗成功在淋巴器官中诱导了抗原特异性B细胞反应。
Bivalent booster vaccination recruits extensively cross-neutralizing clones into the GCs
(二价加强疫苗接种将广泛交叉中和的克隆招募入生发中心)
对淋巴结B细胞进行scRNA-seq和BCR分析发现,绝大多数(77.8%)的GC B细胞克隆产生的单克隆抗体能结合WA1 S蛋白,其中37.8%靶向受体结合域(RBD)。重要的是,60.2%的WA1 RBD结合抗体能交叉结合BA.1、BQ.1.1和XBB.1.5等变异株的RBD。克隆追踪分析显示,这些GC B细胞主要来源于 recalled MBC,而非新激活的 na?ve B细胞。研究人员从这些克隆中筛选出了一种名为mAb-52的抗体,它能有效中和所有测试的SARS-CoV-2毒株,包括最新的XEC变异株。体细胞高频突变(Somatic Hypermutation, SHM)分析表明,mAb-52的广谱中和能力依赖于其在GC中积累的突变。
GC B cell–derived mAb-52 protects hamsters from EG.5.1 challenge
(生发中心B细胞来源的mAb-52保护仓鼠免受EG.5.1攻击)
在仓鼠模型中,预先给予mAb-52能显著降低EG.5.1变异株攻击后上、下呼吸道中的病毒RNA载量和感染性病毒滴度,证明了其体内保护效力。
mAb-52 belongs to public clonotype IGHV3-66 * 02 and targets the class I/II RBD epitope
(mAb-52属于公共克隆型IGHV3-66 * 02并靶向I/II类RBD表位)
mAb-52使用了公共克隆型(public clonotype)IGHV3-66 * 02。竞争实验表明它与ACE2受体以及已知的I类中和抗体竞争结合RBD。通过DMS技术,研究人员确定了mAb-52在RBD上的关键逃逸位点。
Cryo-EM structure defines a conserved spike RBD epitope targeted by mAb-52
(冷冻电镜结构解析了mAb-52靶向的保守刺突蛋白RBD表位)
通过冷冻电镜解析了mAb-52的Fab片段与XBB.1.5 S蛋白三聚体的复合物结构,分辨率达2.58 ?。结构显示,mAb-52结合在RBD的I/II类表位,其结合界面与ACE2的结合位点高度重叠,并通过大量氢键(包括与主链原子的相互作用)实现其广谱结合能力。
本研究揭示了SARS-CoV-2二价mRNA加强疫苗主要通过召回并重塑已有的记忆B细胞库来发挥作用,这些细胞在生发中心经历进一步的筛选和亲和力成熟,从而产生能够中和多种变异株的抗体,如mAb-52。这种GC介导的B细胞应答拓宽,是加强免疫后产生交叉保护性免疫的关键机制。尽管疫苗配方中包含变异株抗原,但GC反应仍以针对原始株的回忆应答为主导。研究强调了生发中心在应对病毒变异、塑造广泛免疫屏障中的核心地位。鉴定出的广谱中和抗体mAb-52展示了其作为潜在预防或治疗药物的前景。该研究为理解疫苗如何诱导交叉免疫以及未来疫苗设计(包括针对其他快速变异病原体的疫苗)提供了重要的见解。
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