集成电解富集微芯片技术实现超快速灵敏mRNA检测
【字体:
大
中
小
】
时间:2025年10月11日
来源:Research 10.7
编辑推荐:
本研究针对当前mRNA检测方法存在的化学提取流程复杂、mRNA易降解等瓶颈问题,开发了一种电解-富集集成微流控芯片(EEMC)。该技术通过电驱动物理方法实现了全血中mRNA的快速高效提取,整个流程仅需10分钟,回收效率达90%-95%,结合环介导等温扩增(LAMP)技术,为mRNA快速处理检测提供了强大解决方案,在辐射暴露模型中对关键mRNA生物标志物(BAX、CDKN1A、GADD45A)的成功验证,推动了床旁精准诊断的发展。
信使RNA(mRNA)作为遗传信息与生物功能之间的关键桥梁,其检测在基因表达分析、疾病诊断和精准医疗中扮演着重要角色。然而,mRNA的高度不稳定性成为可靠检测的主要障碍——内源性RNase可在细胞裂解后数分钟内导致mRNA快速降解。更棘手的是,传统mRNA提取方法(如TRIzol法)依赖有毒化学试剂,需要繁琐的多步纯化程序,耗时长达1.5至3小时。这些复杂流程不仅增加操作风险,还可能导致mRNA损失或降解,特别是低浓度mRNA的丢失,严重影响下游精确定量检测的准确性。即使使用RNase抑制剂,高内源性RNase活性仍常导致快速降解。此外,残留的苯酚或盐离子可能抑制逆转录酶或Taq聚合酶活性,导致扩增失败。
为突破这些技术瓶颈,研究人员在《Research》上报道了一种创新解决方案——电解-富集微流控芯片(EEMC)。该平台采用电驱动物理方法,实现直接从全血中超快速、高效提取mRNA,无需使用可能抑制下游分析的化学试剂。
研究团队通过整合微加工技术、多物理场仿真和生物分子检测方法,建立了完整的芯片设计、优化和验证体系。关键技术方法包括:微流控芯片的计算机数控(CNC)加工与紫外(UV)胶键合技术;基于COMSOL Multiphysics的流体动力学和电场分布仿真;电解裂解条件的系统优化(电压10-50V,时间5-25s);离子浓度极化(ICP)富集参数的精确调控(电场强度50-250V/cm);以及环介导等温扩增(LAMP)反应条件的优化(温度60-65℃,时间10-30min)。临床样本来源于中国人民解放军总医院提供的28例人体血液样本,通过不同剂量(0、1、2、8 Gy)辐射处理建立辐射暴露模型。
EEMC采用三层结构设计,集成三个功能单元:电解细胞(绿色区域)负责细胞裂解,电富集细胞(紫色区域)实现mRNA浓缩,LAMP检测细胞(黄色区域)完成最终分析。芯片尺寸为90毫米×25毫米×2毫米,包含2个并行电解通道和4个并行富集模块,通过金电极提供电解和电富集所需功率。COMSOL Multiphysics模拟显示,流道内电场强度约为400V/cm,电解细胞关键区域场强稳定在375V/cm,完全满足高效细胞裂解要求。
研究表明,在0.8毫米宽微流道中,细胞死亡率随电压升高和处理时间延长而增加。在30V电压下,10秒内近100%细胞裂解,qPCR检测显示此时循环阈值(Ct)最低(16.79),表明核酸提取效率最高。毛细管电泳比较显示,电解法产生的100-1,000bp目标片段占比达65.1%,显著高于试剂法的24.8%。在不同白细胞浓度(101至107细胞)下,电解法均显示出比商业试剂盒更高的检测灵敏度。
基于动态离子浓度极化(dICP)原理,EEMC重新设计了富集区尺寸,在保持所需场强的同时实现低工作电压下的快速电富集。荧光显微镜观察发现,150V/cm场强下富集效果最优,4个并行富集模块表现一致(P ≥ 0.05)。与商业试剂盒相比,电富集法在所有目标基因(BAX、CDKN1A、GADD45A、GAPDH)上均获得更低Ct值,富集效率达92%-98%,损失率仅为1.5%-7.5%。
通过11组LAMP引物筛选,确定65℃为最佳反应温度,20分钟为最佳反应时间。灵敏度测试表明,EEMC-based LAMP可可靠检测102拷贝/毫升及以上浓度的样本,质粒浓度对数与Tq值之间存在明显线性关系。RNA质粒检测性能与DNA质粒高度一致,确认系统对RNA样本具有高灵敏度和可靠定量能力。
在辐射暴露模型中,BAX、CDKN1A和GADD45A表达水平随辐射剂量增加而上升,GAPDH表达保持稳定。EEMC在10分钟内完成处理,检测结果与商业试剂盒一致:0Gy时目标基因低表达;1-2Gy时荧光强度逐渐增加;8Gy时BAX达峰值而其他基因趋于稳定。目标基因/GAPDH比值分析显示,BAX/GAPDH与辐射剂量呈线性相关,CDKN1A/GAPDH和GADD45A/GAPDH在排除8Gy数据后也呈现线性关系。
这项研究开发的EEMC平台通过电驱动物理方法取代传统化学处理,克服了当前mRNA提取方法的基本局限性。其超快速处理能力(较传统技术快6倍)为临床决策提供关键支持,高完整性mRNA回收(效率90%-95%)确保诊断准确性,无有害化学试剂的操作体现环境友好性,从研究到床旁环境的广泛适用性展现巨大应用潜力。该技术将mRNA检测成本从每次约2美元显著降低至0.5美元以下,为大规临床模筛查提供可行方案,在精准医学和个性化医疗领域具有重要推广价值。
生物通微信公众号
生物通新浪微博
今日动态 |
人才市场 |
新技术专栏 |
中国科学人 |
云展台 |
BioHot |
云讲堂直播 |
会展中心 |
特价专栏 |
技术快讯 |
免费试用
版权所有 生物通
Copyright© eBiotrade.com, All Rights Reserved
联系信箱:
粤ICP备09063491号