基于RNA感知与ADAR编辑的乙型肝炎病毒报告系统开发及其应用研究

【字体: 时间:2025年10月11日 来源:Journal of Virology 3.8

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  本综述介绍了一种创新的HBV-RADARS报告系统,该系统通过感知HBV RNA并依赖ADAR1介导的A-to-I RNA编辑激活报告基因表达,克服了传统重组HBV报告病毒复制能力受损的局限。该系统兼容多种报告蛋白(如荧光素酶、抗生素抗性基因),可在转染、整合转录本表达及真实HBV感染等多种细胞模型中定量反映HBV RNA水平,为高通量筛选抗HBV化合物及宿主因子提供了全新平台。

  
乙型肝炎病毒(HBV)感染的持久性主要归因于病毒共价闭合环状DNA(cccDNA)在感染肝细胞核内的长期存在。尽管现有核苷(酸)类似物能有效抑制病毒复制,但功能性治愈仍难以实现。传统HBV报告病毒因基因组紧凑性(3.2 kb)和重叠开放阅读框的限制,插入报告基因常导致病毒复制能力下降,且仅支持单轮感染。为突破此技术瓶颈,本研究基于可重编程腺苷脱氨酶作用于RNA传感器(RADARS)技术,开发了不干扰病毒生命周期的HBV RNA感知报告系统。
靶点选择与传感器优化
研究团队首先在HBV基因型D RNA中系统扫描了66个ADAR可编辑位点(5′-CCA-3′对应传感器中的5′-TAG-3′),通过共转染HBV RNA表达质粒(pHBV1.3)与含高斯荧光素酶(Gluc)报告基因的RADARS构建体,评估各靶点的编辑效率。结果显示,最优靶点位于HBx开放阅读框内的1570–1716区域(C1643位点)。进一步通过6 nt间隔的传感器长度梯度测试(51–171 nt),发现141 nt传感器(互补于HBV RNA 1573–1713区域)可产生最高且最稳定的Gluc激活倍数(22.4倍),因此被选为原型HBV-RADARS。
机制验证与特异性分析
通过构建传感器序列反向的HBV-RADARS-Rev及组成型表达对照HBV-RADARS-On,证实报告系统激活严格依赖传感器与靶RNA的特异性杂交。RT-qPCR及高通量测序显示,靶RNA存在时传感器区域A-to-I编辑率提升30倍。跨基因型测试发现,尽管不同基因型(A、B、C)的HBsAg表达量更高,但原型传感器(基于基因型D)仍因序列完全匹配而呈现最强激活,凸显序列互补性对ADAR编辑效率的关键影响。
ADAR1依赖性验证
在内源性ADAR1 p110亚型表达的HepG2-NTCP-C4细胞中,ADAR1 siRNA敲低可剂量依赖性降低报告系统激活,而过表达野生型ADAR1(非编辑活性突变体E912A)则显著增强Gluc信号。值得注意的是,ADAR1过表达虽提升灵敏度,但会导致靶RNA非依赖性背景信号增强,提示内源性ADAR水平已足够支撑系统功能。
RNA水平定量关联与免疫应答评估
梯度稀释靶RNA表达质粒(pCMV-HBV2.1)的实验表明,Gluc激活水平与HBV RNA含量呈正相关。在稳定表达HBV转录本的HepG2.2.15细胞中,RNA去稳定剂RG7834处理可同步降低HBV RNA及报告信号。尽管RADARS机制涉及双链RNA形成,但转染或感染条件下均未检测到显著IFN-β诱导,可能与ADAR编辑本身抑制天然免疫应答及肝癌细胞dsRNA感应缺陷有关。
真实感染模型应用
在HBV感染(5,000 GE/细胞)的HepG2-NTCP-C4细胞中,报告系统显示16倍Gluc激活,且可被进入抑制剂MyrB完全阻断或RG7834部分抑制。感染组传感器编辑率提升约2倍(0.18%至0.36%)。将报告基因替换为GFP或嘌呤霉素抗性基因(Puror)后,系统成功实现感染细胞可视化及药物筛选:感染后施加嘌呤霉素可有效富集HBc阳性细胞(存活率5%–10%),为遗传筛选提供可能。
技术优势与优化方向
相较于传统重组病毒报告系统,HBV-RADARS具有三大优势:不干扰病毒复制周期、支持多类型报告蛋白灵活设计、构建流程简便。当前系统在感染模型中灵敏度仍受限于cccDNA低拷贝数及核内转录空间隔离,未来可通过优化传感器二级结构预测、引入多重终止密码子调控翻译阈值进一步提升信噪比。
综上,HBV-RADARS作为一种活细胞报告平台,为剖析HBV-宿主互作机制、筛选新型治疗靶点提供了强大工具,有望推动慢性乙型肝炎功能性治愈策略的开发。
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