极端嗜盐菌Salinibacter ruber M31T全基因组与甲基化组图谱揭示其与古菌的趋同进化

本研究报道了从西班牙马略卡盐田结晶池分离的极端嗜盐细菌Salinibacter ruber M31T的基因组和甲基化组特征。研究人员利用单分子实时测序技术，解析了其3.6 Mbp的基因组结构（包含一条3.55 Mbp染色体和一个35.5 kbp质粒），揭示了其酸性蛋白质组（含2,962个蛋白）及古菌样特征，为理解嗜盐生物的适应性进化及天体生物学研究提供了重要模型。

　　

在西班牙马略卡岛的盐田结晶池中，科学家们发现了一种神奇的极端嗜盐细菌——Salinibacter ruber菌株M31^T。这种革兰氏阴性菌不仅能在高盐环境中茁壮成长，还展现出与嗜盐古菌惊人的相似特征，成为研究趋同进化的绝佳模型。

通过先进的单分子实时测序技术，研究人员成功绘制了该菌株的完整基因图谱。结果显示其基因组大小为3.6兆碱基对，包含一条环状染色体和一个名为pSR35的质粒。更令人惊讶的是，在这个GC含量高达66.1%的基因组中，编码着2,962个蛋白质，这些蛋白质整体呈现酸性特征，平均等电点仅为5.61——这正是极端嗜盐生物的典型标志。

深入分析发现，Salinibacter ruber M31^T的基因组中藏着许多古菌的"遗传印记"。研究人员鉴定出两个古菌样感官视紫红质、一个盐视紫红质和一个黄视紫红质，以及4个光解酶和50个转座酶。这些发现强烈暗示了该菌株与古菌之间可能发生了大规模的水平基因转移事件。系统发育分析进一步证实，某些转运蛋白基因确实与古菌亲缘关系更近，而非其他细菌。

除了基因组成，研究还首次揭示了该菌株的DNA甲基化模式。科学家们发现了两个m6A甲基化模体：GATA₆CTC和CAGCA G，并成功将前者与一个I型甲基化酶基因对应。这些表观遗传标记为了解该菌的基因调控机制提供了新线索。

这项研究不仅为理解生命在极端环境下的适应策略提供了宝贵资料，也为探索地外生命可能的存在形式提供了重要参考。Salinibacter ruber M31^T的基因组和甲基化组数据已存入GenBank数据库，供全球研究者进一步探索。