综述:斑马鱼吗啉寡核苷酸敲低技术:研究线粒体疾病意义未明变异功能影响的一种工具

【字体: 时间:2025年10月12日 来源:NeuroMolecular Medicine 3.9

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  本综述系统阐述了利用斑马鱼(Danio rerio)模型结合吗啉寡核苷酸(Morpholino Oligonucleotides, MOs)瞬时敲低技术,对线粒体疾病(Mitochondrial Diseases, MDs)中意义未明变异(Variants of Unknown Significance, VUS)进行功能验证的策略。通过MO敲低与野生型/突变型mRNA共注射的拯救实验,可有效评估变异致病性,为连接基因组数据与临床实践提供了有力工具。

  
Abstract
斑马鱼(Danio rerio)作为一种重要的脊椎动物模型,因其胚胎透明、发育迅速、与人类基因高度保守等特点,已成为研究人类疾病,特别是线粒体疾病(Mitochondrial Diseases, MDs)的有力工具。线粒体疾病是一类高度异质性的多系统紊乱,可由核DNA或线粒体DNA(mtDNA)的遗传缺陷引起。尽管新一代测序技术(Next-Generation Sequencing, NGS)极大地扩展了与这些疾病相关的变异数量,但其中许多变异仍被归类为意义未明变异(Variants of Unknown Significance, VUS),其临床意义和致病性尚不明确,这给患者的精确诊断和治疗带来了巨大挑战。
吗啉寡核苷酸(Morpholino Oligonucleotides, MOs)是一种反义寡核苷酸,可通过与靶基因的mRNA结合,特异性阻断其翻译或剪接,从而在斑马鱼早期发育阶段实现基因的瞬时敲低(Knockdown)。这种方法能够快速模拟由基因功能缺失引起的病理表型,为研究基因功能提供了便捷途径。在MDs研究中,MO诱导的敲低能够重现关键的疾病表型,例如线粒体功能障碍、能量代谢异常、神经元缺陷或心脏发育异常等,从而为推测某个VUS可能导致的生物学后果提供体内(in vivo)证据。
然而,单纯的敲低表型尚不足以直接确认特定氨基酸改变(即VUS)的致病性。为了更精确地进行功能评估,研究人员开发了拯救(Rescue)实验策略。该策略的核心在于共注射MO与体外转录的mRNA。具体而言,研究人员会设计并合成两种mRNA:一种是编码野生型(Wild-Type)蛋白的mRNA,另一种是携带待研究VUS的突变型(Mutant)mRNA。实验通常分为三组进行对比:MO单独注射组(产生 morphant 表型)、MO与野生型mRNA共注射组、以及MO与突变型mRNA共注射组。
如果某个VUS是致病性的,预期的实验结果将是:共注射野生型mRNA能够有效弥补MO敲低造成的基因功能缺失,使斑马鱼胚胎的表型恢复正常或显著改善;而共注射该突变型mRNA则无法实现表型拯救,morphant 表型依然存在。这种“功能丧失-功能回补”的实验逻辑,为判定VUS的致病性提供了强有力的功能学证据。这种方法已经成功地将一些先前功能未知的基因与MDs联系起来,并帮助重新分类了许多意义不明的变异。
综上所述,基于MOs的敲低与拯救实验相结合的策略,在斑马鱼模型中构建了一个强大而多功能的平台,用于解决MDs研究中的功能基因组学问题。它有效地弥合了基因组数据与临床行动之间的鸿沟,为VUS的功能诠释和验证提供了宝贵工具,最终有助于缩短患者的诊断历程(Diagnostic Odyssey)。
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