AIF1L作为铁死亡相关生物标志物在微卫星不稳定结直肠癌中的作用:多组学分析揭示其功能与诊断价值
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时间:2025年10月12日
来源:HUMAN MUTATION 3.7
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本文推荐一篇关于微卫星不稳定(MSI)结直肠癌(CRC)中细胞死亡相关基因标志物的研究。作者通过整合TCGA和GEO数据库的转录组数据,结合加权基因共表达网络分析(WGCNA)和单细胞测序,鉴定出5个与预后相关的基因(POU4F1、AIF1L、SLC18A1、INSL4、HOXC6)。研究重点揭示了AIF1L通过调控铁死亡(ferroptosis)相关通路(如FACL4/GPX4轴)和免疫细胞浸润(如CD8+T细胞)影响MSI CRC进展,为免疫检查点抑制剂(ICIs)疗效预测提供了新靶点。实验验证表明,抑制AIF1L可降低细胞增殖和迁移能力,提示其作为预后生物标志物和治疗靶点的潜力。
引言
结直肠癌(CRC)是全球癌症相关死亡的第二大原因,其发病机制与微卫星不稳定(MSI)密切相关。MSI-H型CRC因高突变负荷和免疫细胞浸润对免疫检查点抑制剂(ICIs)敏感,但仅约40%患者获益。本研究旨在探索MSI CRC中细胞死亡与免疫微环境的关联,通过多组学分析寻找新的预后标志物。
材料与方法
研究从TCGA和GEO数据库获取MSI CRC患者的转录组和临床数据,采用差异表达分析、WGCNA和Cox回归筛选基因。通过单细胞测序、免疫浸润分析和体外实验(如细胞增殖、迁移和铁死亡标志物检测)验证基因功能。动物模型采用异位移植评估基因在体内的作用。
结果
差异表达基因与功能富集
在MSI-H与MSS组间鉴定出1432个差异表达基因(DEGs),功能富集显示这些基因参与细胞死亡相关通路(如"中性粒细胞胞外陷阱形成")和免疫调节。
风险模型构建与验证
通过WGCNA筛选出2588个MSI与细胞死亡相关基因(MSI-CDRGs),与DEGs交集后得到744个基因。进一步分析确立包含POU4F1、AIF1L、SLC18A1、INSL4和HOXC6的五基因风险模型。该模型在TCGA训练集(AUC >0.6)和外部验证集(GSE29621)中均能有效区分高危和低危患者,高危组总生存期显著缩短。
铁死亡与基因关联
风险评分与细胞死亡类型相关性分析显示,铁死亡评分在高危组中差异最显著。AIF1L和HOXC6与铁死亡正相关,且AIF1L在MSI-H组表达上调。GSEA提示AIF1L参与"癌症通路"和T细胞激活等免疫相关通路。
肿瘤微环境与免疫特征
高危组肿瘤纯度较低,免疫细胞浸润(如记忆B细胞、Th17细胞)活跃。AIF1L与单核细胞标记基因(如IL10RA)及铁死亡驱动基因(如FACL4)正相关,与抑制基因(如GPX4)负相关。尽管低危组免疫检查点基因(PD-1、CTLA-4)表达更高,但TIDE评分显示高危组可能更受益于ICIs,提示MSI CRC免疫应答的复杂性。
单细胞解析与CNV分析
单细胞数据将细胞分为11类,上皮细胞在肿瘤中比例最高。AIF1L在肿瘤上皮细胞中表达显著升高,且CNV推断显示非整倍体细胞富集于干细胞样TA细胞亚群,该类细胞与成纤维细胞通讯增强,可能促进肿瘤进展。
实验验证AIF1L功能
在MSI-H细胞系(如MC38)中敲低AIF1L后,细胞增殖(CCK-8/Edu实验)和迁移(划痕实验)能力下降。同时,铁死亡标志物FACL4表达降低,GPX4和GSH水平升高,MDA含量下降,表明AIF1L通过促进铁死亡驱动肿瘤发展。动物实验中,MSI-H小鼠肿瘤组织内AIF1L和FACL4表达更高,GPX4较低,进一步支持上述结论。
讨论
五基因模型为MSI CRC预后提供了新工具,其中AIF1L作为铁死亡的关键调节因子,可能通过影响脂质过氧化和免疫细胞功能(如CD8+T细胞活化)调控肿瘤进展。尽管AIF1L在甲状腺癌和乳腺癌中显示抑癌作用,但在MSI CRC中呈现促癌特性,提示其功能具有组织特异性。研究局限性包括缺乏前瞻性临床验证,未来需结合多组学与人工智能技术深化机制探索。
结论
AIF1L通过铁死亡通路调节MSI CRC的发展,可作为预后生物标志物和免疫治疗潜在靶点。本研究为优化MSI CRC个体化治疗提供了理论依据。
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