北海单室有孔虫(Monothalamous Foraminifera)的DNA宏条形码技术:海洋油气平台环境监测的生物指示新范式
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时间:2025年10月12日
来源:Marine Environmental Research 3.2
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本研究通过环境DNA(eDNA)宏条形码技术,首次系统评估北海油气平台周边单室有孔虫(Monothalamids)作为生物指示剂的潜力。研究发现foram-gAMBI指数与重金属(Ba、Zn、Cu)、总烃(THC)显著相关(r=0.74-0.92, p<0.05),较传统大型底栖动物AMBI和线虫gAMBI更具敏感性,为海洋生态质量状态(EcoQS)评估提供了新标准。
我们的研究揭示了北海单室有孔虫在环境DNA数据集中的绝对优势地位,并首次验证其多样性随离平台距离增加而显著上升的规律。通过校准的foram-gAMBI指数与多种污染物呈现高度相关性,为海洋生态健康评估提供了突破性工具。
底栖有孔虫是栖息于海洋沉积物中的单细胞真核生物,具有极其多样的外壳(即test)形态和分类组成。它们的高多样性、对环境变化的敏感性、快速繁殖周期和广泛分布特性,使其成为评估海洋生态系统生态质量状态(EcoQS)的卓越生物指示剂(Frontalini和Coccioni, 2011; Sch?nfeld等, 2012; Bouchet等, 2020; O’Brien等, 2021)。
2018年5月(DANF18)和2021年6月(DANF21),我们在由道达尔能源丹麦公司(TEEPDK)运营的北海DANF平台周边采集了表层沉积物样本(图S1)。样本沿四个轴线在距平台100米、250米、750米、1500米和3000米处采集。参考站位分别设在距平台10公里(Ref1和Ref2)和50公里(RefSo,仅DANF18有)处。在每个站位,采集了三份表层沉积物子样本。
经过生物信息学和过滤处理,我们获得了1,237个有孔虫ASV(扩增子序列变体),代表了7,702,956条高质量测序读数。ASV的长度范围在101至421 bp之间,平均序列长度为292 bp。DANF18保留了1,136个ASV(代表4,837,943条读数),而DANF21保留了943个ASV(代表2,865,013条读数)。两次采样事件共享了大量ASV(图S2),整体数据集中有882个ASV,并且在某些站位共享率高达75%。
我们的研究证实了单室有孔虫(monothalamids)在有孔虫宏条形码数据集中的主导地位,这与之前在河口(Singer等, 2023)、峡湾(Caridi等, 2021; Nguyen等, 2023)和人类活动影响区域(Damasceno等, 2024; O'Brien等, 2024)等浅水环境中的发现一致。这类有孔虫在传统的监测研究中仍然被严重忽视,因为这些研究基于形态学分类,并且只关注硬壳类群(Sch?nfeld等, 2012)。
我们的研究证明了单室有孔虫作为生物指示剂在环境监测,特别是在基于环境DNA(eDNA)的生态质量状态(EcoQS)评估中的巨大潜力。通过分析北海某海上平台站点两年的有孔虫宏条形码数据,我们确认了单室类在这些数据集中的主导地位,并揭示了它们对人为影响的敏感性。foram-gAMBI指数的开发和应用显示出与各种污染物(包括金属和碳氢化合物)的强相关性,突显了其在海洋环境健康评估中的有效性和敏感性。
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