靶向ATM-TRMT10A-BRCA1轴:为去势抵抗性前列腺癌PARP抑制剂治疗提供新型合成致死策略

【字体: 时间:2025年10月12日 来源:SCIENCE ADVANCES 12.5

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  本研究针对缺乏BRCA1/2突变的转移性去势抵抗性前列腺癌(mCRPC)患者对PARP抑制剂(PARPi)响应有限的临床难题,揭示了ATM磷酸化TRMT10A(Ser28)并通过USP10稳定化的新机制,证明靶向USP10-TRMT10A-BRCA1轴可诱导同源重组修复缺陷(HRD),显著增强PARPi疗效,为拓展PARPi受益人群提供了创新性的联合治疗策略。

  
前列腺癌是全球男性癌症相关死亡的第五大原因,而转移性去势抵抗性前列腺癌(metastatic castration-resistant prostate cancer, mCRPC)是其最致命的阶段。尽管针对雄激素受体(AR)通路的治疗(如恩杂鲁胺或阿比特龙)最初有效,但耐药性几乎不可避免,导致患者预后极差,中位总生存期仅31至36个月。因此,开发针对mCRPC的新型靶向治疗策略迫在眉睫。
聚(ADP-核糖)聚合酶抑制剂(PARP inhibitors, PARPis)通过“合成致死”机制选择性杀死同源重组修复(Homologous Recombination Repair, HRR)缺陷的癌细胞,如携带BRCA1或BRCA2突变的肿瘤。基因组研究表明,20-30%的转移性前列腺肿瘤存在DNA损伤反应(DNA Damage Response, DDR)基因(如BRCA1、BRCA2和ATM)的改变,使它们对PARPis敏感。然而,BRCA1/2缺陷仅占mCRPC的10-15%,限制了PARPis的广泛应用。因此,探索治疗无BRCA突变mCRPC的其他方法至关重要。
在此背景下,发表在《SCIENCE ADVANCES》上的这项研究瞄准了上述临床挑战。研究人员通过整合DNA损伤数据集与前列腺癌相关数据库,筛选出23个候选基因,其中TRMT10A——一个已知的tRNA甲基转移酶——作为DDR通路的潜在调控因子脱颖而出。他们发现TRMT10A在mCRPC中通过去泛素化酶USP10稳定而上调,并揭示了其独立于甲基酶活性、通过ATM-TRMT10A-BRCA1信号轴调控HR修复和PARPi敏感性的全新功能。
为开展研究,作者团队运用了多种关键技术方法:利用癌症基因组图谱(TCGA)和基因表达汇编(GEO)数据库进行生物信息学分析;采用免疫组织化学(IHC)对54例患者样本进行蛋白表达检测与预后关联分析;通过shRNA介导的基因敲降和过表达技术在多种前列腺癌细胞系(如22Rv1、DU145、C4-2、PC-3)中进行功能获得与缺失实验;使用DR-GFP/EJ5-GFP报告系统定量评估同源重组(HR)和非同源末端连接(NHEJ)修复效率;通过免疫荧光显微镜观察DNA损伤焦点(如γ-H2AX、BRCA1、RAD51焦点)的形成与动态变化;利用免疫共沉淀(Co-IP)和蛋白质印迹法(Western blot)分析蛋白相互作用、磷酸化及泛素化修饰;开展细胞源性异种移植(CDX)和患者源性异种移植(PDX)模型进行体内药效评估;并使用小分子抑制剂(如olaparib, spautin-1, KU-55933)进行药理干预和协同效应分析。研究所用患者样本队列来自医院收集的临床标本和已建立的PDX模型。
TRMT10A is up-regulated in patients with mCRPC and is associated with PARPi response
研究人员发现TRMT10A在前列腺癌肿瘤组织中的表达显著高于正常组织,且其表达水平随着肿瘤分期的严重程度而增加,在转移性前列腺癌和去势抵抗性患者中尤为明显。对54例患者样本的IHC分析证实,TRMT10A高表达与更短的总生存期显著相关。在细胞系中,TRMT10A表达水平与对PARPi olaparib的耐药性呈正相关,表明TRMT10A可能作为预测PARPi反应的生物标志物。
TRMT10A deficiency sensitizes PCa to PARPis
通过敲低和过表达实验,研究团队证实TRMT10A缺失显著增强了多种前列腺癌细胞系(22Rv1、DU145、C4-2)对olaparib的敏感性,而其过表达则诱导了耐药性。体内实验进一步证明,在DU145异种移植模型中,TRMT10A敲低联合olaparib治疗可有效抑制肿瘤生长。此外,TRMT10A缺失还增强了细胞对ATR抑制剂和化疗药物紫杉醇的敏感性。
TRMT10A deletion impairs BRCA1 recruitment and HR repair
机制探索表明,TRMT10A缺失并不影响DNA双链断裂(DSBs)的初始产生(γ-H2AX焦点形成),但严重损害了其后续修复,导致γ-H2AX焦点持续存在。通过GFP报告系统,发现TRMT10A敲低 specifically 降低了HR修复效率,同时增加了NHEJ和微同源介导的末端连接(MMEJ)活性。进一步研究发现,TRMT10A缺失并不影响早期DNA损伤信号蛋白(如MRE11, RAD50, NBS1, MDC1, RNF8, RNF168)的招募,但特异性地削弱了BRCA1和RAD51在损伤位点的聚焦,表明其功能位于DNA损伤信号级联的下游,专门调控HR修复。
TRMT10A regulates DNA repair independently on its tRNA m1G9 methyltransferase activity
TRMT10A已知的功能是催化tRNA第9位鸟苷的N1-甲基化(m1G9)。然而,研究人员引入其甲基转移酶功能缺失突变体(G206R)后发现,该突变体仍能恢复BRCA1/RAD51焦点形成和HR修复效率。这表明TRMT10A在调控DNA修复中的作用独立于其经典的甲基酶活性。
ATM phosphorylates TRMT10A at Ser28 and promotes the interaction between TRMT10 and BRCA1
生物信息学分析提示TRMT10A的Ser28位点位于保守的ATM/ATR磷酸化 motif(pSQ/TQ)中。实验证实,在DNA损伤后,ATM确实磷酸化了TRMT10A的Ser28位点。重要的是,这种磷酸化是TRMT10A与BRCA1发生相互作用所必需的。Co-IP实验显示,DNA损伤后TRMT10A与BRCA1的结合增强,而磷酸化缺陷突变体(S28A)则完全丧失了与BRCA1结合的能力。
Phosphorylation of TRMT10A is essential for BRCA1 recruitment and HR repair
功能回复实验证实,回补野生型TRMT10A可挽救因其敲低导致的HR修复缺陷和BRCA1/RAD51招募障碍,而回补磷酸化缺陷突变体(S28A)则无法实现挽救。相应地,S28A突变体也无法逆转由TRMT10A敲低带来的PARPi增敏效应。这些结果确立了ATM介导的TRMT10A Ser28磷酸化在其调控HR修复和PARPi敏感性中的核心作用。
USP10 interacts with and stabilizes TRTM10A
为了探究TRMT10A在mCRPC中上调的机制,研究人员发现去泛素化酶USP10与TRMT10A相互作用。USP10敲低会导致TRMT10A蛋白水平降低,而这种降低可被蛋白酶体抑制剂MG132所逆转。CHX追踪实验表明USP10敲低加速了TRMT10A的降解。此外,USP10敲低增加了TRMT10A的泛素化水平。临床样本分析显示USP10与TRMT10A蛋白表达呈正相关。这些结果表明USP10通过去泛素化并稳定TRMT10A来维持其蛋白水平。
USP10 knockdown leads to HR repair impairment
正如预期,USP10敲低也导致了HR修复效率下降,BRCA1/RAD51焦点形成减少,并增强了细胞对PARPi的敏感性。这与其上游调控因子TRMT10A的表型一致。
USP10 inhibitor spautin-1 treatment leads to TRMT10A degradation and HR deficiency
研究人员进一步使用USP10的小分子抑制剂spautin-1进行药理验证。处理细胞后,TRMT10A蛋白水平以剂量依赖性方式下降,且该效应可被MG132逆转,但不影响其mRNA水平。Spautin-1处理同样损害了HR修复,减少了BRCA1/RAD51的招募。最重要的是,spautin-1与olaparib联合使用时,在体外细胞系(22Rv1, C4-2)和体内CDX模型(22Rv1)中均表现出强大的协同抗肿瘤效应,显著抑制了肿瘤生长并诱导了细胞凋亡和DNA损伤。值得注意的是,联合治疗在非肿瘤细胞中和在小鼠体内都展现了良好的安全性,未显著加重olaparib单药已存在的轻度血液学毒性。
PARPi and USP10 inhibitor synergistically inhibits tumor growth in mCRPC
研究的最终转化价值在高TRMT10A/USP10表达的mCRPC患者来源异种移植(PDX)模型中得到验证。在两个独立的PDX模型(#546和#1092)中,olaparib与spautin-1的联合治疗相较于单一药物,显著更强地抑制了肿瘤生长,证明了该联合策略的临床前疗效。
讨论与结论
本研究系统地揭示了一条全新的ATM-TRMT10A-BRCA1信号轴在调控前列腺癌DNA同源重组修复和PARP抑制剂敏感性中的核心作用。其主要结论和重要意义在于:
  1. 1.
    发现新功能:首次揭示了tRNA甲基转移酶TRMT10A的一个独立于其酶活性的新功能——作为DNA损伤应答中的关键调控因子,其功能缺失会导致HR缺陷(HRD)。
  2. 2.
    阐明新机制:详细阐明了其机制:DNA损伤后,ATM kinase磷酸化TRMT10A的Ser28位点,磷酸化的TRMT10A进而促进BRCA1招募至DNA损伤位点,从而保障有效的HR修复。
  3. 3.
    解析上调机制:发现了TRMT10A在mCRPC中高表达的上游机制,即被去泛素化酶USP10稳定化。
  4. 4.
    提出新策略:创新性地提出了靶向USP10(使用其抑制剂spautin-1)来诱导TRMT10A降解,从而人为制造“BRCAness”表型(HRD状态),进而使原本对PARPi不敏感的mCRPC肿瘤变得高度敏感。
  5. 5.
    验证有效性:通过大量的体外细胞模型、体内CDX模型以及更接近临床的PDX模型,充分证明了联合使用USP10抑制剂(spautin-1)和PARPi(olaparib)是一种高效且协同的抗癌策略。
  6. 6.
    拓展受益人群:该研究为解决“如何让缺乏BRCA1/2突变的mCRPC患者从PARPi治疗中获益”这一临床难题提供了强有力的理论依据和极具转化潜力的解决方案,有望显著扩展PARPi的适用患者群体,是精准癌症治疗领域的一个重要进展。
总之,这项研究不仅深化了对DNA损伤修复调控网络的理解,更重要的是,它开辟了一条全新的治疗途径,为改善mCRPC患者的预后带来了新的希望。
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