碱基编辑技术赋能原发性T细胞:FAS与TGFβR2显性负突变协同增强CAR-T抗实体瘤能力

【字体: 时间:2025年10月12日 来源:Molecular Therapy Oncology 5.3

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  本研究针对实体瘤免疫抑制微环境(TME)中FASL与TGF-β介导的CAR-T细胞功能障碍,通过碱基编辑(BE)技术在原发性T细胞中引入内源性FAS与TGFβR2的显性负突变(dn),显著提升CAR-T对凋亡与增殖抑制的抵抗能力。结果显示,dn突变工程化CAR-T在体外杀伤、持久性及耗竭标志物表达方面均优于传统病毒载体方法,为多重基因编辑增强实体瘤免疫疗效提供了新策略。

  
实体肿瘤一直是癌症治疗领域的顽固堡垒,尽管嵌合抗原受体T细胞(CAR-T)疗法在血液肿瘤中取得突破性进展,但其在实体瘤中的疗效仍不尽如人意。究其原因,实体瘤微环境(TME)中弥漫的免疫抑制因子——如转化生长因子β(TGF-β)和FAS配体(FASL)——如同无形的枷锁,束缚了T细胞的活力。它们通过促凋亡和抑制增殖的双重机制,削弱CAR-T细胞的攻击能力,导致疗法失效。为了打破这一僵局,研究人员将目光投向了一种精准的基因编辑工具:碱基编辑(Base Editing, BE)。
传统上,科学家常通过病毒载体在T细胞中过表达显性负突变(dominant-negative, dn)受体(如dnTGFβR2)来阻断抑制信号,但这种方法存在内源性基因未被修饰、病毒载体容量有限等问题。美国明尼苏达大学等机构的研究团队独辟蹊径,利用碱基编辑器ABE8e,在原发性人T细胞的内源性FAS和TGFβR2基因中直接引入自然存在的点突变,从而在原位将正常受体“改造”为显性负突变形式。这一策略不仅避免了双链DNA断裂(DSB)的风险,更实现了高效、精准的多重基因编辑,为CAR-T细胞“装甲化”提供了全新思路。
研究团队首先筛选了与自身免疫病或癌症相关的FAS和TGFβR2突变位点,设计了12条引导RNA(gRNA)。通过电穿孔将ABE8e mRNA与gRNA导入T细胞,7天后检测编辑效率,发现多个gRNA在目标碱基上实现了超过50%的A→G转换。其中,FAS Y232C和TGFβR2 V447A两种突变在功能验证中表现突出:前者使T细胞对FASL诱导的凋亡抵抗性提升约80%,并显著降低下游cleaved caspase 3(cC3)水平;后者则在TGF-β存在的连续刺激实验中,使T细胞增殖能力提高2.8倍,同时抑制SMAD2/3磷酸化达92%。
在CAR-T细胞应用中,研究团队进一步将TGFβR2 V447A编辑与B2M(β2微球蛋白)和TRAC(T细胞受体α恒定区)敲除相结合,构建了多重编辑的CD19 CAR-T细胞。在含有TGF-β的系列杀伤实验中,这些细胞展现出更强的肿瘤细胞清除能力和更低的耗竭标志物(LAG-3、TIM-3)表达。尤为重要的是,与慢病毒载体过表达dn受体的传统方法相比,碱基编辑的CAR-T在抗凋亡、增殖维持和杀伤效率方面均显著胜出,凸显了原位基因编辑的优越性。
关键技术方法包括:从健康 donor 外周血单核细胞中分选CD4+/CD8+ T细胞;使用ABE8e mRNA与化学修饰sgRNA通过电穿孔进行碱基编辑;通过Sanger测序与EditR软件分析编辑效率;采用FASL杀伤实验、TGF-β连续再刺激实验、CAR-T与靶细胞共培养杀伤模型等功能验证;利用流式细胞术检测细胞表型与信号分子。
Base editors efficiently install dn mutations at endogenous loci in primary human T cells
通过筛选疾病相关突变位点并设计针对性gRNA,碱基编辑系统成功在T细胞内源性FAS与TGFβR2基因中引入点突变,其中FAS Y232C、TGFβR2 V447A等位点编辑效率超过50%,为后续功能研究奠定基础。
T cells harboring dn receptor mutations installed by BE are resistant to suppression by FASL and TGF-β
功能实验表明,FAS Y232C突变细胞在FASL刺激下凋亡率显著降低,cleaved caspase 3水平下降75%;TGFβR2 V447A突变细胞在TGF-β环境中增殖能力提升2.8倍,且SMAD2/3磷酸化被有效抑制,证实dn突变可拮抗抑制信号。
Dominant-negative TGFβR2 CAR-T cells demonstrate enhanced cytolytic function in the presence of TGF-β
在TGF-β存在的条件下,携带TGFβR2 V447A的CD19 CAR-T细胞在连续杀伤实验中表现优于对照组,且耗竭标志物LAG-3、TIM-3表达降低,说明dn编辑能提升CAR-T在免疫抑制环境中的持久性与战斗力。
BE-engineered dnFAS and dnTGFBR2 CAR T cells outperform lentiviral cDNA-engineered counterparts
与慢病毒过表达dn受体的CAR-T相比,碱基编辑的dnFAS与dnTGFβR2 CAR-T在抗凋亡、增殖维持与靶细胞杀伤方面均具优势,凸显原位编辑技术避免内源性信号干扰、提升编辑纯度的价值。
研究团队在讨论中指出,碱基编辑介导的显性负突变策略兼具多重优势:它不仅避免了病毒载体的容量限制与随机整合风险,还克服了传统敲除(KO)可能引发的异构体偏移问题。此外,dn突变能“扣押”配体,保护周围未编辑细胞,这一特性在编辑效率未达100%时尤为重要。尽管dn突变可能关联某些疾病表型(如FAS T28A在自身免疫病中已知),但研究人员强调,通过精准控制突变位点与表达水平,并结合现有安全策略(如自杀开关),此类风险可控。
综上所述,这项研究首次将碱基编辑技术应用于T细胞显性负突变工程化,为实体瘤免疫治疗提供了可多重编辑、精准调控的“装甲”CAR-T平台。该策略不仅显著增强T细胞对免疫抑制信号的抵抗能力,更展现出优于传统病毒方法的疗效与安全性潜力,为突破实体瘤治疗瓶颈开辟了新的基因编辑免疫工程路径。
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