七鳃鳗组蛋白去乙酰化酶家族基因鉴定及其在炎症进程中的进化保守功能研究

本文首次从无颌类脊椎动物七鳃鳗中筛选出6个HDAC家族基因（HDAC1/3/4/6/10/11），通过生物信息学与功能实验证实其在结构域保守性和炎症调控功能（如通过MAPK-NF-κB/AP1通路调节炎症因子）与高等脊椎动物具有进化连续性，为原始脊椎动物免疫机制研究提供了新视角。

　　

亮点

实验动物与处理

本研究使用的成年七鳃鳗（体长41.5±6.5厘米）于2020年采自中国吉林省。脂多糖（LPS）购自北京索莱宝科技有限公司，用无菌PBS配制成1毫克/毫升溶液。雌性七鳃鳗随机分为四组（每组3条），分别通过腹腔注射100微升LPS溶液处理0、4、12和24小时，对照组注射等量PBS。

七鳃鳗HDAC基因筛选克隆及编码蛋白的氨基酸序列分析

从七鳃鳗基因组数据库中成功克隆到6个HDAC基因（Lc-HDAC1/3/4/6/10/11），其开放阅读框长度分别为1485、1290、2670、4023、1764和1050 bp，对应编码494、429、889、1340、587和349个氨基酸（表3）。通过美国国家生物技术信息中心数据库比对发现，不同物种中HDAC基因的类型和数量存在差异……

讨论

目前已知18个HDAC基因中，本研究从七鳃鳗基因组筛选出7个（HDAC1/3/4/6/8/10/11），并对其中6个进行了功能验证。尽管HDAC8在基因组中被识别，但多次实验均未检测到其表达。七鳃鳗的HDAC基因数量与其进化地位基本相符：无脊椎动物中HDAC基因数量通常少于脊椎动物，而七鳃鳗作为最原始的有颌类脊椎动物，其HDAC家族规模呈现出从简单到复杂的过渡特征……