Aspyre Lung技术:挽救NGS质控失败样本实现非小细胞肺癌精准变异检测的新突破

【字体: 时间:2025年10月13日 来源:Translational Oncology 4.1

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  本研究针对非小细胞肺癌(NSCLC)分子检测中下一代测序(NGS)技术存在的样本高失败率、质量控制问题及长检测周期等临床痛点,开发了基于等位基因特异性焦磷酸分解反应(Aspyre)技术的Aspyre Lung检测方法。研究通过对198例NSCLC组织样本(包括107例NGS质控失败样本和91例NGS成功样本)的系统验证,证明Aspyre Lung在两天内即可完成11个基因114个临床相关变异的检测,成功挽救了96%的NGS失败样本,与NGS结果的一致性达97%。该技术为改善NSCLC患者靶向治疗可及性提供了重要解决方案。

  
肺癌作为全球癌症相关死亡的主要原因,其中非小细胞肺癌(NSCLC)占病例的80-85%。随着精准医疗的发展,基于基因变异的靶向治疗已成为NSCLC治疗的重要组成部分。然而,当前主流的下一代测序(NGS)技术在实际应用中面临严峻挑战:高达25%的样本因质量控制(QC)问题导致检测失败,加之检测周期长、组织样本需求量大,使得近半数患者无法获得及时的靶向治疗机会。特别是在早期NSCLC(eNSCLC)患者中,快速准确的EGFRALK检测对于术前新辅助免疫化疗方案的制定至关重要。
针对这一临床困境,发表于《Translational Oncology》的研究论文提出了一种创新解决方案——Aspyre Lung检测技术。这项研究由Biofidelity Ltd.(英国剑桥)的Eleanor Ruth Gray等学者完成,系统评估了该技术在198例NSCLC样本中的性能表现,其中特意纳入了107例NGS质控失败的样本,以验证其"挽救"失败样本的能力。
研究人员采用的主要技术方法包括:从福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)组织样本中并行提取DNA和RNA,使用Aspyre Lung检测技术(基于等位基因特异性焦磷酸分解反应原理)对11个基因的114个变异进行检测,并与两种NGS方法(Roche Avenio和Illumina TSO500)进行对比验证。样本来源包括前瞻性收集的临床样本和Precision for Medicine生物样本库的存档样本。
Cohort A – NGS质控失败样本的分析结果
在107例NGS质控失败的样本中,Aspyre Lung成功实现了96%(103/107)的检测成功率。尤为重要的是,在这些被"挽救"的样本中,47%(48/103)检出了至少一个临床相关变异,其中包括6例多重变异。通过正交验证方法(如RT-dPCR和Sanger测序)证实了Aspyre Lung检测结果的可靠性,特别是在ALKROS1基因融合变异检测方面表现优异。
Cohort B - NGS通过样本的验证结果
在91例NGS检测成功的样本中,Aspyre Lung显示了与NGS高度的一致性(97%)。研究发现了少数不一致案例,经深入分析证实Aspyre Lung的结果更为准确。例如,一例被NGS误判为KRAS p.G12C和p.G12V的样本,Aspyre Lung正确识别为p.G12F,这一发现避免了可能的误治风险。
EGFR/ALK早期阶段样本的检测效能
研究特别关注了早期NSCLC样本的检测情况,发现80%的EGFR阳性样本来自I期和II期患者,证明了Aspyre Lung在早期癌症中的高灵敏度,这对于指导新辅助治疗决策具有重要意义。
研究结论表明,Aspyre Lung技术能够有效解决当前NSCLC分子检测中的多个瓶颈问题。其两天快速检测周期、低样本输入要求(可低至5 ng DNA和1.5 ng RNA)以及高成功率,特别是对NGS失败样本的挽救能力,为临床提供了重要的补充检测方案。该技术覆盖了NCCN指南推荐的所有一线治疗相关基因,在保证检测质量的同时,显著提高了患者获得精准治疗的机会。
讨论部分进一步强调了Aspyre Lung技术的临床价值。与传统NGS相比,该技术不仅检测速度快、操作简便,更重要的是能够处理质量较差的样本(包括存档十年以上的FFPE样本),这为生物样本库资源的有效利用开辟了新途径。研究者建议,Aspyre Lung可作为一线快速筛查工具,阴性样本再行NGS检测以发现罕见变异,这种分层检测策略有望优化临床检测流程。
值得注意的是,Aspyre Lung技术基于独特的焦磷酸分解原理,通过酶促反应特异性降解与靶序列完全互补的探针,实现了类似数字PCR(dPCR)的高灵敏度,同时保持了常规PCR的简便性。这种技术特点使其特别适合在常规分子诊断实验室推广应用。
该研究的局限在于Aspyre Lung主要针对常见变异设计,对极罕见变异的检测能力不如NGS。然而,考虑到其快速、高灵敏度的特点,结合临床实际需求,这种针对性设计反而体现了"精准"的策略性思考。
总之,这项研究证实了Aspyre Lung技术在改善NSCLC分子检测可及性方面的突破性进展。通过挽救传统方法无法检测的样本,并提供快速、准确的结果,该技术有望使更多患者从精准靶向治疗中获益,最终改善生存结局。随着分子诊断技术的不断进步,像Aspyre Lung这样兼顾效率与准确性的检测方法,将在癌症精准医疗领域发挥越来越重要的作用。
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