智利牛支原体遗传多样性研究：揭示BRD与乳腺炎病原的基因组特征及ST60优势克隆的全球传播

本文采用全基因组测序（WGS）首次系统解析了智利牛支原体（Mycoplasma bovis）的种群结构，发现ST60为绝对优势克隆（97.8%），与北美菌株高度同源。研究填补了南美洲该病原分子流行病学空白，为理解其基因组可塑性及跨大陆传播机制提供关键数据。

　　

Highlight

智利牛支原体分离株的遗传多样性

基因组组装平均N50为26,920，包含64个重叠群，GC含量29.39%，完整度达96%。平均编码序列（CDS）数为750（详见表S3）。TYGS分析确认所有组装均为牛支原体（数据未展示）。MLST分型显示97.8%的菌株为ST60型，仅一株为ST12型。核心基因组SNP（cg-SNP）树（图S1）和全基因组SNP（WGS-SNP）树（图2）表明所有ST60分离株形成紧密分支，而ST12分离株与北美、以色列和欧洲菌株聚为一簇，并与该物种的模式菌株PG45聚类。

讨论

本研究通过WGS揭示了智利牛支原体种群高度克隆化的特性，ST60为绝对主导型别。ST60此前已在智利南部奶牛场乳腺炎暴发中被报道（未发表数据），当前研究进一步证实其主导地位，并扩展至呼吸道来源菌株。系统发育分析显示智利ST60菌株与加拿大ST60菌株亲缘关系极近，提示共同起源或近期引入事件。ST12型孤立菌株的检出则反映了国际菌株流通的潜在影响。

结论

本研究首次描绘了智利牛支原体的种群结构，明确ST60为优势克隆，其与北美菌株的紧密遗传关联为后续溯源研究奠定基础。成果为解析该克隆的适应性优势及跨区域传播机制提供了关键基因组学证据。