基于QNome纳米孔测序的体液mRNA标记物鉴定与个体来源分析新策略

本研究针对法医学中需同时确认生物斑痕个体来源与细胞起源的挑战，来自国内的研究人员开发了靶向mRNA纳米孔测序技术。通过分析12种体液特异性mRNA及41个cSNP，成功实现体液来源判别与个体识别，DP值达0.5645-0.9017，为法医DNA分析提供新途径。

　　

在法医案件调查中，要揭示事件的犯罪本质，不仅需要鉴定特定生物斑痕的个体来源，还需确认其细胞起源。近期研究证实，利用特异性信使核糖核酸(mRNA)标记物可识别体液，并通过这些mRNA内部的编码区单核苷酸多态性(cSNP)将体液与其供体关联。纳米孔测序技术因其长读长优势，能够在更长的mRNA扩增子中检测更多cSNP。

在这项原理验证性研究中，我们开发了靶向mRNA纳米孔测序组合方案，可同步推断体液来源并识别个体。该方案包含12种体液特异性mRNA和两个内参基因(RG)，这14个mRNA转录本中共涵盖41个cSNP。测序数据显示，特异性mRNA在外周血、精液和月经血中高表达，平均读数比例超过95%（排除RG读数后）。在唾液和阴道分泌物中观察到交叉反应性，但所有体液样本仍能准确聚类。

研究检测到16个cSNP存在替代等位基因，随机选取样本的基因分型结果经桑格测序验证具有一致性。该系统的个体识别能力(DP)范围在0.5645至0.9017之间，可为体液供体提供信息。然而，仍需进一步研究以识别更多特异性mRNA，引入更多高多态性cSNP，并在更大群体中进行评估。