TIMM17A与NMT1共表达:非小细胞肺癌预后不良的新生物标志物与治疗靶点

【字体: 时间:2025年10月14日 来源:Scientific Reports 3.9

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  本研究针对KRAS/STK11/KEAP1共突变非小细胞肺癌(NSCLC)治疗耐药性问题,通过分析TCGA和OncoSG队列数据,发现N-肉豆蔻酰转移酶1(NMT1)与线粒体内膜转位酶17A(TIMM17A)共高表达与患者总生存期(OS)、疾病特异性生存期(DSS)和无病生存期(DFS)显著负相关,揭示了NMT1/TIMM17A轴作为预后预测标志物和靶向治疗新策略的潜力。

  
肺癌是全球癌症相关死亡的主要原因,其中非小细胞肺癌(NSCLC)占比最高。尽管免疫检查点抑制剂(ICI)和靶向治疗近年来取得进展,KRAS突变型NSCLC患者的预后仍极差,尤其是携带STK11和/或KEAP1共突变的患者,其对现有疗法具有天然耐药性,5年总生存率(OS)仅25%,中位生存期仅1.2年。这类肿瘤通常与吸烟史相关,侵袭性强且治疗选择有限,因此急需探索新的治疗靶点和预后生物标志物。
以往研究发现,在KRAS突变背景下,STK11和KEAP1突变的肺癌细胞对N-肉豆蔻酰转移酶(NMT)的抑制剂敏感,且这种敏感性与线粒体内膜蛋白TIMM17A的依赖性相关。然而,NMT1与TIMM17A在临床预后中的协同作用尚未明确。本研究利用癌症基因组图谱(TCGA)和新加坡肿瘤数据门户(OncoSG)队列,旨在揭示NMT1和TIMM17A表达水平与肺腺癌(LUAD)患者生存结局的关联,并验证其作为联合生物标志物和治疗靶点的潜力。
研究人员主要采用公共数据库回顾性队列分析技术,包括从cBioPortal和OncoSG获取TCGA-LUAD(n=486)和东亚吸烟人群(n=62)的RNA测序数据与临床信息,使用Cox比例风险回归模型评估基因表达(连续变量与分类变量)与生存结局(OS、DSS、DFS)的关联,并通过多变量模型调整年龄、性别、肿瘤分期、突变状态(KRAS/STK11/KEAP1)和缺氧评分等混杂因素,采用限制平均生存(RMS)曲线和Kaplan-Meier曲线进行可视化,统计方法包括学生t检验、Fisher精确检验和似然比检验(ANOVA)。
High NMT1 and TIMM17A were associated with poor overall survival in lung adenocarcinoma
作为连续变量,NMT1和TIMM17A表达每增加一个标准差,死亡风险分别升高17%(P=0.046)和15%(P=0.047)。按最佳截断值(NMT1: 80百分位数;TIMM17A: 50百分位数)分组后,高表达组相比低表达组死亡风险分别增加52%(P=0.017)和60%(P=0.017)。
Individual and combined effect of NMT1 and TIMM17A on OS, DSS, and DFS
TIMM17A高表达与DSS(P=0.023)和DFS(P=0.030)下降相关,而NMT1仅与OS相关。两者无显著交互作用,但在TIMM17A高表达亚组中,NMT1与OS负相关(P=0.016, HR=1.71),低表达组中则不显著(P=0.33)。双高表达组(NMT1high/TIMM17Ahigh)相比双低表达组死亡风险升高143%(OS, P<0.001, HR=2.43),疾病相关死亡风险升高110%(DSS, P=0.023),复发风险升高71%(DFS, P=0.049)。
Building multivariable cox regression model
高TIMM17A与KEAP1突变(P<0.001)、STK11突变(P=0.009)、KRAS/STK11/KEAP1共突变(P=0.009)及高缺氧评分(P<0.001)显著相关,而缺氧评分与OS负相关(P<0.001)。多变量模型中,调整性别、年龄、分期和突变状态后,TIMM17A(P=0.005, HR=1.56)和NMT1(P=0.023, HR=1.51)仍独立预测OS恶化;双高表达组死亡风险升高140%(P<0.001, HR=2.40)。
Validating results in OncoSG ever-smokers
在OncoSG吸烟者亚组(n=62)中,NMT1(P=0.033, HR=2.89)和TIMM17A(P=0.023, HR=3.67)高表达均与OS负相关;双高表达组死亡风险升高366%(P=0.031, HR=4.66),与TCGA队列趋势一致。
本研究证实了NMT1和TIMM17A共高表达是LUAD患者预后不良的强预测因子,且这一关联独立于肿瘤分期、突变状态和缺氧微环境。值得注意的是,NMT1的预后效应仅在TIMM17A高表达背景下显著,提示两者功能协同性。这一发现与既往基础研究一致:NMT抑制剂下调TIMM17A表达,且仅对NMT抑制剂敏感的细胞表现出TIMM17A依赖性。尽管突变频率低限制了统计学效力,但双高表达群体富集STK11/KEAP1突变,与KRAS突变背景下治疗耐药表型吻合,支持NMT1-TIMM17A轴作为该亚型肺癌潜在治疗靶点。
研究局限性包括TCGA队列缺乏免疫治疗数据、以高吸烟负荷高加索人群为主,且样本量不足以充分解析突变中介效应。然而,利用更新版TCGA数据、连续变量分析及东亚队列验证增强了结论可靠性。未来需在非吸烟人群和其他族裔中验证,并深入探索NMT1调控TIMM17A的分子机制(非肉豆蔻酰化依赖)及其在肿瘤代谢、铁死亡(ferroptosis)或免疫微环境中的作用。本研究为开发针对KRAS/STK11/KEAP1突变NSCLC的联合靶向策略提供了临床前依据和转化方向。
论文由Alfred A. Chan、Kamya Sankar、Karen L. Reckamp、Bego?a Diaz与Delphine J. Lee合作完成,发表于《Scientific Reports》(2025年卷15期35597页)。
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