综述:细胞外囊泡分离检测前沿技术进展:从异质性分析到临床应用

【字体: 时间:2025年10月15日 来源:Journal of Nanobiotechnology 12.6

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  本综述系统评述了细胞外囊泡(EVs)分离检测技术的革新与挑战,重点剖析了EVs在尺寸、来源、分子组成和功能上的异质性,探讨了超速离心、微流控、单囊泡分析等传统与新兴技术的优劣,并深入展望了EVs在肿瘤诊断、靶向治疗和组织修复等临床转化中的应用前景与现存瓶颈。

  
细胞外囊泡的生物学意义与异质性
细胞外囊泡(Extracellular Vesicles, EVs)是细胞释放的脂质双层纳米颗粒,广泛存在于多种体液和细胞培养上清液中。根据其生物发生和物理特性,EVs主要分为三大类:外泌体(exosomes, 30-150 nm)、微囊泡(microvesicles, 100-1000 nm)和凋亡小体(apoptotic bodies, 500-2000 nm)。它们作为内源性信息载体,通过转运蛋白质、核酸等生物活性分子,在细胞间通讯中扮演关键角色,参与免疫调节、组织修复、肿瘤转移等多种生理和病理过程。
EVs的生物学意义与其高度异质性密切相关。这种异质性不仅体现在粒径上,还表现在细胞起源、分子组成和功能多样性上。
生物发生途径的多样性
不同生物发生途径导致了EVs的异质性。外泌体起源于内吞系统,细胞膜内陷形成早期内体,成熟为多泡体后与质膜融合释放;微囊泡直接从细胞膜出芽脱落;凋亡小体则源于细胞凋亡。这种发生途径的差异与其功能分工相呼应:外泌体负责精确的信号调控,微囊泡响应急性环境变化,凋亡小体则处理细胞碎片。
细胞来源的多样性
不同细胞释放的EVs具有不同的功能特异性。在肿瘤微环境中,恶性细胞、免疫细胞和基质细胞通过分泌EVs建立复杂的信号网络,共同调控疾病进展。例如,肿瘤细胞来源的EVs可能携带免疫抑制分子如PD-L1,促进肿瘤免疫逃逸;而免疫细胞来源的EVs则可能调节免疫检查点蛋白的功能。间充质干细胞来源的EVs(MSC-EVs)则因其高稳定性、低免疫原性和靶向组织穿透能力,在组织修复中展现出治疗潜力。
细胞状态的影响
细胞所处的生理或病理状态显著影响其分泌的EVs特性。即使在相同类型的细胞中,细胞周期、应激状态或分化程度的差异也会导致EVs分泌模式和生物学特性的显著改变。例如,在缺氧条件下,乳腺癌细胞来源的EVs中血管生成相关microRNAs水平升高,从而增强内皮细胞成管能力,促进血管生成。
体液特异性
不同来源体液的EVs其生物物理和生化特性各异。血液及其衍生物(如血浆、血清)来源的EVs对止血和免疫反应至关重要;尿液来源的EVs(uEVs)特异反映泌尿系统功能;脑脊液来源的EVs(CSF-EVs)为中枢神经系统疾病研究提供关键线索;乳汁来源的EVs(mEVs)则因其良好的环境抗性和富含免疫调节分子,在肠道疾病治疗中具有优势。
物种异质性
细菌来源的EVs(bEVs)和植物来源的EVs(PDEVs)的研究也日益受到关注。bEVs参与多种疾病的病理过程,而PDEVs则因其来源广泛、安全性高和可持续性,作为天然纳米载体和治疗剂成为研究热点。
EVs分离技术:从经典到创新
高效分离EVs是理解其功能和释放其临床潜力的基础。不同的分离方法基于不同的物理化学原理(尺寸、密度、表面电荷、抗原谱等),从而有意捕获EVs异质性的不同维度。
经典分离方法
  • 超速离心(UC):最广泛使用的EVs分离技术,基于颗粒在离心力下的差异沉降速率进行分离。虽应用广泛,但无法区分具有相同生物物理特性但起源和功能不同的EVs亚群,且效率低,可能损伤囊泡结构或引起聚集。
  • 超滤(UF):基于EVs与其他生物分子(如可溶性蛋白质、脂蛋白)的尺寸差异进行快速分离。该方法时间短、成本低、可扩展,但同样无法分辨大小相似但生物发生或 cargo 不同的EVs亚群。
  • 沉淀法:通过改变EVs的溶解度或水化层使其聚集沉淀。操作简单,回收率高,但共沉淀的污染物会降低纯度,且残留的聚合物可能干扰下游分子检测。
  • 尺寸排阻色谱(SEC):基于多孔介质的筛分效应分离生物颗粒。能较好保持EVs的天然结构和生物活性,但大洗脱体积可能稀释低丰度功能关键亚群,分辨率有限。
  • 免疫亲和法:利用特异性抗原-抗体相互作用实现高纯度EVs富集。特异性高,但抗体成本高,捕获效率受抗原表达异质性限制,洗脱过程可能损害EVs功能。
  • 阴离子交换色谱(AEC):基于电荷相互作用分离EVs。成本低、操作易、效率高、可规模化,但除盐步骤可能引入残留风险,分辨率同样有限。
创新分离方法
新兴技术正在将EVs亚群分离的分辨率推向量身定制的精准分选。
  • 不对称流场流分离(AF4):一种无标记、流体动力学技术,可按尺寸解析EVs,实现从复杂生物样品中高分辨率分选。
  • 微流控技术:将多模式分离原理集成到单一设备中,执行多参数分选以应对EVs异质性的复杂性。例如EXODUS系统,实现了生物样品中无标记外泌体的自动化快速纯化。
  • 磁珠分离技术:通过特异性分子识别和磁场实现目标囊泡的高效分离,选择性高,操作简便。
  • 脂质纳米探针分离技术:通过模拟天然膜相互作用高效捕获和释放EVs,分离时间短,输出纯度高。
  • 固相介质分离技术:通过定制材料表面特性,实现EVs的高效捕获和特异性识别。
  • 膜曲率感应肽:利用EVs膜特有的几何曲率,通过曲率依赖性相互作用作为整合配体实现高效EVs捕获。
EVs检测技术的现状
当前研究表明,大多数已发表的EVs样品都受到异质亚群和可能的非囊泡污染物的影响,这对下游组学分析的可靠性提出了挑战。因此,建立包含关键参数(粒径、浓度、表面电荷和纯度)的质量评价体系已成为EVs研究的关键前提。
EVs生物物理特性检测
  • 显微镜技术:透射电镜(TEM)、扫描电镜(SEM)、冷冻电镜(Cryo-EM)和原子力显微镜(AFM)共同构成了研究EVs超微结构的综合技术体系,可提供形态、尺寸和机械特性等信息。
  • 动态光散射(DLS):基于光散射的非破坏性分析技术,用于评估EVs尺寸分布和分散均一性。
  • 纳米颗粒跟踪分析(NTA):通过单颗粒可视化和动态跟踪同时检测尺寸分布、浓度和表面特性,是囊泡定量的关键方法。
  • 可调电阻脉冲传感(TRPS):基于纳米孔的单颗粒分析技术,可高精度测量EVs尺寸、浓度和表面电荷。
EVs生化特性表征
生化分析穿透了EVs的分子核心,识别和量化赋予不同EVs亚型特定功能的蛋白质、核酸和脂质。
  • 蛋白质印迹(Western Blot):验证囊泡特异性蛋白质标志物的标准方法。
  • 酶联免疫吸附测定(ELISA):基于特异性抗原-抗体相互作用精确定量EVs上/内的特定蛋白质标志物。
  • 质谱(MS):用于无偏倚地发现和全面解析EVs分子异质性的核心技术。蛋白质组学和脂质组学分析可以揭示样品或分离组分间显著的分子差异。
  • 流式细胞术(FCM):具有单颗粒分析和多参数检测能力,广泛应用于EVs表型分析和亚群分选。
  • 定量聚合酶链反应(qPCR):可检测EVs中低丰度核酸,灵敏度高,特异性强。
  • 全内反射荧光(TIRF)显微镜:实现EVs的高灵敏度单颗粒动态观察和分子定量。
  • 表面增强拉曼散射(SERS):具有极高的灵敏度和分子指纹特异性识别能力,为分析EVs生化组成提供纳米级分辨率的检测方案。
  • 表面等离子体共振(SPR):实现EVs表面标志物的无标记和动态检测。
单EV分析方法
超越群体水平分析,单EV检测技术对于破译功能异质性、识别具有诊断意义的稀有亚群以及实现疾病动态的超灵敏监测至关重要。
整合原子力显微镜(AFM)与荧光显微镜可以同时测量单个囊泡的物理特性和表面标志物表达。结合亲和分离和定量单分子定位显微镜(qSMLM)的SEVEN新技术,可量化亲和分离的EVs的数量、大小、形状、四跨膜蛋白含量和异质性。纳米抛射体二次离子质谱(NP-SIMS)可在单EV分辨率下分析群体异质性。液滴微流体系统结合抗体-DNA缀合物,可在单颗粒水平检测膜蛋白和mRNA。纳米流式细胞术(nFCM)整合光散射和荧光检测,分析单个EV和DNA片段。这些技术进步为了解EVs异质性和细胞行为机制提供了关键工具。
临床前转化研究的进展与挑战
EVs在肿瘤学、组织修复等领域的临床前转化研究取得了显著进展。在肿瘤诊断方面,EVs携带的蛋白质、核酸等分子能够精确反映疾病特征,作为生物标志物用于早期检测和准确识别多种癌症类型。基于EVs的检测在癌症液体活检中取得了快速进展。在治疗方面,EVs本身可作为治疗靶点,也可被修饰成靶向载体,用于递送基因编辑工具(如Cre重组酶、CRISPR复合物)或药物,提供个体化治疗新策略。作为药物载体,EVs相比人工递送系统具有天然低免疫原性、延长药物半衰期、增强药物稳定性和固有组织趋向性等优势。
在组织修复方面,EVs在神经系统、皮肤伤口、呼吸系统和肌肉骨骼系统的修复中均表现出积极作用。工程化的EVs(EEVs)通过鼻内给药,在动物模型和人类脑类器官中验证了可促进神经功能恢复。MSC-EVs在伤口闭合率、疤痕减少和血管生成方面明显优于对照组。雾化吸入MSC-EVs在急性呼吸窘迫综合征(ARDS)的临床试验中显示出良好的安全性和潜在疗效。
尽管前景广阔,但EVs的临床转化仍面临诸多挑战,包括缺乏技术标准化、大规模生产瓶颈、长期疗效验证不足以及重复给药的安全性和持久性不确定等问题。建立严格的生产规范(GMP)、优化储存运输条件、开发稳健的效力测定方法以及进行严谨的临床试验是推动EVs走向临床应用的必经之路。
展望与挑战
EVs作为关键的细胞间通讯介质,其研究技术的突破推动了该领域的快速发展。未来研究必须采用多变量分析框架,同时审视EVs的尺寸、组成、细胞来源和功能属性。群体水平分析为生物标志物发现和规模化生产提供了不可或缺的平均指标,而单囊泡技术则揭示了特定亚群的多样性和稀有性。通过计算建模和机器学习整合这些互补的数据流,将有助于在总体趋势和个体EV特征之间架起桥梁,从而更精确地将EVs异质性与临床表型联系起来。
EVs基于治疗在临床前研究中显示出对疾病的治疗益处,但其长期疗效和持久性仍不确定。深入研究以阐明EVs的体内寿命、药物疗效持续时间以及重复给药的安全性和有效性至关重要。最终,充分实现EVs的潜力需要跨学科合作,以建立标准化实践、验证临床效用,并释放细胞外囊泡在现代医学中的变革能力。
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