基于网络毒理学、生物信息学与分子对接的全氟化合物(PFAS)诱导肝内胆管癌(ICC)毒性机制研究

【字体: 时间:2025年10月15日 来源:Scientific Reports 3.9

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  为解决全氟烷基物质(PFAS)暴露与肝内胆管癌(ICC)发生机制不明的问题,研究人员开展基于网络毒理学、生物信息学和分子对接的多学科研究。发现PFAS通过干扰ESR1、PI3K-Akt和HIF-1信号通路促进ICC进展,构建含TP53等5个基因的预后模型(PFASscore)展现优异预测效能(AUC达0.822-1),分子 docking证实PFAS与核心靶点强结合,为环境暴露相关ICC的防治提供新靶点。

  
在环境毒素与肿瘤发生关系日益受到关注的今天,全氟烷基物质(Per- and polyfluoroalkyl substances, PFAS)作为一类具有持久性和生物累积性的合成化学品,已成为全球性的健康隐患。这类物质广泛应用于食品包装、纺织品涂层和工业清洁剂等领域,其化学稳定性导致它们在环境中难以降解,并通过食物链在人体内积累,尤其易在肝脏中富集。尽管既往研究已发现PFAS暴露与肝细胞癌(HCC)风险存在关联,但其对另一种原发性肝癌——肝内胆管癌(Intrahepatic Cholangiocarcinoma, ICC)的影响机制却鲜有探讨。ICC虽然只占原发性肝癌的约10%,但其病理特征独特且预后更差,亟待深入研究环境因素在其发生发展中的作用。
为解决这一科学问题,来自贵州中医药大学的研究团队在《Scientific Reports》上发表了创新性研究成果。他们采用多学科交叉方法,整合网络毒理学、生物信息学和分子对接技术,深入探究了PFAS中两种典型物质——全氟辛酸(Perfluorooctanoic acid, PFOA)和全氟辛烷磺酸(Perfluorooctane sulfonate, PFOS)诱导ICC的毒性机制。
研究人员运用了几个关键技术方法:从CTD、ChEMBL和Super-PRED数据库获取PFAS作用靶点,通过GeneCards、OMIM和NCBI收集ICC相关靶点;利用STRING数据库构建蛋白互作网络(PPI)并通过CytoHubba筛选核心靶点;采用DAVID数据库进行GO和KEGG通路富集分析;基于TCGA-CHOL队列的31例ICC和8例正常样本进行差异表达基因分析;运用LASSO回归算法构建预后风险模型;最后通过分子 docking技术验证PFAS与核心靶点的结合能力。
研究结果
主要靶点筛选与网络构建
通过数据库挖掘获得2,616个PFOA相关靶点和1,838个PFOS相关靶点,以及2,044个ICC相关靶点。Venn分析显示PFOA与ICC存在459个交集靶点,PFOS与ICC有345个交集靶点。
通路富集分析
GO分析显示PFAS主要通过影响细胞增殖、凋亡和迁移等生物学过程参与ICC发生。KEGG分析发现PI3K-Akt信号通路、HIF-1信号通路和FoxO信号通路是PFAS作用的关键通路。特别值得注意的是,HIF-1通路仅在PFAS-ICC交集靶点中显著富集,而在ICC特异性靶点中未出现,表明这是PFAS暴露的特异性作用通路。
预后模型构建与验证
通过LASSO回归从18个交集基因中筛选出5个关键预测基因(TP53、ESR1、CDH1、BCL2和MMP9),构建了PFASscore预后模型:PFASscore = [-0.12×TP53表达值] + [-3.7×ESR1表达值] + [-0.027×CDH1表达值] + [-0.048×BCL2表达值] + [-0.035×MMP9表达值]。该模型在TCGA队列中表现出优异的预测性能,1年AUC为0.822,3年AUC为0.936,5年AUC达到1。
分子对接验证
分子 docking结果显示PFOA和PFOS与5个核心靶蛋白的结合自由能(ΔG)在-7.4至-9.8 kcal/mol之间,表明结合稳定。其中ESR1与两种PFAS的结合得分最高,关键残基GLY-521和LEU-525与PFOA形成稳定氢键,HIS-524与PFOS稳定相互作用。
研究结论与意义
该研究通过系统性的多学科方法,构建了PFAS诱导ICC的理论框架,揭示了ESR1可能在调控ICC发病机制中发挥关键作用。研究发现PFAS可能通过干扰激素代谢(如ESR1信号)和调控PI3K-Akt、HIF-1等通路促进ICC发展。
这项研究的科学意义在于:首次全面阐明了PFAS暴露与ICC发生之间的分子机制联系;发现HIF-1信号通路是PFAS作用的特异性通路而非ICC的普遍特征;构建的PFASscore预后模型显示出良好的临床转化潜力;分子对接结果为PFAS与核心靶点的直接相互作用提供了结构证据。
这些发现为环境暴露相关ICC的防治提供了新的分子靶点和理论依据,特别是ESR1作为关键靶点的发现,解释了PFAS暴露在男性中ICC风险更高的性别差异现象。虽然该研究仍处于探索阶段,需要更大样本的验证和实验证实,但无疑为理解环境毒素与肿瘤发生的关系提供了重要见解,为未来开发针对性的预防和治疗策略奠定了坚实基础。
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