拓展GLUL相关发育性及癫痫性脑病的临床与遗传谱系:新致病机制与表型多样性研究

【字体: 时间:2025年10月15日 来源:Scientific Reports 3.9

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  本研究聚焦GLUL基因变异导致的发育性及癫痫性脑病(DEE),通过鉴定新型杂合de novo变异(包括剪接位点c.-13-1G>C和错义变异c.604T>C),首次证实错义变异亦可引起常染色体显性(AD)遗传类型。RNA测序验证剪接变异导致N端降解元(degron)缺失,揭示其功能获得性机制。研究扩展了AD型GLUL相关DEE的表型谱,发现肌张力增高、脑萎缩及深部灰质T2高信号等新特征,并揭示生化指标与基因型-表型关联的异质性,为精准诊断与机制探索提供关键依据。

  
在大脑的精密化学工厂中,谷氨酰胺合成酶(Glutamine Synthetase, GS)堪称一位至关重要的调度员——它由GLUL基因编码,负责将兴奋性神经递质谷氨酸(glutamate)和有毒废物氨(ammonia)转化为谷氨酰胺(glutamine),从而维持神经系统的稳态平衡。一旦这条“谷氨酸-谷氨酰胺循环”发生故障,便可能引发严重的脑发育与功能异常。过去的研究表明,GLUL基因的双等位基因功能缺失性变异会导致常染色体隐性(AR)遗传的先天性谷氨酰胺缺乏症,患者出现发育迟缓、癫痫和肌张力低下等症状;而近年来科学家们又发现了另一类截然不同的机制:某些位于5'非翻译区(UTR)的杂合变异可通过“起始密码子丢失(start-loss)”机制,促使翻译从下游甲硫氨酸(Methionine 18)起始,产生缺失N端降解元的截短型GS蛋白。这种变异导致GS蛋白稳定性增加、降解受阻,从而引起功能获得性(gain-of-function)效应,引发常染色体显性(AD)遗传的发育性及癫痫性脑病(DEE)。然而,截至目前全球仅报道了6例AR患者和10例AD患者,人们对GLUL相关DEE的临床和遗传谱系认知仍十分有限。
为了深入探索这一疾病,来自首尔国立大学儿童医院的研究团队在《Scientific Reports》上发表了最新研究成果。他们通过对三名无关的DEE患者进行遗传学分析,发现了两例新型候选变异(c.-13-1G>C和c.604T>C)和一例既往已报道的剪接位点变异(c.-13-2A>G),并首次提出错义变异也可能导致AD型疾病。研究不仅通过RNA测序(RNA-seq)在肌肉组织中验证了剪接变异引起的起始密码子跳读机制,还详细描述了患者独特的临床特征(如肌张力增高、脑萎缩和深部灰质T2高信号),揭示了疾病表型的广泛异质性。这些发现显著拓展了我们对GLUL相关疾病机制的理解,为未来精准治疗提供了重要线索。
本研究主要采用了以下关键技术方法:首先对患者及父母进行三重全外显子组测序(trio whole-exome sequencing)和全基因组测序(whole-genome sequencing),使用Illumina技术进行测序并与参考基因组hg38比对;利用Genome Analysis Toolkit(GATK)流程进行变异调用,并通过SpliceAI、REVEL等算法预测变异致病性;对一名患者进行肌肉组织批量RNA测序(RNA-seq),使用STAR软件进行比对并通过ggsashimi可视化剪接事件;使用Sanger测序验证新变异及其de novo来源;此外还整合了gnomAD、BRAVO、KOVA等群体数据库进行变异过滤。

遗传变异鉴定与功能分析

研究人员在三名无关的韩国DEE患者中鉴定了三个de novo杂合GLUL变异。患者1携带既往报道过的c.-13-2A>G剪接位点变异,患者2携带新型c.-13-1G>C变异(位于外显子2的5'UTR经典剪接受体位点),而患者3则携带新型错义变异c.604T>C(p.Trp202Arg)。SpliceAI预测这两个剪接位点变异均导致原始剪接受体丢失(delta得分=1.00),并激活下游26 bp处的新剪接位点。RNA测序结果在患者2中证实了这一预测:35%的转录本发生外显子1-2异常剪接,跳过了正常起始密码子,与既往报道的“起始丢失”机制一致。错义变异p.Trp202Arg经Sanger测序验证为de novo,且未被任何群体数据库收录;该位点在不同物种中高度保守(phyloP得分高达8.775),多种计算机预测工具均支持其致病性。
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C变异)的RNA测序结果,显示异常剪接事件(跳过起始密码子),而正常对照组未见该事件。'>

临床表型与影像学特征

三名患者均表现出癫痫和全面性发育迟缓(GDD)的核心症状,但临床经过和治疗反应各异。患者1(6岁男性)在3月龄时出现婴儿痉挛症,后期转为全身强直-阵挛发作,脑MRI显示脑萎缩、丘脑T2高信号和胼胝体发育不良;患者2(7岁男性)同样在3月龄起病,表现为全身强直和肌阵挛发作,MRI可见基底节和丘脑对称性T2高信号伴血管周围间隙增宽;患者3(4岁女性)则早在4周龄即出现强直发作,并伴有小头畸形和严重痉挛状态,随访MRI显示广泛脑白质体积丢失和胼胝体变薄。值得注意的是,所有患者均曾出现血氨升高(最高227μg/dL),但血浆谷氨酰胺水平均正常,脑脊液(CSF)氨基酸分析也未显示一致异常。

基因型-表型关联与疾病谱扩展

本研究首次将AD型GLUL相关DEE的性别范围扩展至男性(患者1和2均为男性),否定了既往关于“仅女性受累”的推测。此外,患者表现出的肌张力增高(而非既往AD病例典型的肌张力低下)、脑萎缩和深部灰质病变等特征,均为既往AD病例中未报道的新表型。错义变异携带者(患者3)甚至表现出更接近AR类型的特征(如小头畸形和严重脑萎缩),提示不同变异类型可能导致差异性的病理机制。生化分析显示,AD型患者并未呈现一致的“功能获得性”生化模式(即高谷氨酰胺/低氨),其谷氨酰胺和氨水平存在显著异质性,降低了生化检测对AD型疾病的诊断价值。

机制探讨与未来方向

本研究中错义变异p.Trp202Arg的发现挑战了既往“AD疾病仅由起始密码子丢失机制引起”的认知。研究者提出两种可能机制:一是该错义变异直接导致功能获得效应(类似截短变异);二是通过显性负效应(dominant-negative effect)干扰GS同源十聚体(homomeric decamer)的正常组装与功能。此外,GLUL基因对功能缺失性变异的高度约束性(LOEUF=0.38, pLI=1)说明单倍体不足可能具有早期致死性,这解释了为何患者中仅见错义变异(可能保留部分功能)而非截短变异。这些发现揭示了GLUL相关疾病的复杂机制,强调了功能实验和更多病例积累对彻底阐明病理机制的必要性。
该研究通过精准的遗传学分析和详细的临床评估,显著拓展了GLUL相关发育性及癫痫性脑病的临床与遗传谱系。不仅确认了剪接变异通过N端降解元缺失导致功能获得性效应的已知机制,还首次提出错义变异亦可引起常染色体显性遗传类型,并揭示了深部灰质病变、脑萎缩等新的神经影像学特征。研究强调了表型与生化指标的异质性,挑战了既往基于生化水平的功能分型理念,为临床诊断与遗传咨询提供了关键依据。未来需要更多功能实验以揭示错义变异的具体机制,并探索针对GS稳定性调节的治疗策略,最终改善这类罕见脑病患者的预后。
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