基于上下文感知混合蚁群优化逻辑森林模型(CA-HACO-LF)的人工智能驱动药物靶点相互作用预测研究

【字体: 时间:2025年10月15日 来源:Scientific Reports 3.9

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  本研究针对药物研发过程中高成本、长周期及高失败率等问题,提出了一种结合上下文感知学习和混合优化算法的AI驱动药物发现模型CA-HACO-LF。该模型通过蚁群优化(ACO)进行特征选择,结合逻辑森林(LF)分类器,显著提升了药物-靶点相互作用(DTI)预测的准确性与适应性。研究采用超过11,000种药物数据,经文本预处理(归一化、去停用词、词形还原等)和特征提取(N-Grams、余弦相似度),最终实现了98.6%的预测准确率,多项性能指标(如精确度、召回率、F1分数、AUC-ROC等)均优于现有方法(BERT、XGBoost、RF等),为精准医疗、药物重定位及临床试验筛选提供了高效 computational 工具。

  
药物发现一直是医药领域充满挑战的环节:成本高昂、周期漫长,且失败率惊人。全球范围内,癌症、糖尿病及微生物感染等疾病持续威胁人类健康,而传统药物研发依赖临床前试验、靶点验证与先导化合物筛选,过程复杂且效率低下。近年来,尽管计算智能辅助药物设计取得显著进展,但现有预测模型常缺乏上下文感知能力与语义理解深度,难以高效挖掘生物医学大数据中的关键关联。
为此,来自林肯大学学院、IILM大学与韩国朝鲜大学的研究团队在《Scientific Reports》上发表了一项突破性研究,提出了一种上下文感知混合蚁群优化逻辑森林模型(CA-HACO-LF),旨在通过人工智能优化药物-靶点相互作用(DTI)预测,提升候选药物筛选的精度与效率。
研究采用Kaggle平台提供的超过11,000种药物详细信息数据集,通过一系列自然语言处理(NLP)技术进行预处理,包括文本归一化(如小写转换、标点与数字去除)、停用词剔除、分词与词形还原(Lemmatization),以提升数据质量与一致性。特征提取阶段融合N-Grams与余弦相似度(Cosine Similarity)技术,从药物描述文本中捕获语义关联与上下文模式,转化为数值特征以支持模型学习。
核心模型CA-HACO-LF整合了蚁群优化(ACO)算法与逻辑森林(Logistic Forest, LF)分类器。ACO模拟蚂蚁觅食行为,通过动态信息素更新与路径选择机制优化特征子集筛选;LF则结合随机森林(RF)与逻辑回归(LR),利用多数投票机制集成预测,增强模型泛化能力。该框架还引入上下文感知(Context-Aware, CA)模块,融入患者病史、症状等情境信息,进一步提升个性化药物推荐的准确性。

模型构建与优化

研究人员通过Python实现整个流程,比较了多种优化策略(如遗传算法GA、粒子群优化PSO、模拟量子退火SQAO)与分类器组合,最终确定ACO+LF方案在多项指标中表现最优。

结果与分析

通过余弦相似度热图(Cosine Similarity Heatmap)可视化,本研究成功识别出药物之间的应用相似性,例如Ascoril LS Syrup与Ascoril D plus Syrup Sugar-Free显示出高度语义关联。词云(Word Cloud)分析进一步揭示“疼痛”、“治疗”、“缓解”等高频应用场景,以及“恶心”、“头晕”等常见副作用。
混淆矩阵(Confusion Matrix)显示,CA-HACO-LF在五类疾病(咳嗽、疼痛、癌症、发热、感染)分类任务中准确率高达98.6%,误分类率极低。与其他主流模型(如BERT、XGBoost、RF、KNN及多任务DNN)相比,本模型在精确度(0.985)、召回率(0.986)、F1分数(0.985)、F2分数(0.9859)、AUC-ROC(0.9943)等指标均显著领先,误差指标(RMSE、MSE、MAE)也最低。

优化对比与消融实验

特征选择优化对比表明,ACO与LF组合在各项指标中达到99%的综合性能,优于GA、PSO等其他优化方法。消融实验(Ablation Study)进一步验证了上下文感知模块、ACO特征选择与余弦相似度提取的必要性——移除任一组件均导致模型性能下降。

结论与意义

该研究不仅提出了一种高效、准确的DTI预测模型,还为AI驱动药物发现提供了可扩展框架。CA-HACO-LF模型在精准医疗、药物重定位、临床试验候选筛选等领域具备广泛应用潜力。然而,作者也指出当前模型在处理超大规模数据集时面临计算资源挑战,且需进一步临床验证以保障泛化能力。未来工作将聚焦于轻量化架构设计、多模态数据整合与真实世界应用部署。
本研究通过融合自然语言处理、进化算法与集成学习,为加速药物研发提供了可靠的计算工具,标志着人工智能在医药领域从理论走向实践的关键一步。
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