m1A修饰基因在牙周炎与2型糖尿病共病机制中的诊断价值及分子调控网络研究

《Archives of Oral Biology》:TWF1 Promotes Tumor Progression in Head and Neck Squamous Cell Carcinoma via AKT Phosphorylation

【字体: 时间:2025年10月15日 来源:Archives of Oral Biology 2.1

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  本综述通过整合生物信息学与实验验证,首次系统揭示m1A RNA修饰关键基因(RRP8、ALKBH3、MAK16、DDX18)在牙周炎与2型糖尿病(T2DM)共病机制中的诊断价值。研究构建的m1A评分模型(AUC达0.80)成功关联免疫浸润与代谢通路,为两种慢性疾病的早期诊断提供了新型表观遗传学标志物。

  
研究亮点
数据整合与校正
整体研究设计如图1所示。将GSE10334和GSE16134的表达谱合并生成牙周炎数据集,GSE38642和GSE41762合并生成糖尿病数据集。箱线图展示了牙周炎和糖尿病数据合并前后的分布情况(图S1A-D)。
m1A基因全景图
热图和箱线图展示了牙周炎数据集(图2A-B)和糖尿病数据集(图2D-E)中m1A相关基因的表达。在牙周炎中,多个m1A调控因子呈现差异化表达模式,其中RRP8ALKBH3的表达变化尤为显著。
诊断模型构建
通过岭回归和逻辑回归构建的诊断模型显示,RRP8ALKBH3对牙周炎和T2DM具有高预测价值,曲线下面积(AUC)分别达到0.80和0.72。模型验证表明这些基因能有效区分患者与健康对照组。
m1A评分与患者分型
基于m1A相关基因表达水平的评分模型成功将患者分为不同亚型,各亚型在转录组特征和免疫细胞浸润程度上存在显著差异。高分组的患者显示出更强的炎症反应和代谢通路激活。
免疫浸润分析
通过CIBERSORT算法分析发现,m1A评分与中性粒细胞、巨噬细胞等免疫细胞浸润程度呈正相关。枢纽基因MAK16DDX18的表达与CD8+T细胞数量显著相关,提示m1A修饰可能通过调控免疫微环境影响疾病进展。
实验验证
qRT-PCR结果显示,RRP8ALKBH3MAK16DDX18在炎症牙龈组织中显著下调(p < 0.05),而在链脲佐菌素诱导的糖尿病β细胞模型中明显上调,与生物信息学预测高度一致。
结论
本研究通过多组学整合分析揭示了m1A修饰在牙周炎与T2DM共病机制中的关键作用,筛选出的核心基因不仅具有诊断潜力,还为理解两种疾病共享的表观遗传调控机制提供了新视角。
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