FluorGen:基于图深度学习的荧光染料生成模型及其在G-四链体靶向探针开发中的应用
《Dyes and Pigments》:FluorGen: A graph-based deep learning model generates fluorescent dyes with structural fragments
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时间:2025年10月15日
来源:Dyes and Pigments 4.2
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本文报道了三种新型多功能G-四链体(G4)荧光探针GX-01/02/03的设计合成与性能研究。研究表明GX-01可特异性识别杂交型G4结构并通过分子对接(DFT/ESP计算)验证结合模式;紫外熔解/圆二色实验证实探针可稳定G4构象。此外,GX-01具备pH依赖性Al3+/Pb2+识别能力,GX-02可检测Sn2+,细胞实验验证其金属离子检测潜力。值得注意的是,GX-03对肿瘤细胞(HCT116)展现选择性抑制作用,为G4靶向工具开发及抗肿瘤药物研究提供新思路。
本研究成功构建了三苯胺-苯并噻唑(TPA-BZT)为核心的新型荧光探针GX系列,通过精准分子设计实现G-四链体(G4)结构特异性识别与金属离子多重检测功能。
实验所用试剂均为化学纯级别,G4 DNA序列由上海生工合成。采用液相色谱-离子阱-飞行时间质谱(LC-IT-TOF)进行质谱表征,核磁共振氢谱/碳谱(1H/13C NMR)通过400 MHz布鲁克谱仪测定。G4结构在50 mM Tris-KCl缓冲体系中预孵育后开展后续实验。
以苯并噻唑(BZT)为荧光母核,通过季铵化增强π-π/p-π共轭电子离域能力,协同三苯胺(TPA)中心功能侧链调控G4选择性。探针分子通过柔性连接臂整合靶向单元,形成具有AIE(聚集诱导发光)特性的智能识别系统。
GX系列探针在G4结构识别与金属离子检测领域展现巨大应用潜力:GX-01对杂交型G4具有高选择性,系列探针均具备核酸染色能力;GX-02/G4复合物表现酶催化活性,圆二色与紫外熔解实验证实其G4稳定化功能,为靶向药物开发提供新策略。
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