多重PCR检测α-珠蛋白基因常见突变在α-地中海贫血诊断中的效用评估
《Anemia》:Diagnostic Utility of a Multiplex PCR Assay in Detecting Common Mutations of the α-Globin Gene in α-Thalassemia
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时间:2025年10月16日
来源:Anemia 2.6
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本综述系统评估了多重PCR(multiplex PCR)技术在α-地中海贫血(α-thalassemia)常见突变检测中的诊断价值。研究通过优化三管多重PCR体系,实现了对--SEA、-α3.7、αCSα等9种常见突变的高效检测,在泰国和韩国人群样本中验证显示与MLPA(multiplex ligation-dependent probe amplification)和Sanger测序结果高度一致(吻合率99.92%-100%)。该方法具有快速、低成本、操作简便等优势,为α-地中海贫血的群体筛查和临床诊断提供了可靠工具。
α-地中海贫血(α-thalassemia)是一种常见的遗传性血红蛋白病,其特征是α-珠蛋白链合成减少或缺失。正常个体每个染色体携带两个α-珠蛋白基因,疾病的严重程度与受影响等位基因的数量相关。单个α-珠蛋白基因缺失的个体为无症状携带者,两个基因缺失表现为α-地中海贫血特征,三个基因失活导致血红蛋白H病(Hb H disease),而四个α-珠蛋白基因全部缺失则引发最严重的Hb Bart's水肿胎综合征(Hb Bart’s hydrops fetalis syndrome),常导致胎儿出生后死亡。α-地中海贫血的病因主要包括缺失性突变和非缺失性突变,其中--SEA、--FIL、--THAI等缺失类型在东南亚地区常见,而Hb Constant Spring(Hb CS)和Hb Paksé(Hb PS)等非缺失性突变则通过影响终止密码子导致α链延长和血红蛋白不稳定。
研究收集了2017年至2022年期间的2121份样本,包括来自泰国的1261例基因组DNA样本、韩国本地人群的300例样本以及居住在韩国的不同族裔人群的560例样本。DNA提取使用QIAamp DNA Blood Mini Kit,并通过NanodropOne检测纯度。研究优化了多重PCR体系,将其分为三组试剂盒(Kit A、B、C),分别针对不同的突变类型。Kit A检测--SEA、--FIL和--THAI缺失;Kit B检测-α3.7、-α4.2、--20.5和--MED缺失,并以ABL1基因作为内参;Kit C检测Hb CS和Hb PS非缺失性突变。PCR反应条件包括95°C初始活化15分钟,随后35个循环的95°C 1分钟、65°C 1分钟和72°C 2分钟30秒,最终72°C延伸10分钟。扩增产物通过2%琼脂糖凝胶电泳分析。同时,研究使用MLPA试剂盒P140-C1 HBA和Sanger测序作为对照方法,验证多重PCR结果的准确性。
在泰国样本中,α-珠蛋白基因突变等位基因的总检出率为33.7%(851/2522),其中-α3.7缺失最为常见(18.6%),其次是--SEA缺失(7.9%)和αCSα突变(5.6%)。新开发的多重PCR试剂盒与泰国本地试剂盒的总体一致率达到99.92%,仅一例复合杂合子(-α3.7/-α4.2)存在差异。在韩国外籍人群样本中,5.89%(33/560)被鉴定为α-地中海贫血健康携带者,其中-α3.7缺失型占比最高(3.93%),而所有韩国本地样本均未检出突变。血液学参数分析显示,--SEA缺失携带者的血红蛋白(Hb)、平均红细胞体积(MCV)和平均血红蛋白含量(MCH)异常比例显著高于-α3.7缺失携带者,提示--SEA缺失的临床影响更为显著。
MLPA和Sanger测序验证结果显示,新开发的多重PCR方法在所有突变类型中的检测灵敏度为98.9%-100%,特异性均为100%。Cohen's kappa一致性分析表明,除-α3.7缺失的kappa值为0.996外,其余突变类型的kappa值均为1.0。此外,研究还发现--SEA缺失的断点位置(chr16: c.165397–c.184700)与部分数据库记录存在差异,提示地区特异性突变需在诊断中加以注意。
本研究成功开发了一种快速、经济、操作简便的多重PCR方法,用于α-地中海贫血的常见突变检测。与传统MLPA和Sanger测序相比,该方法在保持高准确性的同时大幅降低了时间和成本需求。通过对比泰国、韩国及在韩外籍人群的突变分布,研究证实--SEA和-α3.7缺失是东南亚地区的主要突变类型,而韩国本地人群的突变携带率极低。然而,随着全球人口流动增加,α-地中海贫血的筛查在低流行区(如韩国)也逐渐显现其重要性。本方法的推广将有助于实现α-地中海贫血的早期诊断和预防,特别是在资源有限地区。未来需进一步优化试剂盒以覆盖更多罕见突变类型,并推动其纳入临床指南。
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