阿留申海沟及邻近海域深渊桡足类多样性：宏条形码揭示超深渊带小型底栖生物分布新见解

《Progress in Oceanography》：Hadal copepods in and around: A metabarcoding Survey of meiofauna in the Aleutian trench and adjacent regions

本研究采用多基因宏条形码技术（CO1和18S V1V2），首次系统解析阿留申海沟及邻近海域小型底栖生物群落结构。研究发现海沟与深渊栖息地存在显著群落分化，叶绿素a（Chl-a）和总有机碳（TOC）是驱动群落构建的关键环境因子。研究通过构建桡足类定制参考基因库，发现8个OTU跨海沟分布，证明海沟并非绝对扩散屏障，为深渊生物地理学提供了新证据。

　　

研究区域、采样与处理

采样于2022年7月至9月在东北太平洋进行。在阿留申生物考察航次SO293期间，使用多管采样器（MUC）对阿留申海沟、邻近深渊区域及白令海进行了采样。共设置13个站点：白令海2个、海沟北缘3个、海沟南缘3个以及海沟内部5个（图1）。每个站点部署两次MUC。

宏条形码分析

本研究共分析70个CO1样本和71个18S V1V2样本：两种标记各来自白令海的11个样本，北缘各17个，海沟内部CO1样本32个、V1V2样本31个，南缘CO1样本10个、V1V2样本12个。由于扩增失败，有3个提取样本仅用于CO1分析，4个仅用于V1V2分析。CO1标记在5、8、9号站点有额外样本，而V1V2标记在...

跨遗传标记与深度带的小型底栖生物群落比较

本研究结果显示，两种遗传标记（CO1和18S V1V2）均检测到不同地理位置间小型底栖生物群落组成的显著差异，但具体模式因标记而异。尽管两种标记一致揭示了深渊与超深渊群落的分离，但更精细的模式——例如白令海与其他区域的区分——在CO1数据集中更为明显。这些差异部分可归因于...

结论

遗传标记的选择强烈影响着可检测到的类群以及群落组成的解析程度。某些类群在一种标记下更具优势，而其他类群可能因引物偏好性或扩增效率问题而未被检测到。同一采样站点的重复样本间OTU组成也存在差异，并且整体多样性模式在不同站点间有所不同，具体取决于目标基因。尽管存在这些差异，CO1和18S V1V2均一致揭示了清晰的...