脂膜动力学的任意拉格朗日-欧拉有限元方法:从管状结构形成到横向迁移的数值模拟突破

《Journal of Fluid Mechanics》:Arbitrary Lagrangian–Eulerian finite element method for lipid membranes

【字体: 时间:2025年10月16日 来源:Journal of Fluid Mechanics 3.9

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  本研究针对脂膜在变形过程中网格运动控制的难题,提出了任意拉格朗日-欧拉有限元方法,通过引入网格速度满足用户指定的二维材料动力学方程,并采用拉格朗日乘子约束膜面与网格运动一致性。该方法成功模拟了从平面膜片提取膜管及其横向迁移的全过程,突破了传统拉格朗日和欧拉方法的局限,为生物膜动态过程研究提供了新工具。

  
在细胞生物学中,脂质膜作为二维流体材料,其动态形变过程(如内吞作用和细胞迁移)的模拟一直面临计算挑战。传统拉格朗日方法因网格畸变难以模拟平面流动,而欧拉方法在管状结构形成等场景中易失效。德克萨斯大学奥斯汀分校的Amaresh Sahu团队在《Journal of Fluid Mechanics》发表研究,提出了基于任意拉格朗日-欧拉框架的有限元方法,通过将网格视为独立材料并约束其与膜面运动一致性,实现了膜管提取与迁移的高精度模拟。
关键技术方法包括:1)建立膜面参数化映射关系,定义膜速度v与网格速度vm的动力学方程;2)采用Dohrmann-Bochev稳定法处理拉格朗日乘子引起的数值不稳定;3)通过B样条基函数离散曲面,结合牛顿-拉夫森法求解非线性系统。研究以膜管提取为基准案例,对比了拉格朗日、欧拉和ALE三种网格运动方案。
曲面几何与运动学建模
通过参数化域Ω到膜片??的映射,建立切平面基向量aα?和曲率张量bα?β?的几何描述。引入ALE运动学约束条件(vm·n = v·n),使网格可独立于脂质流动而运动。
质量守恒与数值稳定
基于面积不可压缩性(?s·v = 0),采用拉格朗日乘子λ(表面张力)施加约束。通过将λ投影到分段线性不连续空间,抑制了LBB条件引起的数值振荡。
动量平衡与边界条件
耦合弯曲弹性(弯曲模量kb、kg)与粘性耗散(膜粘度ζ),推导出包含曲率-粘度耦合项的形变方程。边界条件涵盖力/速度约束(Fj或vj)和弯矩/斜率约束(M或vv)。
膜管提取动力学
在Γ=1024(F?ppl-von Kármán数)和SL=0.1(Scriven-Love数)条件下,ALE方法成功捕获了帐篷结构向柱状膜管(半径rc=√(kb/(2λ0)))的形态转变。拉格朗日模拟出现张力伪影(λmin=0.191kb/rc2),而ALE-vb方案获得平滑张力梯度(λmin=0.249kb/rc2)。
膜管横向迁移
通过预设网格速度vm=vpex,实现膜管沿x方向平移。模拟显示迁移过程中表面张力分布稳定,证实ALE方法能解析非对称流动模式。
研究结论表明,ALE有限元方法通过自定义网格本构关系(如粘性-弯曲阻力),突破了传统方法在膜管迁移模拟中的局限性。该框架为囊泡运输、内质网动态等生物过程建模提供了通用计算平台,未来可扩展至多组分膜相分离、跨膜蛋白扩散等场景。
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