蚁科昆虫信息化学物质作为潜在JAK1抑制剂的计算机模拟研究：虚拟筛选与分子动力学分析

《Computational Biology and Chemistry》：Computational Insights into Insect-Derived Semiochemicals from Formicidae Family as Potential JAK1 Inhibitors: Virtual Screening and Molecular Dynamics Studies

本文通过虚拟筛选、分子对接和分子动力学模拟，发现蚁科昆虫信息化学物质中3-甲基-4-苯基吡咯等化合物对JAK1激酶结构域具有高结合亲和力（ΔGbind = -48280.465 kJ/mol），其结合能力优于临床抑制剂阿布西替尼（Abrocitinib），为开发新型抗炎药物提供了天然分子库资源。

　　

Section snippets

Accession and preparation of protein

人类JAK1（UniProt ID P23458）的晶体结构从RCSB蛋白质数据库获取（PDB ID 6BBU），该X射线晶体结构以2.08 ?分辨率呈现JAK1与阿布西替尼（化合物25，配体ID D7D）的复合物状态。阿布西替尼（PF-04965842）被选为本研究的参考配体。

Re-docking analysis

为验证分子对接方案的可靠性，我们对天然配体阿布西替尼进行了再对接分析。将提取的配体重新对接至JAK1的ATP结合口袋，使用与测试配体相同的网格参数和对接算法。

再对接构象与实验晶体构象的叠合结果显示高度一致，验证了对接参数设置的合理性。

Conclusion

本研究提示蚁科信息化学物质具备成为JAK抑制剂的潜力，为探索其作为新型JAK1抑制剂的开发奠定基础。昆虫来源的信息化学物质有望为抗微生物、抗癌、神经保护和抗炎疗法开辟新途径，应对当今重大医学挑战。

Uncited references

未引用参考文献节略

Funding

作者感谢印度生物技术部（DBT）对项目的资金支持（项目编号BT/PR45221/NER/95/1924/2022）

Author Statement

作者声明使用Grammarly进行语法修正，并对内容完整性负责

CRediT authorship contribution statement

（贡献声明节略）

Declaration of Competing Interest

作者声明无利益冲突

Acknowledgement

致谢CSIR-NEIST研究所及印度政府支持（稿件编号CSIR-NEIST/PUB/2025/102）

Declaration of competing interest

利益冲突声明节略