基于乳酸化的胃癌预后模型构建及DHRS7在肿瘤微环境中的双重作用机制研究

《BMC Medical Genomics》:Construction and validation of a lactylation-based gene signature for prognostic assessment and immune infiltration analysis in gastric adenocarcinoma

【字体: 时间:2025年10月17日 来源:BMC Medical Genomics 2

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  本研究针对胃癌(STAD)预后预测指标不足的临床难题,构建了基于乳酸化相关基因(LRGs)的六基因预后特征模型。通过LASSO回归分析发现DHRS7等关键基因表达与患者生存显著相关,实验验证表明DHRS7在晚期STAD中通过调控PI3K/AKT/mTOR信号通路和免疫细胞浸润促进肿瘤进展。该研究为STAD的预后评估和靶向治疗提供了新的生物标志物和理论依据。

  
在全球癌症相关死亡原因中,胃癌始终位居前列,其中胃腺癌(STAD)约占胃癌病例的95%。尽管手术联合辅助治疗已成为临床标准方案,但复发或转移性STAD患者的五年生存率仍不理想。这一严峻现状亟需开发新的预后预测模型和治疗策略。
近年来,乳酸化(lactylation)作为一种新型蛋白质翻译后修饰方式,在肿瘤代谢重编程和基因表达调控中展现出重要作用。乳酸作为糖酵解产物,可通过修饰组蛋白和非组蛋白的赖氨酸残基,影响肿瘤发生发展和肿瘤微环境(TME)塑造。然而,乳酸化相关基因(LRGs)在STAD中的具体作用机制尚不明确。
在此背景下,研究人员在《BMC Medical Genomics》上发表了最新研究成果。该研究通过整合TCGA-STAD数据库的转录组数据,系统分析了LRGs的表达谱,并构建了具有临床预测价值的预后模型。特别聚焦于脱氢酶/还原酶7(DHRS7)这一关键基因,通过多组学分析和实验验证,揭示了其在STAD进展中的动态变化规律和分子机制。
研究采用的关键技术方法包括:从TCGA数据库获取375例STAD患者的RNA转录组数据;通过LASSO回归分析构建六基因预后特征模型;利用四种免疫浸润算法(EPIC、QUANTISEQ、MCPCOUNTER、TIMER)评估基因表达与免疫细胞浸润的关联;收集28对临床STAD组织样本进行实验验证;通过细胞转染、CCK-8、EdU、Transwell等实验探讨DHRS7的生物学功能。
乳酸化相关差异表达基因在STAD中的鉴定
研究人员首先筛选出12个与STAD预后相关的LRGs,其中ALB在肿瘤组织中表达上调,而KRT1、CBR1等11个基因表达下调。这些基因构成了后续预后模型构建的基础。
基于TCGA队列的预后模型构建
通过LASSO回归分析,研究团队最终确定了包含DHRS7、NOP2、CRABP2、CALD1、ALB和RIMS1的六基因预后模型。风险评分显示,高危组患者生存时间显著缩短,模型在1、3、5年的AUC值分别为0.611、0.608和0.604,显示出良好的预测效能。
LRG特征的预后价值
多因素Cox分析显示,DHRS7表达、pN分期和pM分期是STAD的独立预后因素。基于这些指标构建的列线图在1、2、3、5年的预测准确性较高,为临床个体化预后评估提供了实用工具。
乳酸化相关差异表达基因与免疫细胞浸润
四种免疫浸润算法分析显示,DHRS7与巨噬细胞浸润呈正相关,CALD1在所有分析方法中均与巨噬细胞浸润正相关。这些发现提示LRGs可能通过调节肿瘤免疫微环境影响STAD的进展和预后。
乳酸化相关差异表达基因DHRS7的预后研究
尽管DHRS7在STAD组织中的整体表达水平低于正常组织,但在IV期患者中的表达显著高于II期和III期。伴有淋巴结转移的患者同样显示较高的DHRS7表达和较差的预后,表明DHRS7在STAD进展过程中可能发挥促癌作用。
DHRS7对STAD中不同信号通路的影响
GO和KEGG富集分析显示,DHRS7主要参与EGF/EGFR、TGF-β、IL-4和PI3K-AKT信号通路。进一步的相关性分析表明,DHRS7表达与粘蛋白型O-聚糖生物合成、不饱和脂肪酸生物合成、铁死亡及PI3K/AKT/mTOR通路等显著相关。
DHRS7敲低和过表达对STAD细胞的影响
实验验证显示,STAD组织中DHRS7表达显著低于癌旁组织。细胞功能实验表明,敲低DHRS7可促进HGC-27和AGS细胞的增殖、迁移和侵袭能力,而过表达则产生相反效应,证实了DHRS7在STAD进展中的重要调控作用。
本研究创新性地构建了基于LRGs的STAD预后特征模型,并深入探讨了DHRS7在STAD进展中的双重作用机制。研究发现,尽管DHRS7在STAD组织中整体表达下调,但在晚期肿瘤中表达升高,并通过调节PI3K/AKT/mTOR信号通路和免疫细胞浸润促进肿瘤进展。这一发现为理解STAD的发病机制提供了新视角,也为开发针对乳酸化相关靶点的治疗策略奠定了理论基础。该研究不仅为STAD的预后评估提供了新的生物标志物,也为个体化治疗方案的制定提供了潜在靶点。
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