STBD1介导糖原与脂滴相互作用促进肾透明细胞癌进展的机制研究
《Cell Reports》:STBD1 mediates the crosstalk between glycogen and lipid droplets in clear cell renal cell carcinoma
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时间:2025年10月17日
来源:Cell Reports 6.9
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本研究针对肾透明细胞癌(ccRCC)中糖原和脂滴(LD)异常积累但相互作用机制不清的问题,通过蛋白质组学和邻近标记技术发现STBD1通过N端豆蔻酰化锚定脂滴并介导糖原-脂滴互作,调控糖噬(glycophagy)和脂噬(lipophagy)协同维持脂滴稳态,其缺失可增强铁死亡(ferroptosis)敏感性并抑制肿瘤生长,为ccRCC提供了潜在治疗靶点。
肾透明细胞癌(ccRCC)是肾脏癌中最常见且最具侵袭性的亚型,其最典型的病理特征就是癌细胞质内大量堆积的糖原(glycogen)和脂质,后者主要以脂滴(lipid droplets, LDs)的形式储存。尽管这种独特的代谢表型在一个多世纪前就被发现,但驱动其形成的分子机制,尤其是糖原和脂滴这两种能量储存细胞器之间是否存在功能上的“对话”,长期以来一直是个谜。理解这种“对话”对于揭示ccRCC的发病机制和开发新的治疗策略至关重要。以往的研究多集中于VHL-HIF信号轴在驱动脂质沉积中的作用,而对糖原积累的生物学意义及其与脂滴代谢的关联关注较少。近期有研究提示,在棕色脂肪细胞中,糖原的分解可能为脂滴的生成提供原料,但这背后的具体分子桥梁在癌症中仍是空白。
为了回答这些关键问题,来自郑州大学附属肿瘤医院、天津大学等机构的研究团队在《Cell Reports》上发表了他们的最新研究成果。他们发现,一个名为STBD1(淀粉结合域蛋白1)的糖原结合蛋白,意外地出现在脂滴上,并像一座“分子桥梁”一样,介导了糖原与脂滴的相互作用,进而协同调控两者的生成与降解,最终影响ccRCC的肿瘤生长和对铁死亡的敏感性。这项研究不仅揭示了ccRCC代谢异常的一个核心机制,也为靶向代谢通路治疗癌症提供了新的思路。
研究人员主要运用了以下几项关键技术:首先,他们对50例ccRCC肿瘤组织和18例正常肾组织进行了液相色谱-串联质谱(LC-MS/MS)蛋白质组学分析,系统描绘了ccRCC的代谢重编程图谱。其次,他们利用基于TurboID的邻近标记技术,在活细胞中对脂滴表面的蛋白质组(即脂滴蛋白组)进行了高通量鉴定。此外,研究还结合了细胞生物学手段(如基因敲低、过表达、免疫荧光共定位)、脂质组学分析、以及体内外的功能实验(如细胞增殖、侵袭、小鼠异种移植瘤模型)来深入探究STBD1的功能。
ccRCC肿瘤的蛋白质组景观揭示糖原和脂滴代谢的重编程
通过对临床样本的蛋白质组学分析,研究人员发现ccRCC肿瘤组织与正常肾组织之间存在显著的蛋白表达差异。上调的蛋白显著富集于糖酵解、糖原代谢和脂滴相关通路。关键蛋白如糖原合成酶(GYS1)、糖原磷酸化酶(PYGL)、脂滴包被蛋白PLIN2等均显著上调。尤为重要的是,与糖噬(如STBD1, SQSTM1)和脂噬(如LIPA)相关的蛋白也同步升高,提示这两种选择性自噬过程在ccRCC中被共同激活。这为研究糖原与脂滴的交叉对话提供了初步线索。
为了更精确地鉴定与脂滴直接相关的蛋白质,研究团队在ccRCC细胞系中表达了靶向脂滴的HILPDA-TurboID融合蛋白,通过生物素标记和亲和纯质谱,成功绘制了ccRCC细胞的脂滴蛋白组。他们鉴定出420个候选的脂滴相关蛋白,其中不仅包含了已知的脂滴蛋白(如PLIN2, PLIN3, PNPLA2等),还发现了许多新的潜在成员。令人意外的是,糖原结合蛋白STBD1被显著富集在脂滴蛋白组中,暗示了其可能同时与糖原和脂滴存在关联。
免疫荧光染色证实了STBD1在多种ccRCC细胞系中与脂滴共定位。利用荧光标记的葡萄糖类似物(2-NBDG)标记糖原,研究人员首次在活细胞中直观观察到糖原簇与脂滴的紧密相邻。在ccRCC组织切片中,也观察到了STBD1、脂滴和糖原的富集及共定位现象。机制探索表明,STBD1通过其N端的豆蔻酰化(myristoylation)修饰锚定到脂滴膜上。当抑制豆蔻酰化或敲低STBD1后,糖原与脂滴的相互作用被破坏。这些结果证明STBD1是连接糖原和脂滴的关键分子。
敲低STBD1导致ccRCC细胞中脂滴数量减少、平均尺寸增大,同时伴随脂滴标志物PLIN2和HILPDA的下调。活细胞成像显示,STBD1缺失导致脂滴与内质网(ER)的关联减少,提示脂滴生成受损。生化检测发现,STBD1敲低细胞内甘油三酯(TG)和总胆固醇(TC)水平下降,而糖原出现积累。相反,过表达STBD1则增加了脂滴的丰度以及TG和TC水平。这表明STBD1对于ccRCC中的脂滴生物合成至关重要。
STBD1是已知的糖噬受体。本研究发现,敲低STBD1不仅影响糖噬,还损害了脂滴与溶酶体的共定位,减少了被LC3阳性自噬体包裹的脂滴比例,并降低了游离脂肪酸(FFA)水平,说明脂噬过程也受到抑制。进一步机制研究表明,STBD1通过其LC3相互作用区(LIR)基序与ATG8家族蛋白(如GABARAPL1)结合,从而促进脂滴被招募至自噬通路。当引入LIR基序突变体(STBD1-W203Q)时,其无法恢复STBD1敲低细胞中脂滴与自噬体/溶酶体的关联。更重要的是,活细胞三色标记显示,糖原、脂滴和溶酶体在ccRCC细胞中存在稳定的三元共定位,而这种协同作用依赖于STBD1。这表明STBD1协调了糖原和脂滴的协同自噬降解。
定量蛋白质组学和脂质组学提示STBD1在自噬和脂质代谢中的作用
对STBD1敲低细胞进行的定量蛋白质组学分析显示,大量与自噬(如LC3A, OPTN, SQSTM1, ATG2B)和脂质代谢(如SCD, FADS1, ANGPTL4)相关的蛋白表达下调。脂质组学分析进一步揭示,STBD1敲低导致多种脂类,特别是甘油三酯合成的前体(如单酰甘油、二酰甘油)含量下降,而含多不饱和脂肪酸(PUFA)的磷脂(如磷脂酰胆碱PC)水平相对上升。这些分子层面的变化为理解STBD1如何影响细胞脂质稳态提供了数据支持。
脂滴在抵抗氧化应激和铁死亡中发挥重要作用。鉴于STBD1敲低导致脂滴减少和PUFA磷脂积累,研究人员推测其可能增加细胞对铁死亡的敏感性。实验证实,STBD1敲低细胞对铁死亡诱导剂RSL3的处理更为敏感,表现出更强的脂质过氧化和细胞死亡。此外,STBD1敲低还损害了细胞ATP生成、增殖和侵袭能力。在动物实验中,STBD1敲低显著抑制了小鼠异种移植瘤的生长,并且对RSL3处理表现出更强的抑制效果。重新引入野生型STBD1(STBD1-WT)能部分挽救这些表型,而豆蔻酰化缺陷突变体(STBD1-G2A)则不能,证明了STBD1的脂滴定位对其功能至关重要。
本研究通过多组学整合分析,揭示了STBD1是ccRCC中连接糖原代谢与脂滴稳态的核心分子。其工作机制可以概括为:STBD1通过N端豆蔻酰化锚定于脂滴,同时利用其糖原结合能力,将糖原“拉近”脂滴,从而介导了两种细胞器之间的物理和功能联系。一方面,STBD1促进由糖原分解支持的脂滴生物合成;另一方面,它又通过其LIR基序招募自噬 machinery,协同调控糖噬和脂噬,完成脂滴的降解与更新。这种精细的调控确保了ccRCC细胞在能量应激下的脂滴动态平衡。破坏这一平衡(如敲低STBD1)会导致脂滴代谢紊乱,脂质组成改变,从而增加对铁死亡的敏感性,并最终抑制肿瘤生长。
该研究的重大意义在于:首先,它首次在分子水平阐明了ccRCC特征性病理改变——糖原和脂滴共积——背后的内在联系,将以往认为相对独立的两个代谢过程有机地联系起来。其次,它发现并验证了STBD1这一之前主要与糖原代谢相关的蛋白,在脂滴生物学和肿瘤进展中的全新功能,拓展了对其认知。最后,研究结果表明,靶向STBD1或其介导的糖原-脂滴轴,可能成为治疗ccRCC的新策略,特别是与诱导铁死亡的疗法联用,有望产生协同抗肿瘤效果。总之,这项研究为理解癌症代谢提供了新颖的视角,并为开发新的治疗途径奠定了坚实的理论基础。
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