巴基斯坦东北部阿扎德查谟和克什米尔地区烟草脆裂病毒(TRV)的流行情况及分子特征分析

《Potato Research》：Incidence and Molecular Characterization of Tobacco Rattle Virus (TRV) in Azad Jammu and Kashmir-Northeast of Pakistan

本研究聚焦巴基斯坦东北部阿扎德查谟和克什米尔地区(AJK)三个主要马铃薯产区（Poonch、Sudhnoti和Bagh）的烟草脆裂病毒(TRV)问题。来自该地区的研究人员通过DAS-ELISA和RT-PCR技术，首次系统评估了TRV的流行分布，发现Poonch地区感染率最高（DAS-ELISA达55.6%），并成功对本地分离株TRV-Pak进行了分子鉴定，揭示其与美国分离株亲缘关系最近，为追溯病毒传播路径及制定防控策略提供了关键科学依据。

　　

一项旨在确定烟草脆裂病毒（Tobacco Rattle Virus, TRV）在巴基斯坦东北部阿扎德查谟和克什米尔（Azad Jammu and Kashmir, AJK）地区三个主要马铃薯种植区（Poonch、Sudhnoti 和 Bagh）发生率和分布的研究得以开展。TRV的流行情况是根据其在马铃薯块茎上特征性的内部和外部症状进行报告的，并通过双抗体夹心酶联免疫吸附测定（Double Antibody Sandwich-Enzyme-Linked Immunosorbent Assay, DAS-ELISA）和逆转录聚合酶链式反应（Reverse Transcription-Polymerase Chain Reaction, RT-PCR）进行了确认。结果证实，在所有调查区域均存在TRV及其相关的线虫媒介。在三个地区中，平均感染率最高的地区记录为Poonch，其次是Sudhnoti和Bagh地区。在Poonch地区，基于外部和内部症状的平均病毒发生率分别为55.40%和58.07%。在Sudhnoti地区，平均发生率为47.20%（外部）和49.24%（内部），而Bagh地区基于症状的平均发生率为45.59%（外部）和48.47%（内部）。DAS-ELISA结果也证实了TRV的高发生率，显示Poonch地区的平均发生率为55.6%，其次是Sudhnoti地区（46.4%）和Bagh地区（38.4%）。研究人员对一个新鲜的TRV分离株（TRV-Pak）进行了分子 characterization，通过对编码16 kDa蛋白基因的463 bp基因组区域进行测序，并将该巴基斯坦分离株的系统发育状态与全球已报道的TRV序列进行了比较。TRV-Pak的核苷酸序列与全球报道的已发表TRV序列的相似性为89.5%至95.68%，而在ORF4编码区的氨基酸序列相似性范围则为84.55%至93.57%。在核苷酸水平上，TRV-Pak与来自美国加利福尼亚州和佛罗里达州的TRV分离株（登录号MH614641和AF055912）具有最高的序列相似性。而序列同一性最低的则是一个来自德国的分离株（感染马铃薯的Ina分离株，登录号KT033403）。这种与美国分离株的相似性，可能与20世纪80年代早期该地区进口马铃薯种质资源有关。