综述:关于碳青霉烯酶活性的结构洞察:理解现有抑制剂的作用机制并为新型碳青霉烯佐剂的设计提供信息

《RSC Medicinal Chemistry》:Structural insights into the activity of carbapenemases: understanding the mechanism of action of current inhibitors and informing the design of new carbapenem adjuvants

【字体: 时间:2025年10月18日 来源:RSC Medicinal Chemistry 3.6

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  本综述深入探讨了碳青霉烯酶(包括丝氨酸酶和金属酶(MBL))的结构特征与耐药机制,系统总结了已上市(如avibactam、vaborbactam)及在研β-内酰胺酶抑制剂(BLI)对临床重要碳青霉烯酶(如KPC、NDM)的抑制效力,为针对耐药菌(尤其是产金属酶病原体)的新型佐剂研发提供了关键结构见解。

  

碳青霉烯酶的耐药挑战

抗菌药物耐药性(AMR)正严重挑战碳青霉烯类抗生素作为最后一线疗法的有效性,其核心机制源于病原体产生的碳青霉烯酶。这类酶主要包括丝氨酸β-内酰胺酶(SBL)和金属β-内酰胺酶(MBL)两大类,能够水解碳青霉烯类药物的β-内酰胺环,导致药物失活。目前临床应用的β-内酰胺酶抑制剂(BLI),如克拉维酸、舒巴坦、他唑巴坦、阿维巴坦(avibactam)、瑞来巴坦(relebactam)和瓦博巴坦(vaborbactam),对丝氨酸酶(如KPC型)有效,但对依赖锌离子的金属酶(如NDM、VIM型)却无抑制活性,这构成了当前抗耐药菌治疗的一大局限。

酶学机制与结构基础

碳青霉烯酶的功能活性高度依赖于其三维结构特征。丝氨酸β-内酰胺酶(如KPC-2)通过活性位点的丝氨酸残基对β-内酰胺环发起亲核攻击,形成共价酰基酶中间体,最终导致药物水解。而金属β-内酰胺酶(如NDM-1)则利用一个或两个锌离子激活水分子,使之对β-内酰胺环进行水解,这一机制不依赖于丝氨酸,且不能被传统BLI所抑制。结构生物学研究显示,MBL的活性位点具有宽而浅的底物结合沟,能够容纳多种β-内酰胺类药物,而丝氨酸酶的活性口袋则相对狭窄,这种结构差异直接影响抑制剂的结合与效力。

现有抑制剂的效力与局限

目前已获批的BLI主要针对A类丝氨酸碳青霉烯酶。阿维巴坦(avibactam)是一种非β-内酰胺类抑制剂,可通过形成可逆的共价复合物抑制KPC等酶活性;瓦博巴坦(vaborbactam)则是基于硼酸机制的有效抑制剂。然而,这些药物均对MBL无效。值得注意的是,一些正在研发中的新型抑制剂(如taniborbactam、cefepime/zidebactam组合)展现出对部分B类MBL的抑制潜力,但其临床适用性仍在评估中。

新型抑制剂设计与未来方向

针对MBL的有效抑制是当前研究的焦点。由于MBL活性位点具有锌离子结合域,理想抑制剂应具备强效锌螯合能力,同时保持足够的选择性和安全性,避免对人体金属酶产生抑制。结构导向的药物设计(SBDD)和高通量筛选已发现多个有潜力的先导化合物,其中一些能同时靶向丝氨酸酶和金属酶,即所谓“双功能抑制剂”。此外,佐剂策略——即联合使用抗生素与酶抑制剂——正成为恢复碳青霉烯类药物疗效的重要途径。

临床意义与转化前景

碳青霉烯耐药菌(如产碳青霉烯酶的肺炎克雷伯菌、铜绿假单胞菌和鲍曼不动杆菌)引起的感染与高死亡率相关。理解碳青霉烯酶的结构与机制不仅有助于开发新一代BLI,也对指导临床用药、优化联合治疗方案具有重要意义。未来研究需进一步整合结构生物学、计算化学与药理学手段,推动具有广谱抑制活性的候选药物走向临床,以应对日益严峻的全球耐药挑战。
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