基于Sombor指数与Sombor能量的神经递质分子网络谱界研究及其在化学信息学中的应用

《BioSystems》:Spectral bounds for Sombor and Sombor energy indices: A graph-theoretic study of neurotransmitter molecular networks

【字体: 时间:2025年10月18日 来源:BioSystems 1.9

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  本文首次将新兴的Sombor指数(SO)及其谱扩展Sombor能量(SOE)应用于神经递质分子图的结构复杂性分析。通过建立度基、谱半径和Frobenius范数边界,揭示了Sombor描述符对分子不规则性、分支结构和芳香性的独特敏感性。研究发现,抑制性(如甘氨酸、GABA)与兴奋性/调节性(如多巴胺、5-羟色胺)神经递质的Sombor指标存在显著差异,表明其能够捕捉与生物功能相关的分子组织特征。该研究为神经化学系统的结构-功能关系分析提供了新的量化框架。

  
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相关研究
化学图论的快速发展催生了多种拓扑指数和谱描述符,每种都旨在捕捉分子图的不同结构或功能特征。为明确本文贡献,我们总结了四类相关研究:经典指数、不规则性度量、Sombor指数的谱扩展以及生物分子应用。
神经递质的图表示
每个神经递质分子均表示为简单分子图G=(V,E),其中V为非氢原子集合,E为共价键集合。分子结构源自PubChem数据库,并转换为氢抑制的图表示。这种标准抽象强调骨架连接性,与基于度的拓扑指数和谱描述符高度相关。
神经递质的分子结构与分子图
参见图1至图7。
Sombor指数与Sombor能量
对于...
Sombor指数的度基边界
定理4.1
设G=(V,E)为简单连通图,边数m=|E|,最小度δ,最大度Δ。则m√2 δ ≤ SO(G) ≤ m√2 Δ,其中SO(G)=∑uv∈E√(d(u)2+d(v)2)
证明
对每条边uv∈E(G),有 √(d(u)2+d(v)2) ≥ √(δ22)=√2 δ,且 √(d(u)2+d(v)2) ≤ √(Δ22)=√2 Δ。对m条边求和即得目标不等式。□
涉及邻接矩阵的谱边界
定理4.2
设G为分子图,最大顶点度Δ,最小顶点度δ,λ1表示其邻接矩阵A(G)的谱半径(最大特征值)。则Sombor指数满足...
可视化图表
为补充数值表格和理论分析,我们提供了结果的图形表示。这些图表用于两个目的:(i)验证定理4.1–4.3中推导的不等式;(ii)展示跨神经递质的、具有生物学解释性的聚类模式。
结论
在本研究中,我们根据主要神经递质的功能角色——抑制性、兴奋性/调节性和中间型——对其进行了分类,并使用基于Sombor的图描述符分析了它们的结构特性。图论指数与功能分类的结合揭示了明显的聚类模式,如散点图所示。抑制性神经递质(如甘氨酸GABA) consistently表现出较低的描述符值,而...
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