基于计算生物学的散沫花源五环廿烷酮作为猴痘病毒H1磷酸酶抑制剂的创新研究
《In Silico Pharmacology》:Pentacyclo-icosan‐19′-one compound from Lawsonia inermis as monkeypox virus H1 phosphatase inhibitor: molecular docking, density functional theory, and molecular dynamics simulation studies
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时间:2025年10月19日
来源:In Silico Pharmacology
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本研究针对猴痘病毒(MPXV)的公共卫生威胁,通过计算生物学方法筛选印度本草物质库,发现散沫花来源的先导化合物3对MPXV H1磷酸酶具有优异抑制潜力。分子对接显示其结合能低至-8.2 kcal/mol,分子动力学模拟证实复合物在200 ns内结构稳定(结合能-96.02±1.00 kJ/mol),显著优于阳性对照。该研究为抗MPXV药物开发提供了新候选分子。
在全球猴痘病毒(MPXV)卷土重来的公共卫生危机背景下,科研人员采用计算生物学策略,从印度本草物质库约5万种天然化合物中筛选MPXV H1磷酸酶抑制剂。通过分子对接技术初步锁定12,800个具有显著结合活性的化合物,并精选10个苗头化合物深入解析。其中最具潜力的三种化合物结合能低至-8.2 kcal/mol,超越阳性对照抗霉素A(-6.1 kcal/mol)和特考韦瑞(-7.0 kcal/mol)。进一步采用密度泛函理论(DFT)优化揭示了这些化合物的独特电子性质,重新对接验证了结合模式。分子动力学(MD)模拟结果表明,先导化合物3与靶点的复合物在200纳秒模拟中保持结构稳定,结合自由能达-96.02±1.00 kJ/mol,显著优于对照组的抗霉素A(-23.59±2.97 kJ/mol)和特考韦瑞(-49.07±1.46 kJ/mol)。特别值得关注的是,先导化合物3来源于传统药用植物散沫花(Lawsonia inermis),这为开发抗MPXV新型治疗剂提供了极具前景的候选分子,为后续实验验证与药物研发奠定了坚实基础。
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