泛癌种组织架构RNA特征解析：胶原网络与肿瘤进展的跨癌种关联

《British Journal of Cancer》：Pan-cancer analysis of RNA expression signatures associated with cancer tissue architecture

本研究针对癌症组织架构(CTA)的跨癌种系统性研究不足的问题，由研究人员通过分析TCGA数据库中28种癌型的593个CTA相关基因，鉴定了7种核心特征。研究发现，纤维胶原相关特征普遍存在，而细胞黏附相关特征具有组织特异性；进一步在肾癌中证实网络形成胶原与患者生存显著相关，动物实验揭示其扰动促进肿瘤生长。该研究为理解CTA组分如何共同影响癌症病理特征提供了重要见解。

　　

癌症的组织架构(CTA)与正常组织存在显著差异，并与肿瘤侵袭、免疫等特征密切相关。为系统解析CTA，研究人员对癌症基因组图谱(TCGA)计划中28种癌症类型的593个CTA相关基因表达数据进行了非负矩阵分解(Non-negative Matrix Factorization)，成功鉴定出七个独特的CTA特征。其中，与成纤维细胞及细胞外基质(ECM)相关的纤维胶原特征在多种癌型中普遍存在，体现了癌症的共性；而与细胞-细胞黏附或细胞-基质黏附相关的特征则表现出高度的组织特异性。这些发现在全基因组泛癌分析(PCAWG)数据、空间转录组学技术以及体内外模型中得到验证。特别在肾细胞癌(RCC)中，研究揭示了网络形成胶原与患者生存期存在强关联，小鼠实验进一步证实干扰该胶原表达会促进肿瘤生长。此外，分析还发现多种基因突变和拷贝数变异(CNAs)与CTA的改变相关。综上所述，癌症组织架构可被理解为多种组分的组合，这些组分共同影响着癌症的病理学特征。