HIV与狼疮肾炎共病机制的系统生物学研究：基于氧化应激和内质网应激的基因表达调控分析

《Future Virology》：Bioinformatics and system biology approach to identify the influences of HIV and LN on the regulation of gene expression

本研究针对HIV感染与狼疮肾炎(LN)共病机制不清的问题，通过生物信息学方法分析GEO数据库中的GSE81622(LN)和GSE195434(HIV)数据集，鉴定出22个共同差异表达基因(DEGs)并筛选出11个枢纽基因。研究发现GINS2基因对两种疾病具有高诊断价值(AUC:0.827-0.919)，功能富集显示这些基因主要参与核糖体和肿瘤相关通路，为临床诊疗提供了新的分子标志物和治疗靶点。

　　

通过生物信息学与系统生物学方法，研究人员深入探索了人类免疫缺陷病毒(HIV)与狼疮肾炎(LN)对基因表达调控的协同影响。该研究聚焦于两种疾病共有的氧化应激(OS)和内质网应激(ERS)分子机制。

实验团队从基因表达汇编(GEO)数据库中获取了LN数据集(GSE81622)和HIV数据集(GSE195434)，通过差异表达基因(DEGs)筛选鉴定出22个共同调控基因。随后开展免疫浸润分析和诊断性受试者工作特征(ROC)曲线评估，并运用京都基因与基因组百科全书(KEGG)和基因集富集分析(GSEA)进行功能注释。

研究结果显示，11个枢纽基因在蛋白质相互作用网络(PPIs)中呈现核心地位，其中关键基因GINS2对两种疾病展现出卓越的诊断效能(曲线下面积AUC达0.827-0.919)。功能富集分析表明这些基因主要参与核糖体生物发生和肿瘤相关信号通路。此外，研究还预测了5个相关微小RNA(miRNAs)和5个转录因子(TFs)的调控网络，并通过qPCR实验对枢纽基因进行了表达验证。

这项创新性工作为HIV合并LN患者提供了共享的分子标志物、治疗靶点及潜在药物研发方向，为临床精准诊疗策略制定提供了重要理论依据。