绿僵菌次级代谢产物生物合成基因簇在毒力中的作用：共表达网络与实验验证

《Fungal Biology》：GENE CLUSTERS POTENTIALLY INVOLVED IN THE VIRULENCE OF Metarhizium anisopliae

本文通过生物信息学分析和实验验证，系统研究了绿僵菌（Metarhizium anisopliae）生物合成基因簇（BGCs）在毒力中的作用。研究者利用共表达网络分析（WGCNA）和RT-qPCR技术，发现关键基因簇（如MaNRPS12）在感染过程中显著表达，为阐明真菌-昆虫互作机制及开发新型生物杀虫剂提供了重要见解。

　　

基因共表达网络分析、保守性分析和蛋白质互作网络

使用R包WGCNA（版本1.72）进行加权基因共表达网络分析，以检测共表达基因。研究人员从NCBI SRA（截至2022年5月）收集了总共23个代表不同腐生、胁迫和感染条件的RNA-Seq数据集（表1），并利用sra-tools进行处理。使用fastp对所得fastq文件进行默认选项的质量过滤。随后，将 reads 比对到绿僵菌E6基因组...

鉴定与感染相关的共表达模块

绿僵菌属物种对昆虫的感染依赖于多种毒力决定因子（包括次级代谢产物SMs）的产生。然而，与绿僵菌基因组中存在的数十个BGCs相比，仅有少数被证实与毒力相关。为了评估在感染过程中表达的BGCs，我们收集了不同绿僵菌物种在多种腐生或胁迫条件（包括感染）下的公开表达数据（表1）。

我们...

讨论

次级代谢产物的产生对许多真菌至关重要。就昆虫病原真菌而言，关于此类分子在毒力中作用的了解相对较少。例如，在绿僵菌基因组中预测的数十个BGCs中，只有少数被证实与感染有关。绿僵菌以其感染昆虫的能力而闻名。此外，这类真菌物种...