巴西马托格罗索州SARS-CoV-2基因组监测揭示病毒进化动态与流行波次成因

《General and Comparative Endocrinology》：Genomic surveillance of SARS-CoV-2 in the State of Mato Grosso, Midwest Brazil

本综述系统阐述了巴西马托格罗索州公共卫生中央实验室（LACEN-MT）建立的SARS-CoV-2基因组监测平台成果。通过详尽的系统发育分析，研究揭示了该州新冠疫情由境外输入新型毒株引发的流行波次特征，强调实时监测病毒变异对指导公共卫生干预的关键价值，为优化区域疫情防控策略提供重要科学依据。

　　

Highlight

伦理声明

本研究的所有伦理方面均遵循国家卫生委员会（CNS）第466/2012号决议，项目已获马托格罗索州立大学伦理委员会批准（报告号：CAAE: 65072322.3.0000.5166）。

研究区域

基于马托格罗索州卫生宏观区域各市镇送往LACEN-MT的样本开展基因组监测研究，样本采集受州级卫生保健协调管理决议约束。

结果

本研究共分析了马托格罗索州2021年10月21日至2023年3月31日期间采集的1194个SARS-CoV-2基因组序列（图1A）。其中650个样本由马托格罗索州公共卫生中央实验室（LACEN-MT）完成测序处理并纳入分析（图1B）。测序范围覆盖该州141个市镇中的82个，展现出广泛的区域采样覆盖度。

讨论

马托格罗索州公共卫生中央实验室（LACEN-MT）开展的基因组监测工作，为深入理解SARS-CoV-2在州内的传播与进化轨迹提供了关键视角。该监测体系的建立显著提升了本地区实时追踪病毒变异的能效，使新变异株及其传播动态的及时识别成为可能。